PCDHA5

Ідентифікатори

Символи

PCDHA5, CNR6, CNRN6, CNRS6, CRNR6, PCDH-ALPHA5, protocadherin alpha 5

Зовнішні ІД

OMIM: 606311 MGI: 1298371 HomoloGene: 49565 GeneCards: PCDHA5

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • мембрана
Біологічний процес	• адгезія клітин • нейробіологія розвитку • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • cell-cell signaling
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


56143


12941

Ensembl


н/д


ENSMUSG00000103092

UniProt


Q9Y5H7


Q91Y15

RefSeq (мРНК)


NM_031501 NM_018908


NM_009959

RefSeq (білок)


NP_061731 NP_113689


NP_034089

Локус (UCSC)

н/д

Хр. 18: 37.09 – 37.32 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PCDHA5 (англ. Protocadherin alpha 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 936 амінокислот, а молекулярна маса — 102 048^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVYSRRGSLG	SRLLLLWLLL	AYWKAGSGQL	HYSIPEEAKH	GTFVGRIAQD
LGLELAELVP	RLFRVASKGR	GDLLEVNLQN	GILFVNSRID	REELCRRRAE
CSIHLEVIVD	RPLQVFHVEV	AVKDINDNPP	RFSRQEQRLF	ILESRMPDSR
FPLEGASDLD	IGANAQLRYR	LNPNEYFDLD	VKTNEEETNF	LELVLRKSLD
REETQEHRLL	VIATDGGKPE	LTGTVQLLIN	VLDANDNAPE	FDKSIYNVRL
LENAPSGTLV	IKLNASDADE	GINKEIVYFF	SNLVLDDVKS	KFIINSNTGE
IKVNGELDYE	DYNSYEINID	AMDKSTFPLS	GHCKVVVKLL	DVNDNTPEMA
ITTLFLPVKE	DAPLSTVIAL	ISVSDRDSGA	NGQVTCSLMP	HVPFKLVSTF
KNYYSLVLDS	ALDRESVSVY	ELVVTARDGG	SPSLWATASV	SVEVADVNDN
APAFAQPQYT	VFVKENNPPG	CHIFTVSARD	ADAQENALVS	YSLVERRVGE
RPLSSYVSVH	AESGKVYALQ	PLDHEEVELL	QFQVSARDAG	VPPLGSNVTL
QVFVLDENDN	APALLVPRVG	GTGGAVSELV	PRSVGAGHVV	AKVRAVDPDS
GYNAWLSYEL	QPAPGSARIP	FRVGLYTGEI	STTRSLDETE	APRHRLLVLV
KDHGEPPLTA	TATVLVSLVE	SGQAPKASSR	ASAGAVGPEA	ALVDVNVYLI
IAICAVSSLL	VLTLLLYTAL	RCSAQPTEAV	CTRGKPTLLC	SSAVGSWSYS
QQRRQRVCSG	EAPPKTDLMA	FSPSLPQGPT	STDNPRQPNP	DWRYSASLRA
GMHSSVHLEE	AGILRAGPGG	PDQQWPTVSS	ATPEPEAGEV	SPPVGAGVNS
NSWTFKYGPG	NPKQSGPGEL	PDKFIIPGSP	AIISIRQEPT	NSQIDKSDFI
TFGKKEETKK	KKKKKKGNKT	QEKKEKGNST	TDNSDQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8671 (англ.) . Архів оригіналу за 12 березня 2016. Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y5H7 (англ.) . Архів оригіналу за 3 лютого 2017. Процитовано 5 вересня 2017.