PTPN18

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2OC3, 4GFU, 4GFV, 4NND

Ідентифікатори

Символи

PTPN18, BDP1, PTP-HSCF, protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 18, protein tyrosine phosphatase non-receptor type 18

Зовнішні ІД

OMIM: 606587 MGI: 108410 HomoloGene: 74971 GeneCards: PTPN18

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • non-membrane spanning protein tyrosine phosphatase activity • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • phosphoprotein phosphatase activity • hydrolase activity • protein tyrosine phosphatase activity
Клітинна компонента	• клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма • нуклеоплазма
Біологічний процес	• GO:0016576 protein dephosphorylation • peptidyl-tyrosine dephosphorylation • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • ERBB2 signaling pathway • negative regulation of ERBB signaling pathway • cellular response to cytokine stimulus • blastocyst formation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


26469


19253

Ensembl


ENSG00000072135


ENSMUSG00000026126

UniProt


Q99952


Q61152

RefSeq (мРНК)


NM_001142370 NM_014369


NM_011206

RefSeq (білок)


NP_001135842 NP_055184


NP_035336

Локус (UCSC)

Хр. 2: 130.36 – 130.38 Mb

Хр. 1: 34.5 – 34.51 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PTPN18 (англ. Protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 18) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 460 амінокислот, а молекулярна маса — 50 482^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSRSLDSARS	FLERLEARGG	REGAVLAGEF	SDIQACSAAW	KADGVCSTVA
GSRPENVRKN	RYKDVLPYDQ	TRVILSLLQE	EGHSDYINGN	FIRGVDGSLA
YIATQGPLPH	TLLDFWRLVW	EFGVKVILMA	CREIENGRKR	CERYWAQEQE
PLQTGLFCIT	LIKEKWLNED	IMLRTLKVTF	QKESRSVYQL	QYMSWPDRGV
PSSPDHMLAM	VEEARRLQGS	GPEPLCVHCS	AGCGRTGVLC	TVDYVRQLLL
TQMIPPDFSL	FDVVLKMRKQ	RPAAVQTEEQ	YRFLYHTVAQ	MFCSTLQNAS
PHYQNIKENC	APLYDDALFL	RTPQALLAIP	RPPGGVLRSI	SVPGSPGHAM
ADTYAVVQKR	GAPAGAGSGT	QTGTGTGTGA	RSAEEAPLYS	KVTPRAQRPG
AHAEDARGTL	PGRVPADQSP	AGSGAYEDVA	GGAQTGGLGF	NLRIGRPKGP
RDPPAEWTRV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9649 (англ.) . Процитовано 29 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q99952 (англ.) . Архів оригіналу за 24 жовтня 2016. Процитовано 29 серпня 2017.