PTPRO

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2G59, 2GJT

Ідентифікатори

Символи

PTPRO, GLEPP1, NPHS6, PTP-OC, PTP-U2, PTPROT, PTPU2, R-PTP-O, protein tyrosine phosphatase, receptor type O, protein tyrosine phosphatase receptor type O

Зовнішні ІД

OMIM: 600579 MGI: 1097152 HomoloGene: 21564 GeneCards: PTPRO

Онтологія гена
Молекулярна функція	• phosphoprotein phosphatase activity • protein homodimerization activity • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • Wnt-protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein tyrosine phosphatase activity • transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity • hydrolase activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • lateral plasma membrane • мембрана • growth cone • клітинна мембрана • dendritic spine • integral component of plasma membrane • аксон • apical plasma membrane • neuron projection • екзосома • lamellipodium • glutamatergic synapse • GABA-ergic synapse • integral component of postsynaptic density membrane
Біологічний процес	• negative regulation of cell-substrate adhesion • negative regulation of neuron projection development • monocyte chemotaxis • negative regulation of retinal ganglion cell axon guidance • regulation of glomerular filtration • slit diaphragm assembly • GO:0016576 protein dephosphorylation • glomerulus development • axon guidance • GO:0000767 cell morphogenesis • glomerular visceral epithelial cell differentiation • peptidyl-tyrosine dephosphorylation • negative regulation of glomerular filtration • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • lamellipodium assembly • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • GO:1904739 regulation of synapse organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5800


19277

Ensembl


ENSG00000151490


ENSMUSG00000030223

UniProt


Q16827


E9Q612

RefSeq (мРНК)

NM_002848 NM_030667 NM_030668 NM_030669 NM_030670
NM_030671


NM_001164401 NM_001164402 NM_001164403 NM_011216

RefSeq (білок)

NP_002839 NP_109592 NP_109593 NP_109594 NP_109595
NP_109596


NP_001157873 NP_001157874 NP_001157875 NP_035346

Локус (UCSC)

Хр. 12: 15.32 – 15.6 Mb

Хр. 6: 137.23 – 137.44 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PTPRO (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type O) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 216 амінокислот, а молекулярна маса — 138 344^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGHLPTGIHG	ARRLLPLLWL	FVLFKNATAF	HVTVQDDNNI	VVSLEASDVI
SPASVYVVKI	TGESKNYFFE	FEEFNSTLPP	PVIFKASYHG	LYYIITLVVV
NGNVVTKPSR	SITVLTKPLP	VTSVSIYDYK	PSPETGVLFE	IHYPEKYNVF
TRVNISYWEG	KDFRTMLYKD	FFKGKTVFNH	WLPGMCYSNI	TFQLVSEATF
NKSTLVEYSG	VSHEPKQHRT	APYPPQNISV	RIVNLNKNNW	EEQSGNFPEE
SFMRSQDTIG	KEKLFHFTEE	TPEIPSGNIS	SGWPDFNSSD	YETTSQPYWW
DSASAAPESE	DEFVSVLPME	YENNSTLSET	EKSTSGSFSF	FPVQMILTWL
PPKPPTAFDG	FHIHIEREEN	FTEYLMVDEE	AHEFVAELKE	PGKYKLSVTT
FSSSGSCETR	KSQSAKSLSF	YISPSGEWIE	ELTEKPQHVS	VHVLSSTTAL
MSWTSSQENY	NSTIVSVVSL	TCQKQKESQR	LEKQYCTQVN	SSKPIIENLV
PGAQYQVVIY	LRKGPLIGPP	SDPVTFAIVP	TGIKDLMLYP	LGPTAVVLSW
TRPYLGVFRK	YVVEMFYFNP	ATMTSEWTTY	YEIAATVSLT	ASVRIANLLP
AWYYNFRVTM	VTWGDPELSC	CDSSTISFIT	APVAPEITSV	EYFNSLLYIS
WTYGDDTTDL	SHSRMLHWMV	VAEGKKKIKK	SVTRNVMTAI	LSLPPGDIYN
LSVTACTERG	SNTSMLRLVK	LEPAPPKSLF	AVNKTQTSVT	LLWVEEGVAD
FFEVFCQQVG	SSQKTKLQEP	VAVSSHVVTI	SSLLPATAYN	CSVTSFSHDS
PSVPTFIAVS	TMVTEMNPNV	VVISVLAILS	TLLIGLLLVT	LIILRKKHLQ
MARECGAGTF	VNFASLERDG	KLPYNWRRSI	FAFLTLLPSC	LWTDYLLAFY
INPWSKNGLK	KRKLTNPVQL	DDFDAYIKDM	AKDSDYKFSL	QFEELKLIGL
DIPHFAADLP	LNRCKNRYTN	ILPYDFSRVR	LVSMNEEEGA	DYINANYIPG
YNSPQEYIAT	QGPLPETRND	FWKMVLQQKS	QIIVMLTQCN	EKRRVKCDHY
WPFTEEPIAY	GDITVEMISE	EEQDDWACRH	FRINYADEMQ	DVMHFNYTAW
PDHGVPTANA	AESILQFVHM	VRQQATKSKG	PMIIHCSAGV	GRTGTFIALD
RLLQHIRDHE	FVDILGLVSE	MRSYRMSMVQ	TEEQYIFIHQ	CVQLMWMKKK
QQFCISDVIY	ENVSKS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, рецепторів, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

Wiggins R.C., Wiggins J.E., Goyal M., Wharram B.L., Thomas P.E. (1995). Molecular cloning of cDNAs encoding human GLEPP1, a membrane protein tyrosine phosphatase: characterization of the GLEPP1 protein distribution in human kidney and assignment of the GLEPP1 gene to human chromosome 12p12-p13. Genomics. 27: 174—181. PMID 7665166 DOI:10.1006/geno.1995.1021
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Seimiya H., Sawabe T., Inazawa J., Tsuruo T. (1995). Cloning, expression and chromosomal localization of a novel gene for protein tyrosine phosphatase (PTP-U2) induced by various differentiation-inducing agents. Oncogene. 10: 1731—1738. PMID 7753550

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9678 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q16827 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.