RAP1A

RAP1A
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1C1Y, 1GUA, 3KUC, 4KVG

Ідентифікатори
Символи RAP1A, C21KG, G-22K, KREV-1, KREV1, RAP1, SMGP21, member of RAS oncogene family
Зовнішні ІД OMIM: 179520 MGI: 97852 HomoloGene: 2162 GeneCards: RAP1A
Онтологія гена
Молекулярна функція

• nucleotide binding
• GO:0032403 protein-containing complex binding
• GTP binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• GO:0006184 GTPase activity
• GDP binding

Клітинна компонента

• гіалоплазма
• ендосома
• мембрана
• myelin sheath
• клітинна мембрана
• guanyl-nucleotide exchange factor complex
• neuron projection
• екзосома
• early endosome
• late endosome
• цитоплазма
• міжклітинні контакти
• perinuclear region of cytoplasm
• specific granule membrane
• phagocytic vesicle
• glutamatergic synapse

Біологічний процес

• establishment of endothelial barrier
• positive regulation of glucose import
• microvillus assembly
• regulation of cell junction assembly
• regulation of insulin secretion
• small GTPase mediated signal transduction
• Rap protein signal transduction
• GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound
• нейробіологія розвитку
• negative regulation of synaptic vesicle exocytosis
• liver regeneration
• protein transport
• response to antineoplastic agent
• response to carbohydrate
• negative regulation of collagen biosynthetic process
• cellular response to glucose stimulus
• GO:0072468 сигнальна трансдукція
• cellular response to nerve growth factor stimulus
• nerve growth factor signaling pathway
• positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade
• positive regulation of protein kinase activity
• positive regulation of vasculogenesis
• GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity
• cellular response to cAMP
• positive regulation of neuron projection development
• neutrophil degranulation
• positive regulation of Fc-gamma receptor signaling pathway involved in phagocytosis
• regulation of neurotransmitter receptor localization to postsynaptic specialization membrane
• protein localization to plasma membrane

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
5906
109905
Ensembl
ENSG00000116473
ENSMUSG00000068798
UniProt
P62834
P62835
RefSeq (мРНК)
NM_001010935
NM_001291896
NM_002884
NM_001370216
NM_001370217
NM_001394066
NM_145541
RefSeq (білок)
NP_001010935
NP_001278825
NP_002875
NP_001357145
NP_001357146
NP_663516
Локус (UCSC) Хр. 1: 111.54 – 111.72 Mb Хр. 3: 105.63 – 105.71 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

RAP1A (англ. RAP1A, member of RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 184 амінокислот, а молекулярна маса — 20 987[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MREYKLVVLGSGGVGKSALTVQFVQGIFVEKYDPTIEDSYRKQVEVDCQQ
CMLEILDTAGTEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQSTFNDLQDLREQI
LRVKDTEDVPMILVGNKCDLEDERVVGKEQGQNLARQWCNCAFLESSAKS
KINVNEIFYDLVRQINRKTPVEKKKPKKKSCLLL

Задіяний у такому біологічному процесі як нейрогенез. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, ендосомах.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Beraud-Dufour S., Gautier R., Albiges-Rizo C., Chardin P., Faurobert E. (2007). Krit 1 interactions with microtubules and membranes are regulated by Rap1 and integrin cytoplasmic domain associated protein-1. FEBS J. 274: 5518—5532. PMID 17916086 DOI:10.1111/j.1742-4658.2007.06068.x
  • Yang H., Sasaki T., Minoshima S., Shimizu N. (2007). Identification of three novel proteins (SGSM1, 2, 3) which modulate small G protein (RAP and RAB)-mediated signaling pathway. Genomics. 90: 249—260. PMID 17509819 DOI:10.1016/j.ygeno.2007.03.013
  • Pizon V., Chardin P., Lerosey I., Olofsson B., Tavitian A. (1988). Human cDNAs rap1 and rap2 homologous to the Drosophila gene Dras3 encode proteins closely related to ras in the 'effector' region. Oncogene. 3: 201—204. PMID 3045729
  • Bokoch G.M., Parkos C.A., Mumby S.M. (1988). Purification and characterization of the 22,000-dalton GTP-binding protein substrate for ADP-ribosylation by botulinum toxin, G22K. J. Biol. Chem. 263: 16744—16749. PMID 3141412

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9855 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
  4. ↑ UniProt, P62834 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 1

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.


Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.