RAD51D |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | RAD51D, BROVCA4, R51H3, RAD51L3, TRAD, RAD51 paralog D |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602954 MGI: 1261809 HomoloGene: 2156 GeneCards: RAD51D |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
рак яєчника, hereditary breast ovarian cancer[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • nucleotide binding • ATP-dependent activity, acting on DNA • DNA strand exchange activity • single-stranded DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • four-way junction DNA binding • gamma-tubulin binding • double-stranded DNA binding • endodeoxyribonuclease activity • ATP binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • центросома • replication fork • хромосома • центр організації мікротрубочок • теломера • Rad51B-Rad51C-Rad51D-XRCC2 complex • цитоскелет • клітинне ядро • нуклеоплазма |
---|
Біологічний процес | • strand invasion • response to ionizing radiation • nucleotide-excision repair • reciprocal meiotic recombination • DNA recombination • interstrand cross-link repair • GO:0051312, GO:0007083 chromosome organization • regulation of cell cycle • cellular response to DNA damage stimulus • mitotic recombination • telomere maintenance • GO:0100026 Репарація ДНК • meiotic DNA recombinase assembly • double-strand break repair via homologous recombination |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001142571 NM_002878 NM_133627 NM_133628 NM_133629
| NM_133630 |
| | NM_001277938 NM_001277939 NM_001277941 NM_001277942 NM_011235 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001136043 NP_002869 NP_598332 |
| | NP_001264867 NP_001264868 NP_001264870 NP_001264871 NP_035365 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 35.09 – 35.12 Mb | Хр. 11: 82.77 – 82.78 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
RAD51D (англ. RAD51 paralog D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 328 амінокислот, а молекулярна маса — 35 049[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGVLRVGLCP | | GLTEEMIQLL | | RSHRIKTVVD | | LVSADLEEVA | | QKCGLSYKAL |
VALRRVLLAQ | | FSAFPVNGAD | | LYEELKTSTA | | ILSTGIGSLD | | KLLDAGLYTG |
EVTEIVGGPG | | SGKTQVCLCM | | AANVAHGLQQ | | NVLYVDSNGG | | LTASRLLQLL |
QAKTQDEEEQ | | AEALRRIQVV | | HAFDIFQMLD | | VLQELRGTVA | | QQVTGSSGTV |
KVVVVDSVTA | | VVSPLLGGQQ | | REGLALMMQL | | ARELKTLARD | | LGMAVVVTNH |
ITRDRDSGRL | | KPALGRSWSF | | VPSTRILLDT | | IEGAGASGGR | | RMACLAKSSR |
QPTGFQEMVD | | IGTWGTSEQS | | ATLQGDQT |
Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, хромосомах.
Література
- Cartwright R., Dunn A.M., Simpson P.J., Tambini C.E., Thacker J. (1998). Isolation of novel human and mouse genes of the recA/RAD51 recombination-repair gene family. Nucleic Acids Res. 26: 1653—1659. PMID 9512535 DOI:10.1093/nar/26.7.1653
- Pittman D.L., Weinberg L.R., Schimenti J.C. (1998). Identification, characterization, and genetic mapping of Rad51d, a new mouse and human RAD51/RecA-related gene. Genomics. 49: 103—111. PMID 9570954 DOI:10.1006/geno.1998.5226
- Kawabata M., Saeki K. (1999). Multiple alternative transcripts of the human homologue of the mouse TRAD/R51H3/RAD51D gene, a member of the recA/RAD51 gene family. Biochem. Biophys. Res. Commun. 257: 156—162. PMID 10092526 DOI:10.1006/bbrc.1999.0413
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Braybrooke J.P., Spink K.G., Thacker J., Hickson I.D. (2000). The RAD51 family member, RAD51L3, is a DNA-stimulated ATPase that forms a complex with XRCC2. J. Biol. Chem. 275: 29100—29106. PMID 10871607 DOI:10.1074/jbc.M002075200
- Liu N., Schild D., Thelen M.P., Thompson L.H. (2002). Involvement of Rad51C in two distinct protein complexes of Rad51 paralogs in human cells. Nucleic Acids Res. 30: 1009—1015. PMID 11842113 DOI:10.1093/nar/30.4.1009
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з RAD51D переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9823 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, O75771 (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |