PTCH2

Ідентифікатори

Символи

PTCH2, PTC2, patched 2

Зовнішні ІД

OMIM: 603673 MGI: 1095405 HomoloGene: 37842 GeneCards: PTCH2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• hedgehog receptor activity • hedgehog family protein binding • smoothened binding
Клітинна компонента	• мембрана • integral component of membrane • клітинна мембрана
Біологічний процес	• skin development • positive regulation of epidermal cell differentiation • hair cycle • epidermal cell fate specification • Детермінація • negative regulation of smoothened signaling pathway • epidermis development • GO:0072468 сигнальна трансдукція • smoothened signaling pathway • regulation of cell growth
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8643


19207

Ensembl


ENSG00000117425


ENSMUSG00000028681

UniProt


Q9Y6C5


O35595

RefSeq (мРНК)


NM_003738 NM_001166292


NM_008958 NM_001312903

RefSeq (білок)


NP_001159764 NP_003729


NP_001299832 NP_032984

Локус (UCSC)

н/д

Хр. 4: 116.95 – 116.97 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PTCH2 (англ. Patched 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 203 амінокислот, а молекулярна маса — 130 544^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTRSPPLREL	PPSYTPPART	AAPQILAGSL	KAPLWLRAYF	QGLLFSLGCG
IQRHCGKVLF	LGLLAFGALA	LGLRMAIIET	NLEQLWVEVG	SRVSQELHYT
KEKLGEEAAY	TSQMLIQTAR	QEGENILTPE	ALGLHLQAAL	TASKVQVSLY
GKSWDLNKIC	YKSGVPLIEN	GMIERMIEKL	FPCVILTPLD	CFWEGAKLQG
GSAYLPGRPD	IQWTNLDPEQ	LLEELGPFAS	LEGFRELLDK	AQVGQAYVGR
PCLHPDDLHC	PPSAPNHHSR	QAPNVAHELS	GGCHGFSHKF	MHWQEELLLG
GMARDPQGEL	LRAEALQSTF	LLMSPRQLYE	HFRGDYQTHD	IGWSEEQAST
VLQAWQRRFV	QLAQEALPEN	ASQQIHAFSS	TTLDDILHAF	SEVSAARVVG
GYLLMLAYAC	VTMLRWDCAQ	SQGSVGLAGV	LLVALAVASG	LGLCALLGIT
FNAATTQVLP	FLALGIGVDD	VFLLAHAFTE	ALPGTPLQER	MGECLQRTGT
SVVLTSINNM	AAFLMAALVP	IPALRAFSLQ	AAIVVGCTFV	AVMLVFPAIL
SLDLRRRHCQ	RLDVLCCFSS	PCSAQVIQIL	PQELGDGTVP	VGIAHLTATV
QAFTHCEASS	QHVVTILPPQ	AHLVPPPSDP	LGSELFSPGG	STRDLLGQEE
ETRQKAACKS	LPCARWNLAH	FARYQFAPLL	LQSHAKAIVL	VLFGALLGLS
LYGATLVQDG	LALTDVVPRG	TKEHAFLSAQ	LRYFSLYEVA	LVTQGGFDYA
HSQRALFDLH	QRFSSLKAVL	PPPATQAPRT	WLHYYRNWLQ	GIQAAFDQDW
ASGRITRHSY	RNGSEDGALA	YKLLIQTGDA	QEPLDFSQLT	TRKLVDREGL
IPPELFYMGL	TVWVSSDPLG	LAASQANFYP	PPPEWLHDKY	DTTGENLRIP
PAQPLEFAQF	PFLLRGLQKT	ADFVEAIEGA	RAACAEAGQA	GVHAYPSGSP
FLFWEQYLGL	RRCFLLAVCI	LLVCTFLVCA	LLLLNPWTAG	LIVLVLAMMT
VELFGIMGFL	GIKLSAIPVV	ILVASVGIGV	EFTVHVALGF	LTTQGSRNLR
AAHALEHTFA	PVTDGAISTL	LGLLMLAGSH	FDFIVRYFFA	ALTVLTLLGL
LHGLVLLPVL	LSILGPPPEV	IQMYKESPEI	LSPPAPQGGG	LRWGASSSLP
QSFARVTTSM	TVAIHPPPLP	GAYIHPAPDE	PPWSPAATSS	GNLSSRGPGP
ATG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у мембрані.

Література

Zaphiropoulos P.G., Unden A.B., Rahnama F., Hollingsworth R.E., Toftgard R. (1999). PTCH2, a novel human patched gene, undergoing alternative splicing and up-regulated in basal cell carcinomas. Cancer Res. 59: 787—792. PMID 10029063

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9586 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9Y6C5 (англ.) . Архів оригіналу за 2 жовтня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.