RAB3IP

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4LHX, 4LHY, 4LHZ, 4UJ3, 4UJ4, 4UJ5

Ідентифікатори

Символи

RAB3IP, RABIN3, RABIN8, RAB3A interacting protein

Зовнішні ІД

OMIM: 608686 MGI: 105933 HomoloGene: 32340 GeneCards: RAB3IP

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity • identical protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • ciliary basal body • гіалоплазма • центросома • cell projection • цитоскелет • lamellipodium • клітинне ядро
Біологічний процес	• protein localization to organelle • protein transport • Golgi to plasma membrane transport • protein targeting to membrane • cilium assembly • ciliary basal body-plasma membrane docking
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


117177


216363

Ensembl


ENSG00000127328


ENSMUSG00000064181

UniProt


Q96QF0


Q68EF0

RefSeq (мРНК)

NM_001024647 NM_001278402 NM_022456 NM_175623 NM_175624
NM_175625 NM_175626 NM_175627


NM_001003950 NM_001359645

RefSeq (білок)

NP_001019818 NP_001265331 NP_071901 NP_783322 NP_783323
NP_783324


NP_001003950 NP_001346574

Локус (UCSC)

Хр. 12: 69.74 – 69.82 Mb

Хр. 10: 116.74 – 116.79 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RAB3IP (англ. RAB3A interacting protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 476 амінокислот, а молекулярна маса — 53 021^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGLKKMKGLS	YDEAFAMAND	PLEGFHEVNL	ASPTSPDLLG	VYESGTQEQT
TSPSVIYRPH	PSALSSVPIQ	ANALDVSELP	TQPVYSSPRR	LNCAEISSIS
FHVTDPAPCS	TSGVTAGLTK	LTTRKDNYNA	EREFLQGATI	TEACDGSDDI
FGLSTDSLSR	LRSPSVLEVR	EKGYERLKEE	LAKAQRELKL	KDEECERLSK
VRDQLGQELE	ELTASLFEEA	HKMVREANIK	QATAEKQLKE	AQGKIDVLQA
EVAALKTLVL	SSSPTSPTQE	PLPGGKTPFK	KGHTRNKSTS	SAMSGSHQDL
SVIQPIVKDC	KEADLSLYNE	FRLWKDEPTM	DRTCPFLDKI	YQEDIFPCLT
FSKSELASAV	LEAVENNTLS	IEPVGLQPIR	FVKASAVECG	GPKKCALTGQ
SKSCKHRIKL	GDSSNYYYIS	PFCRYRITSV	CNFFTYIRYI	QQGLVKQQDV
DQMFWEVMQL	RKEMSLAKLG	YFKEEL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, клітинних відростках.

Література

Hattula K., Furuhjelm J., Arffman A., Peranen J. (2002). A Rab8-specific GDP/GTP exchange factor is involved in actin remodeling and polarized membrane transport. Mol. Biol. Cell. 13: 3268—3280. PMID 12221131 DOI:10.1091/mbc.E02-03-0143
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Yoshimura S., Gerondopoulos A., Linford A., Rigden D.J., Barr F.A. (2010). Family-wide characterization of the DENN domain Rab GDP-GTP exchange factors. J. Cell Biol. 191: 367—381. PMID 20937701 DOI:10.1083/jcb.201008051

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16508 (англ.) . Архів оригіналу за 17 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q96QF0 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.