PDE4A

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2QYK, 3I8V, 3TVX

Ідентифікатори

Символи

PDE4A, DPDE2, PDE4, PDE46, phosphodiesterase 4A

Зовнішні ІД

OMIM: 600126 MGI: 99558 HomoloGene: 4520 GeneCards: PDE4A

Реагує на сполуку

ібуділаст, Роліпрам, YM976, dyphylline, crisaborole, ібуділаст, tetomilast, flavoxate hydrochloride^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• phosphoric diester hydrolase activity • cAMP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • 3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity • зв'язування з іоном металу • 3',5'-cyclic-AMP phosphodiesterase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • ruffle membrane • perinuclear region of cytoplasm • гіалоплазма • cell projection • мембрана • нуклеоплазма • клітинна мембрана
Біологічний процес	• sensory perception of smell • regulation of cAMP-mediated signaling • cAMP catabolic process • regulation of protein kinase A signaling • GO:0072468 сигнальна трансдукція • G protein-coupled receptor signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5141


18577

Ensembl


ENSG00000065989


ENSMUSG00000032177

UniProt


P27815


O89084

RefSeq (мРНК)


NM_001111307 NM_001111308 NM_001111309 NM_001243121 NM_006202


NM_019798 NM_183408 NM_001310750

RefSeq (білок)


NP_001104777 NP_001104778 NP_001104779 NP_001230050 NP_006193


NP_001297679 NP_062772 NP_899668

Локус (UCSC)

Хр. 19: 10.42 – 10.47 Mb

Хр. 9: 21.08 – 21.12 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PDE4A (англ. Phosphodiesterase 4A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 886 амінокислот, а молекулярна маса — 98 143^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEPPTVPSER	SLSLSLPGPR	EGQATLKPPP	QHLWRQPRTP	IRIQQRGYSD
SAERAERERQ	PHRPIERADA	MDTSDRPGLR	TTRMSWPSSF	HGTGTGSGGA
GGGSSRRFEA	ENGPTPSPGR	SPLDSQASPG	LVLHAGAATS	QRRESFLYRS
DSDYDMSPKT	MSRNSSVTSE	AHAEDLIVTP	FAQVLASLRS	VRSNFSLLTN
VPVPSNKRSP	LGGPTPVCKA	TLSEETCQQL	ARETLEELDW	CLEQLETMQT
YRSVSEMASH	KFKRMLNREL	THLSEMSRSG	NQVSEYISTT	FLDKQNEVEI
PSPTMKEREK	QQAPRPRPSQ	PPPPPVPHLQ	PMSQITGLKK	LMHSNSLNNS
NIPRFGVKTD	QEELLAQELE	NLNKWGLNIF	CVSDYAGGRS	LTCIMYMIFQ
ERDLLKKFRI	PVDTMVTYML	TLEDHYHADV	AYHNSLHAAD	VLQSTHVLLA
TPALDAVFTD	LEILAALFAA	AIHDVDHPGV	SNQFLINTNS	ELALMYNDES
VLENHHLAVG	FKLLQEDNCD	IFQNLSKRQR	QSLRKMVIDM	VLATDMSKHM
TLLADLKTMV	ETKKVTSSGV	LLLDNYSDRI	QVLRNMVHCA	DLSNPTKPLE
LYRQWTDRIM	AEFFQQGDRE	RERGMEISPM	CDKHTASVEK	SQVGFIDYIV
HPLWETWADL	VHPDAQEILD	TLEDNRDWYY	SAIRQSPSPP	PEEESRGPGH
PPLPDKFQFE	LTLEEEEEEE	ISMAQIPCTA	QEALTAQGLS	GVEEALDATI
AWEASPAQES	LEVMAQEASL	EAELEAVYLT	QQAQSTGSAP	VAPDEFSSRE
EFVVAVSHSS	PSALALQSPL	LPAWRTLSVS	EHAPGLPGLP	STAAEVEAQR
EHQAAKRACS	ACAGTFGEDT	SALPAPGGGG	SGGDPT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних відростках.

Література

Sullivan M., Egerton M., Shakur Y., Marquardsen A., Houslay M.D. (1994). Molecular cloning and expression, in both COS-1 cells and S. cerevisiae, of a human cytosolic type-IVA, cyclic AMP specific phosphodiesterase (hPDE-IVA-h6.1). Cell. Signal. 6: 793—812. PMID 7888306 DOI:10.1016/0898-6568(94)00039-5
Horton Y.M., Sullivan M., Houslay M.D. (1995). Molecular cloning of a novel splice variant of human type IVA (PDE-IVA) cyclic AMP phosphodiesterase and localization of the gene to the p13.2-q12 region of human chromosome 19. Biochem. J. 308: 683—691. PMID 7772058 DOI:10.1042/bj3080683
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Phosphodiesterase 4A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8780 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P27815 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.