RBM5

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2LK0, 2LK1, 2LKZ

Ідентифікатори

Символи

RBM5, G15, LUCA15, RMB5, H37, RNA binding motif protein 5, LUCA-15

Зовнішні ІД

OMIM: 606884 MGI: 1933204 HomoloGene: 21177 GeneCards: RBM5

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • mRNA binding • RNA binding
Клітинна компонента	• нуклеоплазма • spliceosomal complex • клітинне ядро
Біологічний процес	• regulation of apoptotic process • mRNA splicing, via spliceosome • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • mRNA processing • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • spliceosomal complex assembly • positive regulation of apoptotic process • negative regulation of cell population proliferation • GO:0097285 апоптоз • Сплайсинг РНК
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10181


83486

Ensembl


ENSG00000003756


ENSMUSG00000032580

UniProt


P52756


Q91YE7

RefSeq (мРНК)


NM_005778


NM_148930 NM_001359524 NM_001359525 NM_001359526

RefSeq (білок)


NP_005769


NP_683732 NP_001346453 NP_001346454 NP_001346455

Локус (UCSC)

Хр. 3: 50.09 – 50.12 Mb

Хр. 9: 107.62 – 107.65 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RBM5 (англ. RNA binding motif protein 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 815 амінокислот, а молекулярна маса — 92 154^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGSDKRVSRT	ERSGRYGSII	DRDDRDERES	RSRRRDSDYK	RSSDDRRGDR
YDDYRDYDSP	ERERERRNSD	RSEDGYHSDG	DYGEHDYRHD	ISDERESKTI
MLRGLPITIT	ESDIREMMES	FEGPQPADVR	LMKRKTGVSR	GFAFVEFYHL
QDATSWMEAN	QKKLVIQGKH	IAMHYSNPRP	KFEDWLCNKC	CLNNFRKRLK
CFRCGADKFD	SEQEVPPGTT	ESVQSVDYYC	DTIILRNIAP	HTVVDSIMTA
LSPYASLAVN	NIRLIKDKQT	QQNRGFAFVQ	LSSAMDASQL	LQILQSLHPP
LKIDGKTIGV	DFAKSARKDL	VLSDGNRVSA	FSVASTAIAA	AQWSSTQSQS
GEGGSVDYSY	LQPGQDGYAQ	YAQYSQDYQQ	FYQQQAGGLE	SDASSASGTA
VTTTSAAVVS	QSPQLYNQTS	NPPGSPTEEA	QPSTSTSTQA	PAASPTGVVP
GTKYAVPDTS	TYQYDESSGY	YYDPTTGLYY	DPNSQYYYNS	LTQQYLYWDG
EKETYVPAAE	SSSHQQSGLP	PAKEGKEKKE	KPKSKTAQQI	AKDMERWAKS
LNKQKENFKN	SFQPVNSLRE	EERRESAAAD	AGFALFEKKG	ALAERQQLIP
ELVRNGDEEN	PLKRGLVAAY	SGDSDNEEEL	VERLESEEEK	LADWKKMACL
LCRRQFPNKD	ALVRHQQLSD	LHKQNMDIYR	RSRLSEQELE	ALELREREMK
YRDRAAERRE	KYGIPEPPEP	KRKKQFDAGT	VNYEQPTKDG	IDHSNIGNKM
LQAMGWREGS	GLGRKCQGIT	APIEAQVRLK	GAGLGAKGSA	YGLSGADSYK
DAVRKAMFAR	FTEME

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

Oh J.J., Grosshans D.R., Wong S.G., Slamon D.J. (1999). Identification of differentially expressed genes associated with HER-2/neu overexpression in human breast cancer cells. Nucleic Acids Res. 27: 4008—4017. PMID 10497265 DOI:10.1093/nar/27.20.4008
Mourtada-Maarabouni M., Sutherland L.C., Williams G.T. (2002). Candidate tumour suppressor LUCA-15 can regulate multiple apoptotic pathways. Apoptosis. 7: 421—432. PMID 12207175 DOI:10.1023/A:1020083008017
Mourtada-Maarabouni M., Sutherland L.C., Meredith J.M., Williams G.T. (2003). Simultaneous acceleration of the cell cycle and suppression of apoptosis by splice variant delta-6 of the candidate tumour suppressor LUCA-15/RBM5. Genes Cells. 8: 109—119. PMID 12581154 DOI:10.1046/j.1365-2443.2003.00619.x
Rintala-Maki N.D., Sutherland L.C. (2004). LUCA-15/RBM5, a putative tumour suppressor, enhances multiple receptor-initiated death signals. Apoptosis. 9: 475—484. PMID 15192330 DOI:10.1023/B:APPT.0000031455.79352.57

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9902 (англ.) . Архів оригіналу за 16 липня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, P52756 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.