RAP1B

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3BRW, 3CF6, 4DXA, 4HDO, 4HDQ, 4M8N, 4MGI, 4MGK, 4MGY, 4MGZ, 4MH0

Ідентифікатори

Символи

RAP1B, K-REV, RAL1B, member of RAS oncogene family

Зовнішні ІД

OMIM: 179530 MGI: 894315 HomoloGene: 68719 GeneCards: RAP1B

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • GDP binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • GTP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0006184 GTPase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • cell-cell junction • клітинна мембрана • lipid droplet • внутрішньоклітинний • міжклітинні контакти • membrane raft • екзосома • azurophil granule membrane
Біологічний процес	• establishment of endothelial barrier • microvillus assembly • regulation of cell junction assembly • Rap protein signal transduction • regulation of establishment of cell polarity • cellular response to cAMP • GO:0072468 сигнальна трансдукція • neutrophil degranulation • interleukin-12-mediated signaling pathway • small GTPase mediated signal transduction • проліферація • response to carbohydrate • negative regulation of calcium ion-dependent exocytosis • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • cellular response to gonadotropin-releasing hormone • negative regulation of synaptic vesicle exocytosis
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5908


215449

Ensembl


ENSG00000127314


ENSMUSG00000052681

UniProt


P61224


Q99JI6

RefSeq (мРНК)

NM_015646 NM_001010942 NM_001251917 NM_001251918 NM_001251921
NM_001251922


NM_024457

RefSeq (білок)

NP_001010942 NP_001238846 NP_001238847 NP_001238850 NP_001238851
NP_056461 NP_001010942.1 NP_056461.1


NP_077777

Локус (UCSC)

Хр. 12: 68.61 – 68.67 Mb

Хр. 10: 117.65 – 117.68 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RAP1B (англ. RAP1B, member of RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 184 амінокислот, а молекулярна маса — 20 825^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MREYKLVVLG	SGGVGKSALT	VQFVQGIFVE	KYDPTIEDSY	RKQVEVDAQQ
CMLEILDTAG	TEQFTAMRDL	YMKNGQGFAL	VYSITAQSTF	NDLQDLREQI
LRVKDTDDVP	MILVGNKCDL	EDERVVGKEQ	GQNLARQWNN	CAFLESSAKS
KINVNEIFYD	LVRQINRKTP	VPGKARKKSS	CQLL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах.

Література

Pizon V., Lerosey I., Chardin P., Tavitian A. (1988). Nucleotide sequence of a human cDNA encoding a ras-related protein (rap1B). Nucleic Acids Res. 16: 7719—7719. PMID 3137530 DOI:10.1093/nar/16.15.7719
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Siess W., Winegar D.A., Lapetina E.G. (1990). Rap1-B is phosphorylated by protein kinase A in intact human platelets. Biochem. Biophys. Res. Commun. 170: 944—950. PMID 1696481 DOI:10.1016/0006-291X(90)92182-Y
Yang H., Sasaki T., Minoshima S., Shimizu N. (2007). Identification of three novel proteins (SGSM1, 2, 3) which modulate small G protein (RAP and RAB)-mediated signaling pathway. Genomics. 90: 249—260. PMID 17509819 DOI:10.1016/j.ygeno.2007.03.013
Scrima A., Thomas C., Deaconescu D., Wittinghofer A. (2008). The Rap-RapGAP complex: GTP hydrolysis without catalytic glutamine and arginine residues. EMBO J. 27: 1145—1153. PMID 18309292 DOI:10.1038/emboj.2008.30
Bokoch G.M., Parkos C.A., Mumby S.M. (1988). Purification and characterization of the 22,000-dalton GTP-binding protein substrate for ADP-ribosylation by botulinum toxin, G22K. J. Biol. Chem. 263: 16744—16749. PMID 3141412

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9857 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P61224 (англ.) . Архів оригіналу за 16 квітня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.