NOP58 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | NOP58, NOP5, NOP5/HSPC120, NOP58 ribonucleoprotein |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 616742 MGI: 1933184 HomoloGene: 7024 GeneCards: NOP58 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • ATPase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • TFIID-class transcription factor complex binding • snoRNA binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • small-subunit processome • Тільце Кахаля • pre-snoRNP complex • мембрана • нуклеоплазма • ядерце • клітинне ядро • box C/D RNP complex • sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex • fibrillar center • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • ribosome biogenesis • snoRNA localization • cell growth • rRNA processing • rRNA modification |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 202.27 – 202.3 Mb | Хр. 1: 59.72 – 59.76 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
NOP58 (англ. NOP58 ribonucleoprotein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 529 амінокислот, а молекулярна маса — 59 578[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MLVLFETSVG | | YAIFKVLNEK | | KLQEVDSLWK | | EFETPEKANK | | IVKLKHFEKF |
QDTAEALAAF | | TALMEGKINK | | QLKKVLKKIV | | KEAHEPLAVA | | DAKLGGVIKE |
KLNLSCIHSP | | VVNELMRGIR | | SQMDGLIPGV | | EPREMAAMCL | | GLAHSLSRYR |
LKFSADKVDT | | MIVQAISLLD | | DLDKELNNYI | | MRCREWYGWH | | FPELGKIISD |
NLTYCKCLQK | | VGDRKNYASA | | KLSELLPEEV | | EAEVKAAAEI | | SMGTEVSEED |
ICNILHLCTQ | | VIEISEYRTQ | | LYEYLQNRMM | | AIAPNVTVMV | | GELVGARLIA |
HAGSLLNLAK | | HAASTVQILG | | AEKALFRALK | | SRRDTPKYGL | | IYHASLVGQT |
SPKHKGKISR | | MLAAKTVLAI | | RYDAFGEDSS | | SAMGVENRAK | | LEARLRTLED |
RGIRKISGTG | | KALAKTEKYE | | HKSEVKTYDP | | SGDSTLPTCS | | KKRKIEQVDK |
EDEITEKKAK | | KAKIKVKVEE | | EEEEKVAEEE | | ETSVKKKKKR | | GKKKHIKEEP |
LSEEEPCTST | | AIASPEKKKK | | KKKKRENED |
Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як біогенез рибосом. Локалізований у ядрі.
Література
- Lyman S.K., Gerace L., Baserga S.J. (1999). Human Nop5/Nop58 is a component common to the box C/D small nucleolar ribonucleoproteins. RNA. 5: 1597—1604. PMID 10606270 DOI:10.1017/S1355838299991288
- Nelson S.A., Santora K.E., LaRochelle W.J. (2000). Isolation and characterization of a novel PDGF-induced human gene. Gene. 253: 87—93. PMID 10925205 DOI:10.1016/S0378-1119(00)00232-8
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Watkins N.J., Dickmanns A., Luhrmann R. (2002). Conserved stem II of the box C/D motif is essential for nucleolar localization and is required, along with the 15.5K protein, for the hierarchical assembly of the box C/D snoRNP. Mol. Cell. Biol. 22: 8342—8352. PMID 12417735 DOI:10.1128/MCB.22.23.8342-8352.2002
- McKeegan K.S., Debieux C.M., Boulon S., Bertrand E., Watkins N.J. (2007). A dynamic scaffold of pre-snoRNP factors facilitates human box C/D snoRNP assembly. Mol. Cell. Biol. 27: 6782—6793. PMID 17636026 DOI:10.1128/MCB.01097-07
- Watkins N.J., Lemm I., Luhrmann R. (2007). Involvement of nuclear import and export factors in U8 box C/D snoRNP biogenesis. Mol. Cell. Biol. 27: 7018—7027. PMID 17709390 DOI:10.1128/MCB.00516-07
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29926 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9Y2X3 (англ.) . Архів оригіналу за 22 лютого 2018. Процитовано 21 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |