PAN3 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | PAN3, PAN3 poly(A) specific ribonuclease subunit, poly(A) specific ribonuclease subunit PAN3 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 617448 MGI: 1919837 HomoloGene: 6372 GeneCards: PAN3 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • poly(A)-specific ribonuclease activity • protein kinase activity • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • зв'язування з іоном металу • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • PAN complex • P-body |
---|
Біологічний процес | • protein phosphorylation • сортування білків • mRNA processing • RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA • positive regulation of cytoplasmic mRNA processing body assembly • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 13: 28.14 – 28.3 Mb | Хр. 5: 147.37 – 147.49 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PAN3 (англ. PAN3 poly(A) specific ribonuclease subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 887 амінокислот, а молекулярна маса — 95 613[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MNSGGGLPPP | | SAAASPSSSS | | LAAAVAVVAP | | PGVGGVPGGA | | AVGVKLKYCR |
YYAKDKTCFY | | GEECQFLHED | | PAAGAAPGLG | | LHSNSVPLAL | | AGAPVAGFPP |
GAVAGGGAGP | | PPGPKKPDLG | | DPGTGAAAGG | | GGSSGGLDGP | | RLAIPGMDGG |
ALTDTSLTDS | | YFSTSFIGVN | | GFGSPVETKY | | PLMQRMTNSS | | SSPSLLNDSA |
KPYSAHDPLT | | SPASSLFNDF | | GALNISQRRK | | PRKYRLGMLE | | ERLVPMGSKA |
RKAKNPIGCL | | ADRCKSGVPI | | NMVWWNRVTE | | NNLQTPNPTA | | SEFIPKGGST |
SRLSNVSQSN | | MSAFSQVFSH | | PSMGSPATAG | | LAPGMSLSAG | | SSPLHSPKIT |
PHTSPAPRRR | | SHTPNPASYM | | VPSSASTSVN | | NPVSQTPSSG | | QVIQKETVGG |
TTYFYTDTTP | | APLTGMVFPN | | YHIYPPTAPH | | VAYMQPKANA | | PSFFMADELR |
QELINRHLIT | | MAQIDQADMP | | AVPTEVDSYH | | SLFPLEPLPP | | PNRIQKSSNF |
GYITSCYKAV | | NSKDDLPYCL | | RRIHGFRLVN | | TKCMVLVDMW | | KKIQHSNIVT |
LREVFTTKAF | | AEPSLVFAYD | | FHAGGETMMS | | RHFNDPNADA | | YFTKRKWGQH |
EGPLPRQHAG | | LLPESLIWAY | | IVQLSSALRT | | IHTAGLACRV | | MDPTKILITG |
KTRLRVNCVG | | VFDVLTFDNS | | QNNNPLALMA | | QYQQADLISL | | GKVVLALACN |
SLAGIQRENL | | QKAMELVTIN | | YSSDLKNLIL | | YLLTDQNRMR | | SVNDIMPMIG |
ARFYTQLDAA | | QMRNDVIEED | | LAKEVQNGRL | | FRLLAKLGTI | | NERPEFQKDP |
TWSETGDRYL | | LKLFRDHLFH | | QVTEAGAPWI | | DLSHIISCLN | | KLDAGVPEKI |
SLISRDEKSV | | LVVTYSDLKR | | CFENTFQELI | | AAANGQL |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Uchida N., Hoshino S., Katada T. (2004). Identification of a human cytoplasmic poly(A) nuclease complex stimulated by poly(A)-binding protein. J. Biol. Chem. 279: 1383—1391. PMID 14583602 DOI:10.1074/jbc.M309125200
- Braun J.E., Huntzinger E., Fauser M., Izaurralde E. (2011). GW182 proteins directly recruit cytoplasmic deadenylase complexes to miRNA targets. Mol. Cell. 44: 120—133. PMID 21981923 DOI:10.1016/j.molcel.2011.09.007
- Christie M., Boland A., Huntzinger E., Weichenrieder O., Izaurralde E. (2013). Structure of the PAN3 pseudokinase reveals the basis for interactions with the PAN2 deadenylase and the GW182 proteins. Mol. Cell. 51: 360—373. PMID 23932717 DOI:10.1016/j.molcel.2013.07.011
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29991 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q58A45 (англ.) . Архів оригіналу за 3 квітня 2018. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |