PTPRK |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/e7/Protein_PTPRK_PDB_2c7s.png/250px-Protein_PTPRK_PDB_2c7s.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | PTPRK, R-PTP-kappa, protein tyrosine phosphatase, receptor type K, protein tyrosine phosphatase receptor type K |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602545 MGI: 103310 HomoloGene: 55693 GeneCards: PTPRK |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • beta-catenin binding • phosphoprotein phosphatase activity • gamma-catenin binding • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein tyrosine phosphatase activity • transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity • protein kinase binding • hydrolase activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • cell-cell junction • Адгезивні контакти • photoreceptor outer segment • integral component of plasma membrane • cell surface • аксон • neuronal cell body • дендрит (нейробіологія) • leading edge membrane • клітинна мембрана • міжклітинні контакти • внутрішньоклітинна мембранна органела |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of keratinocyte proliferation • cellular response to UV • GO:0016576 protein dephosphorylation • negative regulation of cell cycle • GO:0072353 cellular response to reactive oxygen species • focal adhesion assembly • адгезія клітин • negative regulation of cell migration • protein localization to cell surface • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • neuron projection development • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • cell migration • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of cell population proliferation • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • peptidyl-tyrosine dephosphorylation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/4c/PBB_GE_PTPRK_203038_at_fs.png/250px-PBB_GE_PTPRK_203038_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | ENSG00000152894 ENSG00000273993 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001135648 NM_001291981 NM_001291982 NM_001291983 NM_001291984
| NM_002844 |
| | NM_008983 NM_001359355 NM_001359356 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001129120 NP_001278910 NP_001278911 NP_001278912 NP_001278913
| NP_002835 |
| | NP_033009 NP_001346284 NP_001346285 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 127.97 – 128.52 Mb | Хр. 10: 27.95 – 28.47 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PTPRK (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type K) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 439 амінокислот, а молекулярна маса — 162 102[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDTTAAAALP | | AFVALLLLSP | | WPLLGSAQGQ | | FSAGGCTFDD | | GPGACDYHQD |
LYDDFEWVHV | | SAQEPHYLPP | | EMPQGSYMIV | | DSSDHDPGEK | | ARLQLPTMKE |
NDTHCIDFSY | | LLYSQKGLNP | | GTLNILVRVN | | KGPLANPIWN | | VTGFTGRDWL |
RAELAVSTFW | | PNEYQVIFEA | | EVSGGRSGYI | | AIDDIQVLSY | | PCDKSPHFLR |
LGDVEVNAGQ | | NATFQCIATG | | RDAVHNKLWL | | QRRNGEDIPV | | AQTKNINHRR |
FAASFRLQEV | | TKTDQDLYRC | | VTQSERGSGV | | SNFAQLIVRE | | PPRPIAPPQL |
LGVGPTYLLI | | QLNANSIIGD | | GPIILKEVEY | | RMTSGSWTET | | HAVNAPTYKL |
WHLDPDTEYE | | IRVLLTRPGE | | GGTGLPGPPL | | ITRTKCAEPM | | RTPKTLKIAE |
IQARRIAVDW | | ESLGYNITRC | | HTFNVTICYH | | YFRGHNESKA | | DCLDMDPKAP |
QHVVNHLPPY | | TNVSLKMILT | | NPEGRKESEE | | TIIQTDEDVP | | GPVPVKSLQG |
TSFENKIFLN | | WKEPLDPNGI | | ITQYEISYSS | | IRSFDPAVPV | | AGPPQTVSNL |
WNSTHHVFMH | | LHPGTTYQFF | | IRASTVKGFG | | PATAINVTTN | | ISAPTLPDYE |
GVDASLNETA | | TTITVLLRPA | | QAKGAPISAY | | QIVVEELHPH | | RTKREAGAME |
CYQVPVTYQN | | AMSGGAPYYF | | AAELPPGNLP | | EPAPFTVGDN | | RTYQGFWNPP |
LAPRKGYNIY | | FQAMSSVEKE | | TKTQCVRIAT | | KAATEEPEVI | | PDPAKQTDRV |
VKIAGISAGI | | LVFILLLLVV | | ILIVKKSKLA | | KKRKDAMGNT | | RQEMTHMVNA |
MDRSYADQST | | LHAEDPLSIT | | FMDQHNFSPR | | YENHSATAES | | SRLLDVPRYL |
CEGTESPYQT | | GQLHPAIRVA | | DLLQHINLMK | | TSDSYGFKEE | | YESFFEGQSA |
SWDVAKKDQN | | RAKNRYGNII | | AYDHSRVILQ | | PVEDDPSSDY | | INANYIDGYQ |
RPSHYIATQG | | PVHETVYDFW | | RMIWQEQSAC | | IVMVTNLVEV | | GRVKCYKYWP |
DDTEVYGDFK | | VTCVEMEPLA | | EYVVRTFTLE | | RRGYNEIREV | | KQFHFTGWPD |
HGVPYHATGL | | LSFIRRVKLS | | NPPSAGPIVV | | HCSAGAGRTG | | CYIVIDIMLD |
MAEREGVVDI | | YNCVKALRSR | | RINMVQTEEQ | | YIFIHDAILE | | ACLCGETAIP |
VCEFKAAYFD | | MIRIDSQTNS | | SHLKDEFQTL | | NSVTPRLQAE | | DCSIACLPRN |
HDKNRFMDML | | PPDRCLPFLI | | TIDGESSNYI | | NAALMDSYRQ | | PAAFIVTQYP |
LPNTVKDFWR | | LVYDYGCTSI | | VMLNEVDLSQ | | GCPQYWPEEG | | MLRYGPIQVE |
CMSCSMDCDV | | INRIFRICNL | | TRPQEGYLMV | | QQFQYLGWAS | | HREVPGSKRS |
FLKLILQVEK | | WQEECEEGEG | | RTIIHCLNGG | | GRSGMFCAIG | | IVVEMVKRQN |
VVDVFHAVKT | | LRNSKPNMVE | | APEQYRFCYD | | VALEYLESS |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, рецепторів, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах.
Література
- Fuchs M., Mueller T., Lerch M., Ullrich A. (1996). Association of human protein-tyrosine phosphatase kappa with members of the armadillo family. J. Biol. Chem. 271: 16712—16719. PMID 8663237 DOI:10.1074/jbc.271.28.16712
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9674 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q15262 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |