NUP205

Наявні структури

Пошук для людей: PDBe RCSB

Список кодів PDB
5IJN, 5IJO

Ідентифікатори

Символи

NUP205, C7orf14, NPHS13, nucleoporin 205kDa, nucleoporin 205

Зовнішні ІД

OMIM: 614352 MGI: 2141625 HomoloGene: 45971 GeneCards: NUP205

Пов'язані генетичні захворювання

mammary Paget's disease^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0005487 structural constituent of nuclear pore • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• ядерна мембрана • nuclear envelope • мембрана • nuclear periphery • nuclear pore inner ring • ядерна пора • клітинне ядро • host cell
Біологічний процес	• mRNA transport • nuclear pore complex assembly • viral transcription • protein sumoylation • mitotic nuclear membrane disassembly • nucleocytoplasmic transport • regulation of cellular response to heat • protein transport • GO:0022415 viral process • GO:0046795 intracellular transport of virus • tRNA export from nucleus • mRNA export from nucleus • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • regulation of glycolytic process • GO:0015915 транспорт • nuclear pore organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23165


70699

Ensembl


ENSG00000155561


ENSMUSG00000038759

UniProt


Q92621


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_015135 NM_001329434


NM_027513

RefSeq (білок)


NP_001316363 NP_055950


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 7: 135.56 – 135.65 Mb

Хр. 6: 35.15 – 35.22 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NUP205 (англ. Nucleoporin 205) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 012 амінокислот, а молекулярна маса — 227 922^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATPLAVNSA	ASLWGPYKDI	WHKVGNALWR	RQPEAVHLLD	KILKKHKPDF
ISLFKNPPKN	VQQHEKVQKA	STEGVAIQGQ	QGTRLLPEQL	IKEAFILSDL
FDIGELAAVE	LLLAGEHQQP	HFPGLTRGLV	AVLLYWDGKR	CIANSLKALI
QSRRGKTWTL	ELSPELASMT	TRFTDELMEQ	GLTYKVLTLV	SQIDVNNEFE
KLQRERGLGS	EKHRKEVSDL	IKECRQSLAE	SLFAWACQSP	LGKEDTLLLI
GHLERVTVEA	NGSLDAVNLA	LLMALLYCFD	ISFIEQSTEE	RDDMIHQLPL
LTEKQYIATI	HSRLQDSQLW	KLPGLQATVR	LAWALALRGI	SQLPDVTALA
EFTEADEAMA	ELAIADNVFL	FLMESVVVSE	YFYQEEFYIR	RVHNLITDFL
ALMPMKVKQL	RNRADEDARM	IHMSMQMGNE	PPISLRRDLE	HLMLLIGELY
KKNPFHLELA	LEYWCPTEPL	QTPTIMGSYL	GVAHQRPPQR	QVVLSKFVRQ
MGDLLPPTIY	IPYLKMLQGL	ANGPQCAHYC	FSLLKVNGSS	HVENIQGAGG
SPVSWEHFFH	SLMLYHEHLR	KDLPSADSVQ	YRHLPSRGIT	QKEQDGLIAF
LQLTSTIITW	SENARLALCE	HPQWTPVVVI	LGLLQCSIPP	VLKAELLKTL
AAFGKSPEIA	ASLWQSLEYT	QILQTVRIPS	QRQAIGIEVE	LNEIESRCEE
YPLTRAFCQL	ISTLVESSFP	SNLGAGLRPP	GFDPYLQFLR	DSVFLRFRTR
