RBM22 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | RBM22, Cwc2, ZC3H16, fSAP47, RNA binding motif protein 22 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 612430 MGI: 1914060 HomoloGene: 69245 GeneCards: RBM22 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • зв'язування з іоном металу • calcium-dependent protein binding • nucleic acid binding • pre-mRNA binding • U6 snRNA binding • GO:0005487 structural constituent of nuclear pore • RNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • catalytic step 2 spliceosome • U2-type catalytic step 1 spliceosome • U2-type catalytic step 2 spliceosome • Prp19 complex • spliceosomal complex • клітинне ядро • нуклеоплазма |
---|
Біологічний процес | • positive regulation of intracellular protein transport • mRNA processing • spliceosomal snRNP assembly • Сплайсинг РНК • mRNA cis splicing, via spliceosome • positive regulation of RNA splicing • mRNA splicing, via spliceosome • GO:0015915 транспорт • positive regulation of protein import into nucleus • positive regulation of protein export from nucleus |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 150.69 – 150.7 Mb | Хр. 18: 60.69 – 60.71 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
RBM22 (англ. RNA binding motif protein 22) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 420 амінокислот, а молекулярна маса — 46 896[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MATSLGSNTY | | NRQNWEDADF | | PILCQTCLGE | | NPYIRMTKEK | | YGKECKICAR |
PFTVFRWCPG | | VRMRFKKTEV | | CQTCSKLKNV | | CQTCLLDLEY | | GLPIQVRDAG |
LSFKDDMPKS | | DVNKEYYTQN | | MEREISNSDG | | TRPVGMLGKA | | TSTSDMLLKL |
ARTTPYYKRN | | RPHICSFWVK | | GECKRGEECP | | YRHEKPTDPD | | DPLADQNIKD |
RYYGINDPVA | | DKLLKRASTM | | PRLDPPEDKT | | ITTLYVGGLG | | DTITETDLRN |
HFYQFGEIRT | | ITVVQRQQCA | | FIQFATRQAA | | EVAAEKSFNK | | LIVNGRRLNV |
KWGRSQAARG | | KEKEKDGTTD | | SGIKLEPVPG | | LPGALPPPPA | | AEEEASANYF |
NLPPSGPPAV | | VNIALPPPPG | | IAPPPPPGFG | | PHMFHPMGPP | | PPFMRAPGPI |
HYPSQDPQRM | | GAHAGKHSSP |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, транспорт, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Loftus S.K., Dixon J., Koprivnikar K., Dixon M.J., Wasmuth J.J. (1996). Transcriptional map of the Treacher Collins candidate gene region. Genome Res. 6: 26—34. PMID 8681136 DOI:10.1101/gr.6.1.26
- Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
- Krebs J. (2009). The influence of calcium signaling on the regulation of alternative splicing. Biochim. Biophys. Acta. 1793: 979—984. PMID 19133299 DOI:10.1016/j.bbamcr.2008.12.006
- Janowicz A., Michalak M., Krebs J. (2011). Stress induced subcellular distribution of ALG-2, RBM22 and hSlu7. Biochim. Biophys. Acta. 1813: 1045—1049. PMID 21122810 DOI:10.1016/j.bbamcr.2010.11.010
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25503 (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2015. Процитовано 5 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9NW64 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |