PODXL2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | PODXL2, EG, PODLX2, podocalyxin like 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 616627 MGI: 2442488 HomoloGene: 9254 GeneCards: PODXL2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • glycosaminoglycan binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • integral component of plasma membrane • мембрана • Golgi lumen |
---|
Біологічний процес | • leukocyte tethering or rolling • адгезія клітин |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_176973 NM_001347327 NM_001364575 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001334256 NP_795947 NP_001351504 NP_001366146 NP_001366147
| NP_001366148 NP_001366149 NP_001366150 NP_001366151 NP_001366152 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 127.63 – 127.67 Mb | Хр. 6: 88.84 – 88.88 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PODXL2 (англ. Podocalyxin like 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 605 амінокислот, а молекулярна маса — 65 076[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGRLLRAARL | | PPLLSPLLLL | | LVGGAFLGAC | | VAGSDEPGPE | | GLTSTSLLDL |
LLPTGLEPLD | | SEEPSETMGL | | GAGLGAPGSG | | FPSEENEESR | | ILQPPQYFWE |
EEEELNDSSL | | DLGPTADYVF | | PDLTEKAGSI | | EDTSQAQELP | | NLPSPLPKMN |
LVEPPWHMPP | | REEEEEEEEE | | EEREKEEVEK | | QEEEEEEELL | | PVNGSQEEAK |
PQVRDFSLTS | | SSQTPGATKS | | RHEDSGDQAS | | SGVEVESSMG | | PSLLLPSVTP |
TTVTPGDQDS | | TSQEAEATVL | | PAAGLGVEFE | | APQEASEEAT | | AGAAGLSGQH |
EEVPALPSFP | | QTTAPSGAEH | | PDEDPLGSRT | | SASSPLAPGD | | MELTPSSATL |
GQEDLNQQLL | | EGQAAEAQSR | | IPWDSTQVIC | | KDWSNLAGKN | | YIILNMTENI |
DCEVFRQHRG | | PQLLALVEEV | | LPRHGSGHHG | | AWHISLSKPS | | EKEQHLLMTL |
VGEQGVVPTQ | | DVLSMLGDIR | | RSLEEIGIQN | | YSTTSSCQAR | | ASQVRSDYGT |
LFVVLVVIGA | | ICIIIIALGL | | LYNCWQRRLP | | KLKHVSHGEE | | LRFVENGCHD |
NPTLDVASDS | | QSEMQEKHPS | | LNGGGALNGP | | GSWGALMGGK | | RDPEDSDVFE |
EDTHL |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з сіаловими кислотами. Локалізований у мембрані.
Література
- Sassetti C., Van Zante A., Rosen S.D. (2000). Identification of endoglycan, a member of the CD34/podocalyxin family of sialomucins. J. Biol. Chem. 275: 9001—9010. PMID 10722749 DOI:10.1074/jbc.275.12.9001
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Fieger C.B., Sassetti C.M., Rosen S.D. (2003). Endoglycan, a member of the CD34 family, functions as an L-selectin ligand through modification with tyrosine sulfation and sialyl Lewis x. J. Biol. Chem. 278: 27390—27398. PMID 12889478 DOI:10.1074/jbc.M304204200
- Kerr S.C., Fieger C.B., Snapp K.R., Rosen S.D. (2008). Endoglycan, a member of the CD34 family of sialomucins, is a ligand for the vascular selectins. J. Immunol. 181: 1480—1490. PMID 18606703 DOI:10.4049/jimmunol.181.2.1480
- Halim A., Ruetschi U., Larson G., Nilsson J. (2013). LC-MS/MS characterization of O-glycosylation sites and glycan structures of human cerebrospinal fluid glycoproteins. J. Proteome Res. 12: 573—584. PMID 23234360 DOI:10.1021/pr300963h
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17936 (англ.) . Процитовано 18 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9NZ53 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 18 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |