NUFIP1

Ідентифікатори

Символи

NUFIP1, NUFIP, bA540M5.1, FMR1 interacting protein 1, nuclear FMR1 interacting protein 1, Rsa1

Зовнішні ІД

OMIM: 604354 MGI: 1351474 HomoloGene: 8216 GeneCards: NUFIP1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATPase binding • identical protein binding • protein-macromolecule adaptor activity • snoRNA binding • RNA binding • зв'язування з іоном металу • DNA binding • nucleic acid binding
Клітинна компонента	• nuclear matrix • клітинне ядро • pre-snoRNP complex • perichromatin fibrils • ядерце • cytosolic ribosome • transcription elongation factor complex • fibrillar center • presynaptic active zone • GO:0009327 protein-containing complex • синапс
Біологічний процес	• box C/D snoRNP assembly • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • protein complex oligomerization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


26747


27275

Ensembl


ENSG00000083635


ENSMUSG00000022009

UniProt


Q9UHK0


Q9QXX8

RefSeq (мРНК)


NM_012345


NM_013745

RefSeq (білок)


NP_036477


NP_038773

Локус (UCSC)

Хр. 13: 44.94 – 44.99 Mb

Хр. 14: 76.35 – 76.37 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NUFIP1 (англ. NUFIP1, FMR1 interacting protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 495 амінокислот, а молекулярна маса — 56 300^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAEPTSDFET	PIGWHASPEL	TPTLGPLSDT	APPRDSWMFW	AMLPPPPPPL
TSSLPAAGSK	PSSESQPPME	AQSLPGAPPP	FDAQILPGAQ	PPFDAQSPLD
SQPQPSGQPW	NFHASTSWYW	RQSSDRFPRH	QKSFNPAVKN	SYYPRKYDAK
FTDFSLPPSR	KQKKKKRKEP	VFHFFCDTCD	RGFKNQEKYD	KHMSEHTKCP
ELDCSFTAHE	KIVQFHWRNM	HAPGMKKIKL	DTPEEIARWR	EERRKNYPTL
ANIERKKKLK	LEKEKRGAVL	TTTQYGKMKG	MSRHSQMAKI	RSPGKNHKWK
NDNSRQRAVT	GSGSHLCDLK	LEGPPEANAD	PLGVLINSDS	ESDKEEKPQH
SVIPKEVTPA	LCSLMSSYGS	LSGSESEPEE	TPIKTEADVL	AENQVLDSSA
PKSPSQDVKA	TVRNFSEAKS	ENRKKSFEKT	NPKRKKDYHN	YQTLFEPRTH
HPYLLEMLLA	PDIRHERNVI	LQCVRYIIKK	DFFGLDTNSA	KSKDV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

Bardoni B., Schenck A., Mandel J.-L. (1999). A novel RNA-binding nuclear protein that interacts with the fragile X mental retardation (FMR1) protein. Hum. Mol. Genet. 8: 2557—2566. PMID 10556305 DOI:10.1093/hmg/8.13.2557
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8057 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9UHK0 (англ.) . Архів оригіналу за 31 грудня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.