RAPGEF5 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | RAPGEF5, GFR, MR-GEF, REPAC, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, MRGEF |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 609527 MGI: 2444365 HomoloGene: 56563 GeneCards: RAPGEF5 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GTP-dependent protein binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерні тільця |
---|
Біологічний процес | • small GTPase mediated signal transduction • нейробіологія розвитку |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_012294 NM_001367600 NM_001367601 NM_001367602 NM_001367603 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_036426 NP_001354529 NP_001354530 NP_001354531 NP_001354532 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 7: 22.12 – 22.36 Mb | Хр. 12: 117.48 – 117.72 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
RAPGEF5 (англ. Rap guanine nucleotide exchange factor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 580 амінокислот, а молекулярна маса — 67 733[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGSSRLRVFD | | PHLERKDSAA | | ALSDRELPLP | | TFDVPYFKYI | | DEEDEDDEWS |
SRSQSSTEDD | | SVDSLLSDRY | | VVVSGTPEKI | | LEHLLNDLHL | | EEVQDKETET |
LLDDFLLTYT | | VFMTTDDLCQ | | ALLRHYSAKK | | YQGKEENSDV | | PRRKRKVLHL |
VSQWIALYKD | | WLPEDEHSKM | | FLKTIYRNVL | | DDVYEYPILE | | KELKEFQKIL |
GMHRRHTVDE | | YSPQKKNKAL | | FHQFSLKENW | | LQHRGTVTET | | EEIFCHVYIT |
EHSYVSVKAK | | VSSIAQEILK | | VVAEKIQYAE | | EDLALVAITF | | SGEKHELQPN |
DLVISKSLEA | | SGRIYVYRKD | | LADTLNPFAE | | NEESQQRSMR | | ILGMNTWDLA |
LELMNFDWSL | | FNSIHEQELI | | YFTFSRQGSG | | EHTANLSLLL | | QRCNEVQLWV |
ATEILLCSQL | | GKRVQLVKKF | | IKIAAHCKAQ | | RNLNSFFAIV | | MGLNTASVSR |
LSQTWEKIPG | | KFKKLFSELE | | SLTDPSLNHK | | AYRDAFKKMK | | PPKIPFMPLL |
LKDVTFIHEG | | NKTFLDNLVN | | FEKLHMIADT | | VRTLRHCRTN | | QFGDLSPKEH |
QELKSYVNHL | | YVIDSQQALF | | ELSHRIEPRV |
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Ichiba T., Hoshi Y., Eto Y., Tajima N., Kuraishi Y. (1999). Characterization of GFR, a novel guanine nucleotide exchange factor for Rap1. FEBS Lett. 457: 85—89. PMID 10486569 DOI:10.1016/S0014-5793(99)01012-1
- Rebhun J.F., Castro A.F., Quilliam L.A. (2000). Identification of guanine nucleotide exchange factors (GEFs) for the Rap1 GTPase. Regulation of MR-GEF by M-Ras-GTP interaction. J. Biol. Chem. 275: 34901—34908. PMID 10934204 DOI:10.1074/jbc.M005327200
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16862 (англ.) . Архів оригіналу за 13 березня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q92565 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |