RDX |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1GC6, 1GC7, 1J19, 2D10, 2D11, 2D2Q, 2EMS, 2EMT, 2YVC, 2ZPY | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | RDX, DFNB24, radixin |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 179410 MGI: 97887 HomoloGene: 37707 GeneCards: RDX |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
autosomal recessive nonsyndromic deafness 24, nonsyndromic deafness[1] |
|
Реагує на сполуку |
---|
Viroporin 3a[2] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein homodimerization activity • protein domain specific binding • ATPase binding • protein kinase A binding • cytoskeletal protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • actin binding • RNA binding • cadherin binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • мембрана • focal adhesion • Філоподія • ruffle • myelin sheath • клітинна мембрана • apical part of cell • stereocilium • Мікроворсинки • apical plasma membrane • cortical actin cytoskeleton • Борозна розщеплення • екзосома • цитоскелет • cell periphery • lamellipodium • midbody • T-tubule • cell tip • міжклітинний простір • cell projection |
---|
Біологічний процес | • regulation of cell size • establishment of endothelial barrier • microvillus assembly • regulation of organelle assembly • establishment of protein localization • positive regulation of cell migration • GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity • positive regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle • negative regulation of homotypic cell-cell adhesion • regulation of actin filament bundle assembly • GO:1901313 positive regulation of gene expression • GO:0034259 negative regulation of GTPase activity • negative regulation of adherens junction organization • apical protein localization • actin filament capping • cellular response to thyroid hormone stimulus • regulation of cell shape • protein kinase A signaling • regulation of ruffle assembly • positive regulation of protein localization to early endosome • positive regulation of early endosome to late endosome transport • negative regulation of cell size • regulation of Rap protein signal transduction • cellular response to platelet-derived growth factor stimulus • barbed-end actin filament capping • protein localization to plasma membrane |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_002906 NM_001260492 NM_001260493 NM_001260494 NM_001260495
| NM_001260496 |
| | NM_001104616 NM_001104617 NM_009041 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001247421 NP_001247422 NP_001247423 NP_001247424 NP_001247425
| NP_002897 |
| | NP_001098086 NP_001098087 NP_033067 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 109.86 – 110.3 Mb | Хр. 9: 51.96 – 52.01 Mb |
---|
PubMed search | [3] | [4] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
RDX (англ. Radixin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 583 амінокислот, а молекулярна маса — 68 564[6].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPKPINVRVT | | TMDAELEFAI | | QPNTTGKQLF | | DQVVKTVGLR | | EVWFFGLQYV |
DSKGYSTWLK | | LNKKVTQQDV | | KKENPLQFKF | | RAKFFPEDVS | | EELIQEITQR |
LFFLQVKEAI | | LNDEIYCPPE | | TAVLLASYAV | | QAKYGDYNKE | | IHKPGYLAND |
RLLPQRVLEQ | | HKLTKEQWEE | | RIQNWHEEHR | | GMLREDSMME | | YLKIAQDLEM |
YGVNYFEIKN | | KKGTELWLGV | | DALGLNIYEH | | DDKLTPKIGF | | PWSEIRNISF |
NDKKFVIKPI | | DKKAPDFVFY | | APRLRINKRI | | LALCMGNHEL | | YMRRRKPDTI |
EVQQMKAQAR | | EEKHQKQLER | | AQLENEKKKR | | EIAEKEKERI | | EREKEELMER |
LKQIEEQTIK | | AQKELEEQTR | | KALELDQERK | | RAKEEAERLE | | KERRAAEEAK |
SAIAKQAADQ | | MKNQEQLAAE | | LAEFTAKIAL | | LEEAKKKKEE | | EATEWQHKAF |
AAQEDLEKTK | | EELKTVMSAP | | PPPPPPPVIP | | PTENEHDEHD | | ENNAEASAEL |
SNEGVMNHRS | | EEERVTETQK | | NERVKKQLQA | | LSSELAQARD | | ETKKTQNDVL |
HAENVKAGRD | | KYKTLRQIRQ | | GNTKQRIDEF | | EAM |
Кодований геном білок за функціями належить до кепінгів актину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані.
Література
- Wilgenbus K.K., Milatovich A., Francke U., Furthmayr H. (1993). Molecular cloning, cDNA sequence, and chromosomal assignment of the human radixin gene and two dispersed pseudogenes. Genomics. 16: 199—206. PMID 8486357 DOI:10.1006/geno.1993.1159
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з RDX переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Radixin переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9944 (англ.) . Архів оригіналу за 5 квітня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P35241 (англ.) . Архів оригіналу за 9 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |