PDE4B

Наявні структури

Пошук для людей: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1F0J, 1RO6, 1RO9, 1ROR, 1TB5, 1XLX, 1XLZ, 1XM4, 1XM6, 1XMU, 1XMY, 1XN0, 1XOS, 1XOT, 1Y2H, 1Y2J, 2CHM, 2QYL, 3D3P, 3FRG, 3G45, 3GWT, 3HC8, 3HDZ, 3HMV, 3KKT, 3LY2, 3O0J, 3O56, 3O57, 3W5E, 3WD9, 4KP6, 4MYQ, 4NW7, 4WZI, 4X0F

Ідентифікатори

Символи

PDE4B, DPDE4, PDEIVB, phosphodiesterase 4B

Зовнішні ІД

OMIM: 600127 MGI: 99557 HomoloGene: 1953 GeneCards: PDE4B

Пов'язані генетичні захворювання

lymphoblastic leukemia^[1]

Реагує на сполуку

dyphylline^[2]

ібуділаст, roflumilast, Роліпрам^[3]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу • 3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity • hydrolase activity • cAMP binding • gamma-tubulin binding • transmembrane transporter binding • phosphoric diester hydrolase activity • 3',5'-cyclic-AMP phosphodiesterase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• voltage-gated calcium channel complex • gamma-tubulin complex • cell periphery • гіалоплазма • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • dendritic spine • мембрана • центросома • Z discdkac • excitatory synapse • Синаптичні бульбашки
Біологічний процес	• regulation of high voltage-gated calcium channel activity • neutrophil homeostasis • regulation of cardiac muscle cell contraction • positive regulation of interferon-gamma production • GO:0072468 сигнальна трансдукція • cellular response to lipopolysaccharide • positive regulation of interleukin-2 production • leukocyte migration • negative regulation of relaxation of cardiac muscle • cellular response to epinephrine stimulus • T cell receptor signaling pathway • neutrophil chemotaxis • cAMP catabolic process • G protein-coupled receptor signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5142


18578

Ensembl


ENSG00000184588


ENSMUSG00000028525

UniProt


Q07343


н/д

RefSeq (мРНК)

NM_001037339 NM_001037340 NM_001037341 NM_001297440 NM_001297441
NM_001297442 NM_002600

NM_001177980 NM_001177981 NM_001177982 NM_001177983 NM_019840
NM_001374780

RefSeq (білок)

NP_001032416 NP_001032417 NP_001032418 NP_001284369 NP_001284370
NP_001284371 NP_002591 NP_001032418.1 NP_002591.2


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 1: 65.79 – 66.37 Mb

Хр. 4: 101.94 – 102.46 Mb

PubMed search

^[4]

^[5]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PDE4B (англ. Phosphodiesterase 4B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[6] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 736 амінокислот, а молекулярна маса — 83 343^[7].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKKSRSVMTV	MADDNVKDYF	ECSLSKSYSS	SSNTLGIDLW	RGRRCCSGNL
QLPPLSQRQS	ERARTPEGDG	ISRPTTLPLT	TLPSIAITTV	SQECFDVENG
PSPGRSPLDP	QASSSAGLVL	HATFPGHSQR	RESFLYRSDS	DYDLSPKAMS
RNSSLPSEQH	GDDLIVTPFA	QVLASLRSVR	NNFTILTNLH	GTSNKRSPAA
SQPPVSRVNP	QEESYQKLAM	ETLEELDWCL	DQLETIQTYR	SVSEMASNKF
KRMLNRELTH	LSEMSRSGNQ	VSEYISNTFL	DKQNDVEIPS	PTQKDREKKK
KQQLMTQISG	VKKLMHSSSL	NNTSISRFGV	NTENEDHLAK	ELEDLNKWGL
NIFNVAGYSH	NRPLTCIMYA	IFQERDLLKT	FRISSDTFIT	YMMTLEDHYH
SDVAYHNSLH	AADVAQSTHV	LLSTPALDAV	FTDLEILAAI	FAAAIHDVDH
PGVSNQFLIN	TNSELALMYN	DESVLENHHL	AVGFKLLQEE	HCDIFMNLTK
KQRQTLRKMV	IDMVLATDMS	KHMSLLADLK	TMVETKKVTS	SGVLLLDNYT
DRIQVLRNMV	HCADLSNPTK	SLELYRQWTD	RIMEEFFQQG	DKERERGMEI
SPMCDKHTAS	VEKSQVGFID	YIVHPLWETW	ADLVQPDAQD	ILDTLEDNRN
WYQSMIPQSP	SPPLDEQNRD	CQGLMEKFQF	ELTLDEEDSE	GPEKEGEGHS
YFSSTKTLCV	IDPENRDSLG	ETDIDIATED	KSPVDT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
McLaughlin M.M., Cieslinski L.B., Burman M., Torphy T.J., Livi G.P. (1993). A low-Km, rolipram-sensitive, cAMP-specific phosphodiesterase from human brain. Cloning and expression of cDNA, biochemical characterization of recombinant protein, and tissue distribution of mRNA. J. Biol. Chem. 268: 6470—6476. PMID 8384210

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з PDE4B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Phosphodiesterase 4B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8781 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q07343 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.