PTPRK

PTPRK
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2C7S

Ідентифікатори
Символи PTPRK, R-PTP-kappa, protein tyrosine phosphatase, receptor type K, protein tyrosine phosphatase receptor type K
Зовнішні ІД OMIM: 602545 MGI: 103310 HomoloGene: 55693 GeneCards: PTPRK
Онтологія гена
Молекулярна функція

• beta-catenin binding
• phosphoprotein phosphatase activity
• gamma-catenin binding
• GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• protein tyrosine phosphatase activity
• transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity
• protein kinase binding
• hydrolase activity

Клітинна компонента

• integral component of membrane
• мембрана
• cell-cell junction
• Адгезивні контакти
• photoreceptor outer segment
• integral component of plasma membrane
• cell surface
• аксон
• neuronal cell body
• дендрит (нейробіологія)
• leading edge membrane
• клітинна мембрана
• міжклітинні контакти
• внутрішньоклітинна мембранна органела

Біологічний процес

• negative regulation of keratinocyte proliferation
• cellular response to UV
• GO:0016576 protein dephosphorylation
• negative regulation of cell cycle
• GO:0072353 cellular response to reactive oxygen species
• focal adhesion assembly
• адгезія клітин
• negative regulation of cell migration
• protein localization to cell surface
• GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
• neuron projection development
• transforming growth factor beta receptor signaling pathway
• cell migration
• GO:0072468 сигнальна трансдукція
• negative regulation of cell population proliferation
• GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання
• peptidyl-tyrosine dephosphorylation

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
5796
19272
Ensembl
ENSG00000152894
ENSG00000273993
ENSMUSG00000019889
UniProt
Q15262
P35822
RefSeq (мРНК)
NM_001135648
NM_001291981
NM_001291982
NM_001291983
NM_001291984
NM_002844
NM_008983
NM_001359355
NM_001359356
RefSeq (білок)
NP_001129120
NP_001278910
NP_001278911
NP_001278912
NP_001278913
NP_002835
NP_033009
NP_001346284
NP_001346285
Локус (UCSC) Хр. 6: 127.97 – 128.52 Mb Хр. 10: 27.95 – 28.47 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

PTPRK (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type K) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 439 амінокислот, а молекулярна маса — 162 102[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MDTTAAAALPAFVALLLLSPWPLLGSAQGQFSAGGCTFDDGPGACDYHQD
LYDDFEWVHVSAQEPHYLPPEMPQGSYMIVDSSDHDPGEKARLQLPTMKE
NDTHCIDFSYLLYSQKGLNPGTLNILVRVNKGPLANPIWNVTGFTGRDWL
RAELAVSTFWPNEYQVIFEAEVSGGRSGYIAIDDIQVLSYPCDKSPHFLR
LGDVEVNAGQNATFQCIATGRDAVHNKLWLQRRNGEDIPVAQTKNINHRR
FAASFRLQEVTKTDQDLYRCVTQSERGSGVSNFAQLIVREPPRPIAPPQL
LGVGPTYLLIQLNANSIIGDGPIILKEVEYRMTSGSWTETHAVNAPTYKL
WHLDPDTEYEIRVLLTRPGEGGTGLPGPPLITRTKCAEPMRTPKTLKIAE
IQARRIAVDWESLGYNITRCHTFNVTICYHYFRGHNESKADCLDMDPKAP
QHVVNHLPPYTNVSLKMILTNPEGRKESEETIIQTDEDVPGPVPVKSLQG
TSFENKIFLNWKEPLDPNGIITQYEISYSSIRSFDPAVPVAGPPQTVSNL
WNSTHHVFMHLHPGTTYQFFIRASTVKGFGPATAINVTTNISAPTLPDYE
GVDASLNETATTITVLLRPAQAKGAPISAYQIVVEELHPHRTKREAGAME
CYQVPVTYQNAMSGGAPYYFAAELPPGNLPEPAPFTVGDNRTYQGFWNPP
LAPRKGYNIYFQAMSSVEKETKTQCVRIATKAATEEPEVIPDPAKQTDRV
VKIAGISAGILVFILLLLVVILIVKKSKLAKKRKDAMGNTRQEMTHMVNA
MDRSYADQSTLHAEDPLSITFMDQHNFSPRYENHSATAESSRLLDVPRYL
CEGTESPYQTGQLHPAIRVADLLQHINLMKTSDSYGFKEEYESFFEGQSA
SWDVAKKDQNRAKNRYGNIIAYDHSRVILQPVEDDPSSDYINANYIDGYQ
RPSHYIATQGPVHETVYDFWRMIWQEQSACIVMVTNLVEVGRVKCYKYWP
DDTEVYGDFKVTCVEMEPLAEYVVRTFTLERRGYNEIREVKQFHFTGWPD
HGVPYHATGLLSFIRRVKLSNPPSAGPIVVHCSAGAGRTGCYIVIDIMLD
MAEREGVVDIYNCVKALRSRRINMVQTEEQYIFIHDAILEACLCGETAIP
VCEFKAAYFDMIRIDSQTNSSHLKDEFQTLNSVTPRLQAEDCSIACLPRN
HDKNRFMDMLPPDRCLPFLITIDGESSNYINAALMDSYRQPAAFIVTQYP
LPNTVKDFWRLVYDYGCTSIVMLNEVDLSQGCPQYWPEEGMLRYGPIQVE
CMSCSMDCDVINRIFRICNLTRPQEGYLMVQQFQYLGWASHREVPGSKRS
FLKLILQVEKWQEECEEGEGRTIIHCLNGGGRSGMFCAIGIVVEMVKRQN
VVDVFHAVKTLRNSKPNMVEAPEQYRFCYDVALEYLESS

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, рецепторів, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах.

Література

  • Fuchs M., Mueller T., Lerch M., Ullrich A. (1996). Association of human protein-tyrosine phosphatase kappa with members of the armadillo family. J. Biol. Chem. 271: 16712—16719. PMID 8663237 DOI:10.1074/jbc.271.28.16712
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9674 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  4. ↑ UniProt, Q15262 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 6
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.