PAXIP1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук для людей: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | PAXIP1, CAGF29, PACIP1, PAXIP1L, PTIP, TNRC2, CAGF28, PAX interacting protein 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 608254 HomoloGene: 133914 GeneCards: PAXIP1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • nuclear matrix • нуклеоплазма • MLL3/4 complex • клітинне ядро • histone methyltransferase complex • хромосома |
---|
Біологічний процес | • response to ionizing radiation • positive regulation of histone H3-K36 methylation • DNA recombination • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • chorion development • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator • transcription, DNA-templated • positive regulation of histone acetylation • cellular response to DNA damage stimulus • васкулогенез • positive regulation of isotype switching • histone H3-K4 methylation • positive regulation of histone H3-K4 methylation • adipose tissue development • double-strand break repair via nonhomologous end joining • positive regulation of protein ubiquitination • endothelial cell migration • GO:0100026 Репарація ДНК • positive regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter • regulation of cell cycle G2/M phase transition • positive regulation of isotype switching to IgG isotypes • positive regulation of response to DNA damage stimulus • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 7: 154.94 – 155 Mb | н/д |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PAXIP1 (англ. PAX interacting protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 069 амінокислот, а молекулярна маса — 121 341[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSDQAPKVPE | | EMFREVKYYA | | VGDIDPQVIQ | | LLKAGKAKEV | | SYNALASHII |
SEDGDNPEVG | | EAREVFDLPV | | VKPSWVILSV | | QCGTLLPVNG | | FSPESCQIFF |
GITACLSQVS | | SEDRSALWAL | | VTFYGGDCQL | | TLNKKCTHLI | | VPEPKGEKYE |
CALKRASIKI | | VTPDWVLDCV | | SEKTKKDEAF | | YHPRLIIYEE | | EEEEEEEEEE |
VENEEQDSQN | | EGSTDEKSSP | | ASSQEGSPSG | | DQQFSPKSNT | | EKSKGELMFD |
DSSDSSPEKQ | | ERNLNWTPAE | | VPQLAAAKRR | | LPQGKEPGLI | | NLCANVPPVP |
GNILPPEVRG | | NLMAAGQNLQ | | SSERSEMIAT | | WSPAVRTLRN | | ITNNADIQQM |
NRPSNVAHIL | | QTLSAPTKNL | | EQQVNHSQQG | | HTNANAVLFS | | QVKVTPETHM |
LQQQQQAQQQ | | QQQHPVLHLQ | | PQQIMQLQQQ | | QQQQISQQPY | | PQQPPHPFSQ |
QQQQQQQAHP | | HQFSQQQLQF | | PQQQLHPPQQ | | LHRPQQQLQP | | FQQQHALQQQ |
FHQLQQHQLQ | | QQQLAQLQQQ | | HSLLQQQQQQ | | QIQQQQLQRM | | HQQQQQQQMQ |
SQTAPHLSQT | | SQALQHQVPP | | QQPPQQQQQQ | | QPPPSPQQHQ | | LFGHDPAVEI |
PEEGFLLGCV | | FAIADYPEQM | | SDKQLLATWK | | RIIQAHGGTV | | DPTFTSRCTH |
LLCESQVSSA | | YAQAIRERKR | | CVTAHWLNTV | | LKKKKMVPPH | | RALHFPVAFP |
PGGKPCSQHI | | ISVTGFVDSD | | RDDLKLMAYL | | AGAKYTGYLC | | RSNTVLICKE |
PTGLKYEKAK | | EWRIPCVNAQ | | WLGDILLGNF | | EALRQIQYSR | | YTAFSLQDPF |
APTQHLVLNL | | LDAWRVPLKV | | SAELLMSIRL | | PPKLKQNEVA | | NVQPSSKRAR |
IEDVPPPTKK | | LTPELTPFVL | | FTGFEPVQVQ | | QYIKKLYILG | | GEVAESAQKC |
THLIASKVTR | | TVKFLTAISV | | VKHIVTPEWL | | EECFRCQKFI | | DEQNYILRDA |
EAEVLFSFSL | | EESLKRAHVS | | PLFKAKYFYI | | TPGICPSLST | | MKAIVECAGG |
KVLSKQPSFR | | KLMEHKQNSS | | LSEIILISCE | | NDLHLCREYF | | ARGIDVHNAE |
FVLTGVLTQT | | LDYESYKFN |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, хромосомах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Manke I.A., Lowery D.M., Nguyen A., Yaffe M.B. (2003). BRCT repeats as phosphopeptide-binding modules involved in protein targeting. Science. 302: 636—639. PMID 14576432 DOI:10.1126/science.1088877
- Jowsey P.A., Doherty A.J., Rouse J. (2004). Human PTIP facilitates ATM-mediated activation of p53 and promotes cellular resistance to ionizing radiation. J. Biol. Chem. 279: 55562—55569. PMID 15456759 DOI:10.1074/jbc.M411021200
- Patel S.R., Kim D., Levitan I., Dressler G.R. (2007). The BRCT-domain containing protein PTIP links PAX2 to a histone H3, lysine 4 methyltransferase complex. Dev. Cell. 13: 580—592. PMID 17925232 DOI:10.1016/j.devcel.2007.09.004
- Munoz I.M., Jowsey P.A., Toth R., Rouse J. (2007). Phospho-epitope binding by the BRCT domains of hPTIP controls multiple aspects of the cellular response to DNA damage. Nucleic Acids Res. 35: 5312—5322. PMID 17690115 DOI:10.1093/nar/gkm493
- Gohler T., Munoz I.M., Rouse J., Blow J.J. (2008). PTIP/Swift is required for efficient PCNA ubiquitination in response to DNA damage. DNA Repair. 7: 775—787. PMID 18353733 DOI:10.1016/j.dnarep.2008.02.001
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8624 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q6ZW49 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |