PEF1

Ідентифікатори

Символи

PEF1, ABP32, PEF1A, penta-EF-hand domain containing 1

Зовнішні ІД

OMIM: 610033 MGI: 1915148 HomoloGene: 56569 GeneCards: PEF1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein dimerization activity • зв'язування з іоном металу • calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity • protein heterodimerization activity • RNA binding • calcium-dependent protein binding • GO:0032947 molecular adaptor activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • екзосома • мембрана • Golgi membrane • COPII vesicle coat • Cul3-RING ubiquitin ligase complex • ендоплазматичний ретикулум • ER to Golgi transport vesicle membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle
Біологічний процес	• response to calcium ion • протеоліз • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • neural crest formation • neural crest cell development • COPII vesicle coating • positive regulation of protein monoubiquitination
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


553115


67898

Ensembl


ENSG00000162517


ENSMUSG00000028779

UniProt


Q9UBV8


Q8BFY6

RefSeq (мРНК)


NM_012392 NM_001359651


NM_026441

RefSeq (білок)


NP_036524 NP_001346580


NP_080717

Локус (UCSC)

Хр. 1: 31.63 – 31.64 Mb

Хр. 4: 130 – 130.02 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PEF1 (англ. Penta-EF-hand domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 284 амінокислот, а молекулярна маса — 30 381^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASYPYRQGC	PGAAGQAPGA	PPGSYYPGPP	NSGGQYGSGL	PPGGGYGGPA
PGGPYGPPAG	GGPYGHPNPG	MFPSGTPGGP	YGGAAPGGPY	GQPPPSSYGA
QQPGLYGQGG	APPNVDPEAY	SWFQSVDSDH	SGYISMKELK	QALVNCNWSS
FNDETCLMMI	NMFDKTKSGR	IDVYGFSALW	KFIQQWKNLF	QQYDRDRSGS
ISYTELQQAL	SQMGYNLSPQ	FTQLLVSRYC	PRSANPAMQL	DRFIQVCTQL
QVLTEAFREK	DTAVQGNIRL	SFEDFVTMTA	SRML

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kitaura Y., Matsumoto S., Satoh H., Hitomi K., Maki M. (2001). Peflin and ALG-2, members of the penta-EF-hand protein family, form a heterodimer that dissociates in a Ca2+-dependent manner. J. Biol. Chem. 276: 14053—14058. PMID 11278427 DOI:10.1074/jbc.M008649200
Kitaura Y., Satoh H., Takahashi H., Shibata H., Maki M. (2002). Both ALG-2 and peflin, penta-EF-hand (PEF) proteins, are stabilized by dimerization through their fifth EF-hand regions. Arch. Biochem. Biophys. 399: 12—18. PMID 11883899 DOI:10.1006/abbi.2001.2736

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30009 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9UBV8 (англ.) . Архів оригіналу за 14 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.