PLXND1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3H6N

Ідентифікатори

Символи

PLXND1, PLEXD1, plexin D1

Зовнішні ІД

OMIM: 604282 MGI: 2154244 HomoloGene: 22866 GeneCards: PLXND1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein domain specific binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • semaphorin receptor activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • lamellipodium • integral component of plasma membrane • lamellipodium membrane • cell projection • semaphorin receptor complex
Біологічний процес	• cardiac septum development • outflow tract morphogenesis • regulation of angiogenesis • coronary vasculature development • multicellular organism development • aorta development • Ангіогенез • dichotomous subdivision of terminal units involved in salivary gland branching • branching involved in blood vessel morphogenesis • synapse assembly • positive regulation of protein binding • endothelial cell migration • semaphorin-plexin signaling pathway • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of cell adhesion • regulation of cell shape • regulation of cell migration • positive regulation of axonogenesis • GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity • positive regulation of transcription of Notch receptor target • semaphorin-plexin signaling pathway involved in axon guidance
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23129


67784

Ensembl


ENSG00000004399


ENSMUSG00000030123

UniProt


Q9Y4D7


Q3UH93

RefSeq (мРНК)


NM_015103


NM_026376

RefSeq (білок)


NP_055918


NP_080652

Локус (UCSC)

Хр. 3: 129.56 – 129.61 Mb

Хр. 6: 115.93 – 115.97 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PLXND1 (англ. Plexin D1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 925 амінокислот, а молекулярна маса — 212 007^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAPRAAGGAP	LSARAAAASP	PPFQTPPRCP	VPLLLLLLLG	AARAGALEIQ
RRFPSPTPTN	NFALDGAAGT	VYLAAVNRLY	QLSGANLSLE	AEAAVGPVPD
SPLCHAPQLP	QASCEHPRRL	TDNYNKILQL	DPGQGLVVVC	GSIYQGFCQL
RRRGNISAVA	VRFPPAAPPA	EPVTVFPSML	NVAANHPNAS	TVGLVLPPAA
GAGGSRLLVG	ATYTGYGSSF	FPRNRSLEDH	RFENTPEIAI	RSLDTRGDLA
KLFTFDLNPS	DDNILKIKQG	AKEQHKLGFV	SAFLHPSDPP	PGAQSYAYLA
LNSEARAGDK	ESQARSLLAR	ICLPHGAGGD	AKKLTESYIQ	LGLQCAGGAG
RGDLYSRLVS	VFPARERLFA	VFERPQGSPA	ARAAPAALCA	FRFADVRAAI
RAARTACFVE	PAPDVVAVLD	SVVQGTGPAC	ERKLNIQLQP	EQLDCGAAHL
QHPLSILQPL	KATPVFRAPG	LTSVAVASVN	NYTAVFLGTV	NGRLLKINLN
ESMQVVSRRV	VTVAYGEPVH	HVMQFDPADS	GYLYLMTSHQ	MARVKVAACN
VHSTCGDCVG	AADAYCGWCA	LETRCTLQQD	CTNSSQQHFW	TSASEGPSRC
PAMTVLPSEI	DVRQEYPGMI	LQISGSLPSL	SGMEMACDYG	NNIRTVARVP
GPAFGHQIAY	CNLLPRDQFP	PFPPNQDHVT	VEMSVRVNGR	NIVKANFTIY
DCSRTAQVYP	HTACTSCLSA	QWPCFWCSQQ	HSCVSNQSRC	EASPNPTSPQ
DCPRTLLSPL	APVPTGGSQN	ILVPLANTAF	FQGAALECSF	GLEEIFEAVW
VNESVVRCDQ	VVLHTTRKSQ	VFPLSLQLKG	RPARFLDSPE	PMTVMVYNCA
MGSPDCSQCL	GREDLGHLCM	WSDGCRLRGP	LQPMAGTCPA	PEIHAIEPLS
GPLDGGTLLT	IRGRNLGRRL	SDVAHGVWIG	GVACEPLPDR	YTVSEEIVCV
TGPAPGPLSG	VVTVNASKEG	KSRDRFSYVL	PLVHSLEPTM	GPKAGGTRIT
IHGNDLHVGS	ELQVLVNDTD	PCTELMRTDT	SIACTMPEGA	LPAPVPVCVR
FERRGCVHGN	LTFWYMQNPV	ITAISPRRSP	VSGGRTITVA	GERFHMVQNV
SMAVHHIGRE	PTLCKVLNST	LITCPSPGAL	SNASAPVDFF	INGRAYADEV
AVAEELLDPE	EAQRGSRFRL	DYLPNPQFST	AKREKWIKHH	PGEPLTLVIH
KEQDSLGLQS	HEYRVKIGQV	SCDIQIVSDR	IIHCSVNESL	GAAVGQLPIT
IQVGNFNQTI	ATLQLGGSET	AIIVSIVICS	VLLLLSVVAL	FVFCTKSRRA
ERYWQKTLLQ	MEEMESQIRE	EIRKGFAELQ	TDMTDLTKEL	NRSQGIPFLE
YKHFVTRTFF	PKCSSLYEER	YVLPSQTLNS	QGSSQAQETH	PLLGEWKIPE
SCRPNMEEGI	SLFSSLLNNK	HFLIVFVHAL	EQQKDFAVRD	RCSLASLLTI
ALHGKLEYYT	SIMKELLVDL	IDASAAKNPK	LMLRRTESVV	EKMLTNWMSI
CMYSCLRETV	GEPFFLLLCA	IKQQINKGSI	DAITGKARYT	LSEEWLLREN
IEAKPRNLNV	SFQGCGMDSL	SVRAMDTDTL	TQVKEKILEA	FCKNVPYSQW
PRAEDVDLEW	FASSTQSYIL	RDLDDTSVVE	DGRKKLNTLA	HYKIPEGASL
AMSLIDKKDN	TLGRVKDLDT	EKYFHLVLPT	DELAEPKKSH	RQSHRKKVLP
EIYLTRLLST	KGTLQKFLDD	LFKAILSIRE	DKPPLAVKYF	FDFLEEQAEK
RGISDPDTLH	IWKTNSLPLR	FWVNILKNPQ	FVFDIDKTDH	IDACLSVIAQ
AFIDACSISD	LQLGKDSPTN	KLLYAKEIPE	YRKIVQRYYK	QIQDMTPLSE
QEMNAHLAEE	SRKYQNEFNT	NVAMAEIYKY	AKRYRPQIMA	ALEANPTARR
TQLQHKFEQV	VALMEDNIYE	CYSEA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як ангіогенез, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9107 (англ.) . Архів оригіналу за 6 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9Y4D7 (англ.) . Архів оригіналу за 21 лютого 2017. Процитовано 30 серпня 2017.