AYRRAAEKWE	VAEVVLEVFY	KLLRDYEPQL	EDFVDQFVEL	QGEEIIAYKP
PGFSLMYHLL	NESPMLELAL	SLLEEGVKQL	DTYAPFPGKK	HLEKAVQHCL
ALLNLTLQKE	NLFMDLLRES	QLALIVCPLE	QLLQGINPRT	KKADNVVNIA
RYLYHGNTNP	ELAFESAKIL	CCISCNSNIQ	IKLVGDFTHD	QSISQKLMAG
FVECLDCEDA	EEFVRLEEGS	ELEKKLVAIR	HETRIHILNL	LITSLECNPP
NLALYLLGFE	LKKPVSTTNL	QDPGVLGCPR	TCLHAILNIL	EKGTEGRTGP
VAVRESPQLA	ELCYQVIYQL	CACSDTSGPT	MRYLRTSQDF	LFSQLQYLPF
SNKEYEISML	NQMSWLMKTA	SIELRVTSLN	RQRSHTQRLL	HLLLDDMPVK
PYSDGEGGIE	DENRSVSGFL	HFDTATKVRR	KILNILDSID	FSQEIPEPLQ
LDFFDRAQIE	QVIANCEHKN	LRGQTVCNVK	LLHRVLVAEV	NALQGMAAIG
QRPLLMEEIS	TVLQYVVGRN	KLLQCLHAKR	HALESWRQLV	EIILTACPQD
LIQAEDRQLI	IRDILQDVHD	KILDDEAAQE	LMPVVAGAVF	TLTAHLSQAV
LTEQKETSVL	GPAEAHYAFM	LDSCFTSPPP	EENPLVGFAS	IGDSSLYIIL
KKLLDFILKT	GGGFQRVRTH	LYGSLLYYLQ	IAQRPDEPDT	LEAAKKTMWE
RLTAPEDVFS	KLQRENIAII	ESYGAALMEV	VCRDACDGHE	IGRMLALALL
DRIVSVDKQQ	QWLLYLSNSG	YLKVLVDSLV	EDDRTLQSLL	TPQPPLLKAL
YTYESKMAFL	TRVAKIQQGA	LELLRSGVIV	RLAQCQVYDM	RPETDPQSMF
GMRDPPMFIP	TPVDRYRQIL	LPALQLCQVI	LTSSMAQHLQ	AAGQVLQFLI
SHSDTIQAIL	RCQDVSAGSL	QELALLTGII	SKAALPGILS	ELDVDVNEGS
LMELQGHIGR	FQRQCLGLLS	RFGGSDRLRQ	FKFQDDNVEG	DKVSKKDEIE
LAMQQICANV	MEYCQSLMLQ	SSPTFQHAVC	LFTPSLSETV	NRDGPRQDTQ
APVVPYWRLP	GLGIIIYLLK	QSANDFFSYY	DSHRQSVSKL	QNVEQLPPDE
IKELCQSVMP	AGVDKISTAQ	KYVLARRRLV	KVINNRAKLL	SLCSFIIETC
LFILWRHLEY	YLLHCMPTDS	QDSLFASRTL	FKSRRLQDSF	ASETNLDFRS
GLAIVSQHDL	DQLQADAINA	FGESLQKKLL	DIEGLYSKVR	SRYSFIQALV
RRIRGLLRIS	RN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, ацетилювання. Локалізований у ядрі, мембрані, комплексі ядерної пори.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hase M.E., Cordes V.C. (2003). Direct interaction with nup153 mediates binding of Tpr to the periphery of the nuclear pore complex. Mol. Biol. Cell. 14: 1923—1940. PMID 12802065 DOI:10.1091/mbc.E02-09-0620
Krull S., Thyberg J., Bjorkroth B., Rackwitz H.R., Cordes V.C. (2004). Nucleoporins as components of the nuclear pore complex core structure and Tpr as the architectural element of the nuclear basket. Mol. Biol. Cell. 15: 4261—4277. PMID 15229283 DOI:10.1091/mbc.E04-03-0165
Hawryluk-Gara L.A., Shibuya E.K., Wozniak R.W. (2005). Vertebrate Nup53 interacts with the nuclear lamina and is required for the assembly of a Nup93-containing complex. Mol. Biol. Cell. 16: 2382—2394. PMID 15703211 DOI:10.1091/mbc.E04-10-0857

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з NUP205 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18658 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q92621 (англ.) . Архів оригіналу за 26 березня 2018. Процитовано 7 вересня 2017.