PCGF1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4HPL, 4HPM

Ідентифікатори

Символи

PCGF1, 2010002K04Rik, NSPC1, RNF3A-2, RNF68, polycomb group ring finger 1

Зовнішні ІД

OMIM: 610231 MGI: 1917087 HomoloGene: 13090 GeneCards: PCGF1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • promoter-specific chromatin binding
Клітинна компонента	• PcG protein complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • PRC1 complex
Біологічний процес	• histone H2A monoubiquitination • transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • histone H2A-K119 monoubiquitination • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


84759


69837

Ensembl


ENSG00000115289


ENSMUSG00000069678

UniProt


Q9BSM1


Q8R023

RefSeq (мРНК)


NM_032673


NM_197992

RefSeq (білок)


NP_116062


NP_932109 NP_001390487 NP_001390488 NP_001390489 NP_001390490

Локус (UCSC)

Хр. 2: 74.51 – 74.51 Mb

Хр. 6: 83.05 – 83.06 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PCGF1 (англ. Polycomb group ring finger 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 259 амінокислот, а молекулярна маса — 30 346^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASPQGGQIA	IAMRLRNQLQ	SVYKMDPLRN	EEEVRVKIKD	LNEHIVCCLC
AGYFVDATTI	TECLHTFCKS	CIVKYLQTSK	YCPMCNIKIH	ETQPLLNLKL
DRVMQDIVYK	LVPGLQDSEE	KRIREFYQSR	GLDRVTQPTG	EEPALSNLGL
PFSSFDHSKA	HYYRYDEQLN	LCLERLSSGK	DKNKSVLQNK	YVRCSVRAEV
RHLRRVLCHR	LMLNPQHVQL	LFDNEVLPDH	MTMKQIWLSR	WFGKPSPLLL
QYSVKEKRR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Gearhart M.D., Corcoran C.M., Wamstad J.A., Bardwell V.J. (2006). Polycomb group and SCF ubiquitin ligases are found in a novel BCOR complex that is recruited to BCL6 targets. Mol. Cell. Biol. 26: 6880—6889. PMID 16943429 DOI:10.1128/MCB.00630-06
Vandamme J., Volkel P., Rosnoblet C., Le Faou P., Angrand P.O. (2011). Interaction proteomics analysis of polycomb proteins defines distinct PRC1 Complexes in mammalian cells. Mol. Cell. Proteomics: —. PMID 21282530 DOI:10.1074/mcp.M110.002642

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17615 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 29 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9BSM1 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.