PATJ

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1VF6, 2D92, 2DAZ, 2DB5, 2DLU, 2DM8, 2DMZ, 2EHR, 4Q2N

Ідентифікатори

Символи

PATJ, Cipp, InaD-like, hINADL, INADL, crumbs cell polarity complex component, PATJ crumbs cell polarity complex component

Зовнішні ІД

OMIM: 603199 MGI: 1277960 HomoloGene: 72199 GeneCards: PATJ

Пов'язані генетичні захворювання

ожиріння^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • perinuclear region of cytoplasm • клітинна мембрана • apical part of cell • екзосома • apical plasma membrane • мембрана • bicellular tight junction • центросома • центр організації мікротрубочок • гіалоплазма • міжклітинні контакти • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• GO:0007243 intracellular signal transduction • bicellular tight junction assembly
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10207


12695

Ensembl


ENSG00000132849


ENSMUSG00000061859

UniProt


Q8NI35


Q63ZW7

RefSeq (мРНК)


NM_005799 NM_176877 NM_176878 NM_001350145


NM_001005784 NM_001005787 NM_007704 NM_172696 NM_001355177

RefSeq (білок)


NP_795352 NP_001337074


NP_001005784 NP_001005787 NP_031730 NP_766284 NP_001342106

Локус (UCSC)

Хр. 1: 61.74 – 62.18 Mb

Хр. 4: 98.28 – 98.61 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PATJ (англ. PATJ, crumbs cell polarity complex component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 801 амінокислот, а молекулярна маса — 196 368^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPENPATDKL	QVLQVLDRLK	MKLQEKGDTS	QNEKLSMFYE	TLKSPLFNQI
LTLQQSIKQL	KGQLNHIPSD	CSANFDFSRK	GLLVFTDGSI	TNGNVHRPSN
NSTVSGLFPW	TPKLGNEDFN	SVIQQMAQGR	QIEYIDIERP	STGGLGFSVV
ALRSQNLGKV	DIFVKDVQPG	SVADRDQRLK	ENDQILAINH	TPLDQNISHQ
QAIALLQQTT	GSLRLIVARE	PVHTKSSTSS	SLNDTTLPET	VCWGHVEEVE
LINDGSGLGF	GIVGGKTSGV	VVRTIVPGGL	ADRDGRLQTG	DHILKIGGTN
VQGMTSEQVA	QVLRNCGNSV	RMLVARDPAG	DISVTPPAPA	ALPVALPTVA
SKGPGSDSSL	FETYNVELVR	KDGQSLGIRI	VGYVGTSHTG	EASGIYVKSI
IPGSAAYHNG	HIQVNDKIVA	VDGVNIQGFA	NHDVVEVLRN	AGQVVHLTLV
RRKTSSSTSP	LEPPSDRGTV	VEPLKPPALF	LTGAVETETN	VDGEDEEIKE
RIDTLKNDNI	QALEKLEKVP	DSPENELKSR	WENLLGPDYE	VMVATLDTQI
ADDAELQKYS	KLLPIHTLRL	GVEVDSFDGH	HYISSIVSGG	PVDTLGLLQP
EDELLEVNGM	QLYGKSRREA	VSFLKEVPPP	FTLVCCRRLF	DDEASVDEPR
RTETSLPETE	VDHNMDVNTE	EDDDGELALW	SPEVKIVELV	KDCKGLGFSI
LDYQDPLDPT	RSVIVIRSLV	ADGVAERSGG	LLPGDRLVSV	NEYCLDNTSL
AEAVEILKAV	PPGLVHLGIC	KPLVEDNEEE	SCYILHSSSN	EDKTEFSGTI
HDINSSLILE	APKGFRDEPY	FKEELVDEPF	LDLGKSFHSQ	QKEIEQSKEA
WEMHEFLTPR	LQEMDEEREI	LVDEEYELYQ	DPSPSMELYP	LSHIQEATPV
PSVNELHFGT	QWLHDNEPSE	SQEARTGRTV	YSQEAQPYGY	CPENVMKENF
VMESLPSVPS	TEGNSQQGRF	DDLENLNSLA	KTSLDLGMIP	NDVQGPSLLI
DLPVVAQRRE	QEDLPLYQHQ	ATRVISKASA	YTGMLSSRYA	TDTCELPERE
EGEGEETPNF	SHWGPPRIVE	IFREPNVSLG	ISIVGGQTVI	KRLKNGEELK
GIFIKQVLED	SPAGKTNALK	TGDKILEVSG	VDLQNASHSE	AVEAIKNAGN
PVVFIVQSLS	STPRVIPNVH	NKANKITGNQ	NQDTQEKKEK	RQGTAPPPMK
LPPPYKALTD	DSDENEEEDA	FTDQKIRQRY	ADLPGELHII	ELEKDKNGLG
LSLAGNKDRS	RMSIFVVGIN	PEGPAAADGR	MRIGDELLEI	NNQILYGRSH
QNASAIIKTA	PSKVKLVFIR	NEDAVNQMAV	TPFPVPSSSP	SSIEDQSGTE
PISSEEDGSV	EVGIKQLPES	ESFKLAVSQM	KQQKYPTKVS	FSSQEIPLAP
ASSYHSTDAD	FTGYGGFQAP	LSVDPATCPI	VPGQEMIIEI	SKGRSGLGLS
IVGGKDTPLN	AIVIHEVYEE	GAAARDGRLW	AGDQILEVNG	VDLRNSSHEE
AITALRQTPQ	KVRLVVYRDE	AHYRDEENLE	IFPVDLQKKA	GRGLGLSIVG
KRNGSGVFIS	DIVKGGAADL	DGRLIQGDQI	LSVNGEDMRN	ASQETVATIL
KCAQGLVQLE	IGRLRAGSWT	SARTTSQNSQ	GSQQSAHSSC	HPSFAPVITG
LQNLVGTKRV	SDPSQKNSGT	DMEPRTVEIN	RELSDALGIS	IAGGRGSPLG
DIPVFIAMIQ	ASGVAARTQK	LKVGDRIVSI	NGQPLDGLSH	ADVVNLLKNA
YGRIILQVVA	DTNISAIAAQ	LENMSTGYHL	GSPTAEHHPE	DTEEQLQMTA
D

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах.

Література

Philipp S., Flockerzi V. (1997). Molecular characterization of a novel PDZ domain protein with homology to INAD from Drosophila melanogaster. FEBS Lett. 413: 243—248. PMID 9280290 DOI:10.1016/S0014-5793(97)00877-6
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Roh M.H., Liu C.-J., Laurinec S., Margolis B. (2002). The carboxyl terminus of zona occludens-3 binds and recruits a mammalian homologue of discs lost to tight junctions. J. Biol. Chem. 277: 27501—27509. PMID 12021270 DOI:10.1074/jbc.M201177200
Nakajima H., Tanoue T. (2011). Lulu2 regulates the circumferential actomyosin tensile system in epithelial cells through p114RhoGEF. J. Cell Biol. 195: 245—261. PMID 22006950 DOI:10.1083/jcb.201104118
Li Y., Karnak D., Demeler B., Margolis B., Lavie A. (2004). Structural basis for L27 domain-mediated assembly of signaling and cell polarity complexes. EMBO J. 23: 2723—2733. PMID 15241471 DOI:10.1038/sj.emboj.7600294

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з PATJ переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:28881 (англ.) . Архів оригіналу за 6 квітня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q8NI35 (англ.) . Архів оригіналу за 21 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.