PCDHB7

Ідентифікатори

Символи

PCDHB7, PCDH-BETA7, protocadherin beta 7

Зовнішні ІД

OMIM: 606333 MGI: 2136750 HomoloGene: 32429 GeneCards: PCDHB7

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • integral component of plasma membrane
Біологічний процес	• homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • адгезія клітин • chemical synaptic transmission • synapse assembly
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


56129


93886

Ensembl


ENSG00000113212


ENSMUSG00000047033

UniProt


Q9Y5E2


Q91Y04

RefSeq (мРНК)


NM_018940


NM_053140

RefSeq (білок)


NP_061763


NP_444370

Локус (UCSC)

Хр. 5: 141.17 – 141.18 Mb

Хр. 18: 37.61 – 37.61 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PCDHB7 (англ. Protocadherin beta 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 793 амінокислот, а молекулярна маса — 86 707^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEARVERAVQ	KRQVLFLCVF	LGMSWAGAEP	LRYFVAEETE	RGTFLTNLAK
DLGLGVGELR	ARGTRIVSDQ	NMQILLLSSL	TGDLLLNEKL	DREELCGPRE
PCVLPFQLLL	EKPFQIFRAE	LWVRDINDHA	PVFLDREISL	KILESTTPGA
AFLLESAQDS	DVGTNSLSNY	TISPNAYFHI	NVHDSGEGNI	YPELVLNQVL
DREEIPEFSL	TLTALDGGSP	PRSGTALVRI	LVLDVNDNAP	DFVRSLYKVQ
VPENSPVGSM	VVSVSARDLD	TGSNGEIAYA	FSYATERILK	TFQINPTSGS
LHLKAQLDYE	AIQTYTLTIQ	AKDGGGLSGK	CTVVVDVTDI	NDNRPELLLS
SLTSPIAENS	PETVVAVFRI	RDRDSGNNGK	TVCSIQDDVP	FILKPSVENF
YTLVTEKPLD	RERNTEYNIT	ITVTDLGTPR	LKTEHNITVL	VSDVNDNAPA
FTQTSYTLFV	RENNSPALPI	GSVSATDRDS	GTNAQVIYSL	LPSQDPHLPL
ASLVSINADN	GHLFALRSLD	YEALQAFEFR	VGATDRGSPA	LSSEALVRVL
VLDANDNSPF	VLYPLQNSSA	PCTEPLPRAA	EPGYLVTKVV	AVDGDSGQNA
WLSYQLLKAT	EPGLFGVWAH	NGEVRTARLL	SERDAAKQRL	VVLVKDNGEP
PRSATATLHV	LLVDGFSQPY	LRLPEAAPDQ	ANSLTVYLVV	ALASVSSLFL
LSVLLFVAVR	LCRRSRAAPV	GRCSVPEGPF	PRHLVDLSGT	GTLSQSYQYE
VCLTGGSGTN	EFKFLKPIIP	NLLPQSTGRE	VEENRPFQNN	LGF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
Vanhalst K., Kools P., Vanden Eynde E., van Roy F. (2001). The human and murine protocadherin-beta one-exon gene families show high evolutionary conservation, despite the difference in gene number. FEBS Lett. 495: 120—125. PMID 11322959 DOI:10.1016/S0014-5793(01)02372-9
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8692 (англ.) . Архів оригіналу за 30 жовтня 2015. Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y5E2 (англ.) . Архів оригіналу за 3 січня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.