PARL : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

PARL

Ідентифікатори

Символи

PARL, PSARL, PSARL1, PSENIP2, RHBDS1, PRO2207, presenilin associated rhomboid like

Зовнішні ІД

OMIM: 607858 MGI: 1277152 HomoloGene: 10239 GeneCards: PARL

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0070122 peptidase activity • serine-type peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • serine-type endopeptidase activity • endopeptidase activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мітохондріальна внутрішня мембрана • мембрана • клітинне ядро • мітохондрія
Біологічний процес	• GO:1904489 regulation of reactive oxygen species metabolic process • regulation of protein targeting to mitochondrion • regulation of proteolysis • протеоліз • membrane protein proteolysis • regulation of mitochondrion organization • mitochondrial calcium ion transmembrane transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55486


381038

Ensembl


ENSG00000175193


ENSMUSG00000033918

UniProt


Q9H300


Q5XJY4

RefSeq (мРНК)

NM_001037639 NM_001037640 NM_018622 NM_001324436 NM_001324437
NM_001324438


NM_001005767

RefSeq (білок)


NP_001032728 NP_001311365 NP_001311366 NP_001311367 NP_061092


NP_001005767

Локус (UCSC)

Хр. 3: 183.83 – 183.88 Mb

Хр. 16: 20.1 – 20.12 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PARL (англ. Presenilin associated rhomboid like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 379 амінокислот, а молекулярна маса — 42 190^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAWRGWAQRG	WGCGQAWGAS	VGGRSCEELT	AVLTPPQLLG	RRFNFFIQQK
CGFRKAPRKV	EPRRSDPGTS	GEAYKRSALI	PPVEETVFYP	SPYPIRSLIK
PLFFTVGFTG	CAFGSAAIWQ	YESLKSRVQS	YFDGIKADWL	DSIRPQKEGD
FRKEINKWWN	NLSDGQRTVT	GIIAANVLVF	CLWRVPSLQR	TMIRYFTSNP
ASKVLCSPML	LSTFSHFSLF	HMAANMYVLW	SFSSSIVNIL	GQEQFMAVYL
SAGVISNFVS	YVGKVATGRY	GPSLGASGAI	MTVLAAVCTK	IPEGRLAIIF
LPMFTFTAGN	ALKAIIAMDT	AGMILGWKFF	DHAAHLGGAL	FGIWYVTYGH
ELIWKNREPL	VKIWHEIRTN	GPKKGGGSK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, серинових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, мембрані, мітохондрії, внутрішній мембрані мітохондрії.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Sik A., Passer B.J., Koonin E.V., Pellegrini L. (2004). Self-regulated cleavage of the mitochondrial intramembrane-cleaving protease PARL yields Pbeta, a nuclear-targeted peptide. J. Biol. Chem. 279: 15323—15329. PMID 14732705 DOI:10.1074/jbc.M313756200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18253 (англ.) . Архів оригіналу за 31 березня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9H300 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.