RAB13

Ідентифікатори

Символи

RAB13, GIG4, member RAS oncogene family

Зовнішні ІД

OMIM: 602672 MGI: 1927232 HomoloGene: 113882 GeneCards: RAB13

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • protein kinase A catalytic subunit binding • GTP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0006184 GTPase activity
Клітинна компонента	• recycling endosome • ендосома • комплекс Ґольджі • cell projection • lateral plasma membrane • мембрана • cell-cell junction • bicellular tight junction • insulin-responsive compartment • клітинна мембрана • endocytic vesicle • recycling endosome membrane • trans-Golgi network • neuron projection • екзосома • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • lamellipodium • гіалоплазма • міжклітинні контакти • cytoplasmic vesicle membrane
Біологічний процес	• trans-Golgi network to recycling endosome transport • establishment of Sertoli cell barrier • protein localization to cell leading edge • endosomal transport • bicellular tight junction assembly • endothelial cell chemotaxis • endocytic recycling • cellular response to insulin stimulus • protein kinase A signaling • protein transport • neuron projection development • GO:0033109 cortical actin cytoskeleton organization • посттрансляційна модифікація • GO:0015915 транспорт • protein localization to plasma membrane • intracellular protein transport • Rab protein signal transduction
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5872


68328

Ensembl


ENSG00000143545


ENSMUSG00000027935

UniProt


P51153


Q9DD03

RefSeq (мРНК)


NM_001272038 NM_002870


NM_001293741 NM_026677

RefSeq (білок)


NP_001258967 NP_002861


NP_001280670 NP_080953

Локус (UCSC)

Хр. 1: 153.98 – 153.99 Mb

Хр. 3: 90.12 – 90.13 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RAB13 (англ. RAB13, member RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 203 амінокислот, а молекулярна маса — 22 774^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAKAYDHLFK	LLLIGDSGVG	KTCLIIRFAE	DNFNNTYIST	IGIDFKIRTV
DIEGKKIKLQ	VWDTAGQERF	KTITTAYYRG	AMGIILVYDI	TDEKSFENIQ
NWMKSIKENA	SAGVERLLLG	NKCDMEAKRK	VQKEQADKLA	REHGIRFFET
SAKSSMNVDE	AFSSLARDIL	LKSGGRRSGN	GNKPPSTDLK	TCDKKNTNKC
SLG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі, щільних контактах, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Joberty G., Tavitian A., Zahraoui A. (1993). Isoprenylation of Rab proteins possessing a C-terminal CaaX motif. FEBS Lett. 330: 323—328. PMID 8375503 DOI:10.1016/0014-5793(93)80897-4
Marzesco A.M., Galli T., Louvard D., Zahraoui A. (1998). The rod cGMP phosphodiesterase delta subunit dissociates the small GTPase Rab13 from membranes. J. Biol. Chem. 273: 22340—22345. PMID 9712853 DOI:10.1074/jbc.273.35.22340
Koehler K., Louvard D., Zahraoui A. (2004). Rab13 regulates PKA signaling during tight junction assembly. J. Cell Biol. 165: 175—180. PMID 15096524 DOI:10.1083/jcb.200312118
Terai T., Nishimura N., Kanda I., Yasui N., Sasaki T. (2006). JRAB/MICAL-L2 is a junctional Rab13-binding protein mediating the endocytic recycling of occludin. Mol. Biol. Cell. 17: 2465—2475. PMID 16525024 DOI:10.1091/mbc.E05-09-0826
Nokes R.L., Fields I.C., Collins R.N., Foelsch H. (2008). Rab13 regulates membrane trafficking between TGN and recycling endosomes in polarized epithelial cells. J. Cell Biol. 182: 845—853. PMID 18779367 DOI:10.1083/jcb.200802176

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9762 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2015. Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, P51153 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.