RABIF : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

RABIF

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1FWQ, 2FU5

Ідентифікатори

Символи

RABIF, MSS4, RASGFR3, RASGRF3, RAB interacting factor

Зовнішні ІД

OMIM: 603417 MGI: 2138605 HomoloGene: 37702 GeneCards: RABIF

Онтологія гена
Молекулярна функція	• zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • guanyl-nucleotide exchange factor activity
Клітинна компонента	• гіалоплазма • мембрана
Біологічний процес	• protein transport • small GTPase mediated signal transduction • membrane fusion • post-Golgi vesicle-mediated transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5877


98710

Ensembl


ENSG00000183155


ENSMUSG00000042229

UniProt


P47224


Q91X96

RefSeq (мРНК)


NM_002871


NM_145510

RefSeq (білок)


NP_002862


NP_663485

Локус (UCSC)

Хр. 1: 202.88 – 202.89 Mb

Хр. 1: 134.42 – 134.44 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RABIF (англ. RAB interacting factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 123 амінокислот, а молекулярна маса — 13 839^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEPAEQPSEL	VSAEGRNRKA	VLCQRCGSRV	LQPGTALFSR	RQLFLPSMRK
KPALSDGSNP	DGDLLQEHWL	VEDMFIFENV	GFTKDVGNIK	FLVCADCEIG
PIGWHCLDDK	NSFYVALERV	SHE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

Yu H., Schreiber S.L. (1995). Cloning, Zn2+ binding, and structural characterization of the guanine nucleotide exchange factor human Mss4. Biochemistry. 34: 9103—9110. PMID 7619808 DOI:10.1021/bi00028a020
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Yu H., Schreiber S.L. (1995). Structure of guanine-nucleotide-exchange factor human Mss4 and identification of its Rab-interacting surface. Nature. 376: 788—791. PMID 7651540 DOI:10.1038/376788a0
Itzen A., Pylypenko O., Goody R.S., Alexandrov K., Rak A. (2006). Nucleotide exchange via local protein unfolding--structure of Rab8 in complex with MSS4. EMBO J. 25: 1445—1455. PMID 16541104 DOI:10.1038/sj.emboj.7601044

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9797 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2015. Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, P47224 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.