RBMS1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1X5O

Ідентифікатори

Символи

RBMS1, C2orf12, HCC-4, MSSP, MSSP-1, MSSP-2, MSSP-3, SCR2, YC1, RNA binding motif single stranded interacting protein 1

Зовнішні ІД

OMIM: 602310 MGI: 1861774 HomoloGene: 9640 GeneCards: RBMS1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• single-stranded DNA binding • DNA binding • double-stranded DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding • mRNA 3'-UTR binding • poly(A) binding • poly(U) RNA binding
Клітинна компонента	• клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма • Рибонуклеопротеїни
Біологічний процес	• реплікація ДНК • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5937


56878

Ensembl


ENSG00000153250


ENSMUSG00000026970

UniProt


P29558


Q91W59

RefSeq (мРНК)


NM_002897 NM_016836 NM_016839


NM_001141931 NM_001141932 NM_020296

RefSeq (білок)


NP_002888 NP_058520


NP_001135403 NP_001135404 NP_064692

Локус (UCSC)

Хр. 2: 160.27 – 160.49 Mb

Хр. 2: 60.58 – 60.79 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RBMS1 (англ. RNA binding motif single stranded interacting protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 406 амінокислот, а молекулярна маса — 44 505^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGKVWKQQMY	PQYATYYYPQ	YLQAKQSLVP	AHPMAPPSPS	TTSSNNNSSS
SSNSGWDQLS	KTNLYIRGLP	PHTTDQDLVK	LCQPYGKIVS	TKAILDKTTN
KCKGYGFVDF	DSPAAAQKAV	SALKASGVQA	QMAKQQEQDP	TNLYISNLPL
SMDEQELENM	LKPFGQVIST	RILRDSSGTS	RGVGFARMES	TEKCEAVIGH
FNGKFIKTPP	GVSAPTEPLL	CKFADGGQKK	RQNPNKYIPN	GRPWHREGEV
RLAGMTLTYD	PTTAAIQNGF	YPSPYSIATN	RMITQTSITP	YIASPVSAYQ
VQSPSWMQPQ	PYILQHPGAV	LTPSMEHTMS	LQPASMISPL	AQQMSHLSLG
STGTYMPATS	AMQGAYLPQY	AHMQTTAVPV	EEASGQQQVA	VETSNDHSPY
TFQPNK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як реплікація ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

Kanaoka Y., Nojima H. (1994). SCR: novel human suppressors of cdc2/cdc13 mutants of Schizosaccharomyces pombe harbour motifs for RNA binding proteins. Nucleic Acids Res. 22: 2687—2693. PMID 8041632 DOI:10.1093/nar/22.13.2687
Takai T., Nishita Y., Iguchi-Ariga S.M.M., Ariga H. (1994). Molecular cloning of MSSP-2, a c-myc gene single-strand binding protein: characterization of binding specificity and DNA replication activity. Nucleic Acids Res. 22: 5576—5581. PMID 7838710 DOI:10.1093/nar/22.25.5576
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9907 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, P29558 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.