PDE4A |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/7/76/Protein_PDE4A_PDB_1loi.png/250px-Protein_PDE4A_PDB_1loi.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2QYK, 3I8V, 3TVX | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | PDE4A, DPDE2, PDE4, PDE46, phosphodiesterase 4A |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 600126 MGI: 99558 HomoloGene: 4520 GeneCards: PDE4A |
---|
|
Реагує на сполуку |
---|
ібуділаст, Роліпрам, YM976, dyphylline, crisaborole, ібуділаст, tetomilast, flavoxate hydrochloride[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • phosphoric diester hydrolase activity • cAMP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • 3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity • зв'язування з іоном металу • 3',5'-cyclic-AMP phosphodiesterase activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • ruffle membrane • perinuclear region of cytoplasm • гіалоплазма • cell projection • мембрана • нуклеоплазма • клітинна мембрана |
---|
Біологічний процес | • sensory perception of smell • regulation of cAMP-mediated signaling • cAMP catabolic process • regulation of protein kinase A signaling • GO:0072468 сигнальна трансдукція • G protein-coupled receptor signaling pathway |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/9a/PBB_GE_PDE4A_204735_at_fs.png/250px-PBB_GE_PDE4A_204735_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/df/PBB_GE_PDE4A_211447_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_PDE4A_211447_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/0d/PBB_GE_PDE4A_211591_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_PDE4A_211591_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001111307 NM_001111308 NM_001111309 NM_001243121 NM_006202 |
| | NM_019798 NM_183408 NM_001310750 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001104777 NP_001104778 NP_001104779 NP_001230050 NP_006193 |
| | NP_001297679 NP_062772 NP_899668 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 10.42 – 10.47 Mb | Хр. 9: 21.08 – 21.12 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PDE4A (англ. Phosphodiesterase 4A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 886 амінокислот, а молекулярна маса — 98 143[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEPPTVPSER | | SLSLSLPGPR | | EGQATLKPPP | | QHLWRQPRTP | | IRIQQRGYSD |
SAERAERERQ | | PHRPIERADA | | MDTSDRPGLR | | TTRMSWPSSF | | HGTGTGSGGA |
GGGSSRRFEA | | ENGPTPSPGR | | SPLDSQASPG | | LVLHAGAATS | | QRRESFLYRS |
DSDYDMSPKT | | MSRNSSVTSE | | AHAEDLIVTP | | FAQVLASLRS | | VRSNFSLLTN |
VPVPSNKRSP | | LGGPTPVCKA | | TLSEETCQQL | | ARETLEELDW | | CLEQLETMQT |
YRSVSEMASH | | KFKRMLNREL | | THLSEMSRSG | | NQVSEYISTT | | FLDKQNEVEI |
PSPTMKEREK | | QQAPRPRPSQ | | PPPPPVPHLQ | | PMSQITGLKK | | LMHSNSLNNS |
NIPRFGVKTD | | QEELLAQELE | | NLNKWGLNIF | | CVSDYAGGRS | | LTCIMYMIFQ |
ERDLLKKFRI | | PVDTMVTYML | | TLEDHYHADV | | AYHNSLHAAD | | VLQSTHVLLA |
TPALDAVFTD | | LEILAALFAA | | AIHDVDHPGV | | SNQFLINTNS | | ELALMYNDES |
VLENHHLAVG | | FKLLQEDNCD | | IFQNLSKRQR | | QSLRKMVIDM | | VLATDMSKHM |
TLLADLKTMV | | ETKKVTSSGV | | LLLDNYSDRI | | QVLRNMVHCA | | DLSNPTKPLE |
LYRQWTDRIM | | AEFFQQGDRE | | RERGMEISPM | | CDKHTASVEK | | SQVGFIDYIV |
HPLWETWADL | | VHPDAQEILD | | TLEDNRDWYY | | SAIRQSPSPP | | PEEESRGPGH |
PPLPDKFQFE | | LTLEEEEEEE | | ISMAQIPCTA | | QEALTAQGLS | | GVEEALDATI |
AWEASPAQES | | LEVMAQEASL | | EAELEAVYLT | | QQAQSTGSAP | | VAPDEFSSRE |
EFVVAVSHSS | | PSALALQSPL | | LPAWRTLSVS | | EHAPGLPGLP | | STAAEVEAQR |
EHQAAKRACS | | ACAGTFGEDT | | SALPAPGGGG | | SGGDPT |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних відростках.
Література
- Sullivan M., Egerton M., Shakur Y., Marquardsen A., Houslay M.D. (1994). Molecular cloning and expression, in both COS-1 cells and S. cerevisiae, of a human cytosolic type-IVA, cyclic AMP specific phosphodiesterase (hPDE-IVA-h6.1). Cell. Signal. 6: 793—812. PMID 7888306 DOI:10.1016/0898-6568(94)00039-5
- Horton Y.M., Sullivan M., Houslay M.D. (1995). Molecular cloning of a novel splice variant of human type IVA (PDE-IVA) cyclic AMP phosphodiesterase and localization of the gene to the p13.2-q12 region of human chromosome 19. Biochem. J. 308: 683—691. PMID 7772058 DOI:10.1042/bj3080683
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Phosphodiesterase 4A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8780 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, P27815 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |