PCDHA3 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

PCDHA3

Ідентифікатори

Символи

PCDHA3, PCDH-ALPHA3, protocadherin alpha 3

Зовнішні ІД

OMIM: 606309 MGI: 2447313 HomoloGene: 129613 GeneCards: PCDHA3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • мембрана
Біологічний процес	• адгезія клітин • нейробіологія розвитку • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • cell-cell signaling
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


56145


192163

Ensembl


ENSG00000255408


ENSMUSG00000102312

UniProt


Q9Y5H8


Q91Y16

RefSeq (мРНК)


NM_031497 NM_018906


NM_138662

RefSeq (білок)


NP_061729 NP_113685


NP_619603

Локус (UCSC)

Хр. 5: 140.8 – 141.01 Mb

Хр. 18: 37.08 – 37.32 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PCDHA3 (англ. Protocadherin alpha 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 950 амінокислот, а молекулярна маса — 102 428^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLFSWREDPG	AQCLLLSLLL	LAASEVGSGQ	LHYSVSEEAK	HGTFVGRIAQ
DLGLELAELV	PRLFRVASKR	HGDLLEVNLQ	NGILFVNSRI	DREELCGRSA
ECSIHLEVIV	DRPLQVFHVE	VEVKDINDNA	PVFPMAVKNL	FISESRQPGS
RFSLEGASDA	DIGTNSLLTY	SLDSTEYFTL	DVKRNDEEIK	SLGLVLKKNL
NREDTPKHYL	LITAIDGGKP	ELTGTTQLKI	TVLDVNDNAP	AFERTIYKVR
LLENAPNGTL	VVTVNATDLD	EGVNKDIAYS	FNTDMSADIL	SKFHLDPVNG
QISVKGNIDF	EESKSYEIQV	EATDKGNPPM	SDHCTVLLEI	VDINDNVPEL
VIQSLSLPVL	EDSPLSTVIA	LISVSDRDSG	VNGQVTCSLT	PHVPFKLVST
FKNYYSLVLD	SPLDRESVSA	YELVVTARDG	GSPSLWATAS	VSVEVADVND
NAPAFSQSEY	TVFVKENNPP	GCHIFTVSAR	DADAQENALV	SYSLVERRVG
ERALSSYVSV	HAESGKVYAL	QPLDHEELEL	LQFQVSARDA	GVPPLGSNVT
LQVFVLDEND	NAPALLMPRV	GGIGGAVSEL	VPRSVGAGHV	VAKVRAVDAD
SGYNAWLSYE	LQPGTGGARI	PFRVGLYTGE	ISTTRALDEV	DAPRHRLLVL
VKDHGEPSLT	ATATVLVSLV	ESGQAPKASS	QASAGATGPE	AALVDVNVYL
IVAICAVSSL	LVLTLLLYTA	LRCSAPPTEG	DCGPGKPTLV	CSSAVGSWSY
SQQRQQRVCS	GEGLPKTDLM	AFSPSLPPCP	ISRDREEKQD	VDVDLSAKPR
QPNPDWRYSA	SLRAGMHSSV	HLEEAGILRA	GPGGPDQQWP	TVSSATPEPE
AGEVSPPVGA	GVNSNSWTFK	YGPGNPKQSG	PGELPDKFII	PGSPAIISIR
QEPTNSQIDK	SDFITFGKKE	ETKKKKKKKK	GNKTQEKKEK	GNSTTDNSDQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8669 (англ.) . Архів оригіналу за 30 жовтня 2015. Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y5H8 (англ.) . Архів оригіналу за 4 лютого 2017. Процитовано 5 вересня 2017.