NUP50

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2EC1, 3TJ3

Ідентифікатори

Символи

NUP50, NPAP60, NPAP60L, nucleoporin 50kDa, nucleoporin 50

Зовнішні ІД

OMIM: 604646 MGI: 1351502 HomoloGene: 5190 GeneCards: NUP50

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity
Клітинна компонента	• ядерна мембрана • мембрана • нуклеоплазма • клітинне ядро • внутрішньоклітинна мембранна органела • ядерна пора • цитоплазма • центросома • host cell
Біологічний процес	• mRNA transport • intracellular transport • protein transport • GO:0022415 viral process • protein import into nucleus • mRNA export from nucleus • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • regulation of glycolytic process • tRNA export from nucleus • protein sumoylation • viral transcription • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • GO:0046795 intracellular transport of virus • regulation of cellular response to heat
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10762


18141

Ensembl


ENSG00000093000


ENSMUSG00000016619

UniProt


Q9UKX7


Q9JIH2

RefSeq (мРНК)


NM_007172 NM_153645 NM_153684


NM_016714

RefSeq (білок)


NP_009103 NP_705931


NP_057923

Локус (UCSC)

Хр. 22: 45.16 – 45.19 Mb

Хр. 15: 84.81 – 84.83 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NUP50 (англ. Nucleoporin 50) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 468 амінокислот, а молекулярна маса — 50 144^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAKRNAEKEL	TDRNWDQEDE	AEEVGTFSMA	SEEVLKNRAI	KKAKRRNVGF
ESDTGGAFKG	FKGLVVPSGG	GRFSGFGSGA	GGKPLEGLSN	GNNITSAPPF
ASAKAAADPK	VAFGSLAANG	PTTLVDKVSN	PKTNGDSQQP	SSSGLASSKA
CVGNAYHKQL	AALNCSVRDW	IVKHVNTNPL	CDLTPIFKDY	EKYLANIEQQ
HGNSGRNSES	ESNKVAAETQ	SPSLFGSTKL	QQESTFLFHG	NKTEDTPDKK
MEVASEKKTD	PSSLGATSAS	FNFGKKVDSS	VLGSLSSVPL	TGFSFSPGNS
SLFGKDTTQS	KPVSSPFPTK	PLEGQAEGDS	GECKGGDEEE	NDEPPKVVVT
EVKEEDAFYS	KKCKLFYKKD	NEFKEKGIGT	LHLKPTANQK	TQLLVRADTN
LGNILLNVLI	PPNMPCTRTG	KNNVLIVCVP	NPPIDEKNAT	MPVTMLIRVK
TSEDADELHK	ILLEKKDA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, мембрані, комплексі ядерної пори.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hase M.E., Cordes V.C. (2003). Direct interaction with nup153 mediates binding of Tpr to the periphery of the nuclear pore complex. Mol. Biol. Cell. 14: 1923—1940. PMID 12802065 DOI:10.1091/mbc.E02-09-0620
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Trichet V., Shkolny D., Dunham I., Beare D., McDermid H.E. (1999). Mapping and complex expression pattern of the human NPAP60L nucleoporin gene. Cytogenet. Cell Genet. 85: 221—226. PMID 10449902

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8065 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9UKX7 (англ.) . Архів оригіналу за 22 лютого 2018. Процитовано 12 вересня 2017.