RAB11FIP1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4D0G

Ідентифікатори

Символи

RAB11FIP1, NOEL1A, RCP, rab11-FIP1, RAB11 family interacting protein 1

Зовнішні ІД

OMIM: 608737 MGI: 1923017 HomoloGene: 11853 GeneCards: RAB11FIP1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • recycling endosome • ендосома • phagocytic vesicle membrane • мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • гіалоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела
Біологічний процес	• protein transport • regulated exocytosis • negative regulation of adiponectin secretion
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


80223


75767

Ensembl


ENSG00000156675


ENSMUSG00000031488

UniProt


Q6WKZ4


Q9D620

RefSeq (мРНК)


NM_025151 NM_001002233 NM_001002814


NM_001080813 NM_029423

RefSeq (білок)


NP_001002814 NP_079427


NP_001074282 NP_083699

Локус (UCSC)

Хр. 8: 37.86 – 37.9 Mb

Хр. 8: 27.63 – 27.66 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RAB11FIP1 (англ. RAB11 family interacting protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 283 амінокислот, а молекулярна маса — 137 167^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSLMVSAGRG	LGAVWSPTHV	QVTVLQARGL	RAKGPGGTSD	AYAVIQVGKE
KYATSVSERS	LGAPVWREEA	TFELPSLLSS	GPAAAATLQL	TVLHRALLGL
DKFLGRAEVD	LRDLHRDQGR	RKTQWYKLKS	KPGKKDKERG	EIEVDIQFMR
NNMTASMFDL	SMKDKSRNPF	GKLKDKIKGK	NKDSGSDTAS	AIIPSTTPSV
DSDDESVVKD	KKKKSKIKTL	LSKSNLQKTP	LSQSMSVLPT	SKPEKVLLRP
GDFQSQWDED	DNEDESSSAS	DVMSHKRTAS	TDLKQLNQVN	FTLPKKEGLS
FLGGLRSKND	VLSRSNVCIN	GNHVYLEQPE	AKGEIKDSSP	SSSPSPKGFR
KKHLFSSTEN	LAAGSWKEPA	EGGGLSSDRQ	LSESSTKDSL	KSMTLPSYRP
APLVSGDLRE	NMAPANSEAT	KEAKESKKPE	SRRSSLLSLM	TGKKDVAKGS
EGENPLTVPG	REKEGMLMGV	KPGEDASGPA	EDLVRRSEKD	TAAVVSRQGS
SLNLFEDVQI	TEPEAEPESK	SEPRPPISSP	RAPQTRAVKP	RLEVSPEAQP
TARLPSPTDS	PSSLPPLPSS	SGQASVPSEL	GHGADTQSSE	SPSVFSSLSS
PIAAPISTST	PIESWPLVDR	GQAKSEGPPL	LPKAELQTES	LTPVPNSGSS
ALGSLFKQPS	FPANKGTEDS	LMGRTRETGT	EKNTSSLELE	ESLPEQPETG
RQEEELPRFP	CKKQDYSPSS	GEAQEVPFAL	SLSSDGAVSP	VGELAAGGDR
DLESQAGSLV	ESKARDAAEE	VAPPLPMGAS	VPSIDSMMRK	LEEMGLNLRK
DQKKTKKRVS	FSEQLFTEEA	VAGAALLVEG	HSSCPQELNP	AWSVAGNASD
GEPPESPHAE	DSERESVTTP	GPATCGAPAS	PADHLLLPSQ	EESFSEVPMS
EASSAKDTPL	FRMEGEDALV	TQYQSKASDH	EGLLSDPLSD	LQLVSDFKSP
IMADLNLSLP	SIPEVASDDE	RIDQVEDDGD	QVEDDGETAK	SSTLDIGALS
LGLVVPCPER	GKGPSGEADR	LVLGEGLCDF	RLQAPQASVT	APSEQTTEFG
IHKPHLGKSS	SLDKQLPGPS	GGEEEKPMGN	GSPSPPPGTS	LDNPVPSPSP
SEIFPVTHSF	PSSAHSDTHH	TSTAESQKKA	TAEGSAGRVE	NFGKRKPLLQ
AWVSPSETHP	VSAQPGAGTG	SAKHRLHPVK	PMNAMATKVA	NCSLGTATII
SENLNNEVMM	KKYSPSDPAF	AYAQLTHDEL	IQLVLKQKET	ISKKEFQVRE
LEDYIDNLLV	RVMEETPNIL	RIPTQVGKKA	GKM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, цитоплазматичних везикулах, ендосомах.

Література

Jin M., Goldenring J.R. (2006). The Rab11-FIP1/RCP gene codes for multiple protein transcripts related to the plasma membrane recycling system. Biochim. Biophys. Acta. 1759: 281—295. PMID 16920206 DOI:10.1016/j.bbaexp.2006.06.001
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wallace D.M., Lindsay A.J., Hendrick A.G., McCaffrey M.W. (2002). The novel Rab11-FIP/Rip/RCP family of proteins displays extensive homo- and hetero-interacting abilities. Biochem. Biophys. Res. Commun. 292: 909—915. PMID 11944901 DOI:10.1006/bbrc.2002.6736
Lindsay A.J., McCaffrey M.W. (2004). Characterisation of the Rab binding properties of Rab coupling protein (RCP) by site-directed mutagenesis. FEBS Lett. 571: 86—92. PMID 15280022 DOI:10.1016/j.febslet.2004.06.068

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30265 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q6WKZ4 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.