NLRX1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3UN9

Ідентифікатори

Символи

NLRX1, CLR11.3, DLNB26, NOD26, NOD5, NOD9, NLR family member X1

Зовнішні ІД

OMIM: 611947 MGI: 2429611 HomoloGene: 11623 GeneCards: NLRX1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding
Клітинна компонента	• мітохондріальна зовнішня мембрана • мембрана • мітохондрія • клітинна мембрана • міжклітинні контакти • цитоплазма
Біологічний процес	• negative regulation of interleukin-6 production • negative regulation of type I interferon production • GO:0022415 viral process • negative regulation of inflammatory response • negative regulation of interferon-beta production • negative regulation of RIG-I signaling pathway • negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • процес імунної системи • negative regulation of innate immune response • вроджений імунітет • GO:0007243 intracellular signal transduction
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


79671


270151

Ensembl


ENSG00000160703


ENSMUSG00000032109

UniProt


Q86UT6


Q3TL44

RefSeq (мРНК)


NM_001282143 NM_001282144 NM_001282358 NM_024618 NM_170722


NM_001163742 NM_001163743 NM_178420

RefSeq (білок)


NP_001269072 NP_001269073 NP_001269287 NP_078894


NP_001157214 NP_001157215 NP_848507

Локус (UCSC)

Хр. 11: 119.17 – 119.18 Mb

Хр. 9: 44.16 – 44.18 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NLRX1 (англ. NLR family member X1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 975 амінокислот, а молекулярна маса — 107 616^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRWGHHLPRA	SWGSGFRRAL	QRPDDRIPFL	IHWSWPLQGE	RPFGPPRAFI
RHHGSSVDSA	PPPGRHGRLF	PSASATEAIQ	RHRRNLAEWF	SRLPREERQF
GPTFALDTVH	VDPVIRESTP	DELLRPPAEL	ALEHQPPQAG	LPPLALSQLF
NPDACGRRVQ	TVVLYGTVGT	GKSTLVRKMV	LDWCYGRLPA	FELLIPFSCE
DLSSLGPAPA	SLCQLVAQRY	TPLKEVLPLM	AAAGSHLLFV	LHGLEHLNLD
FRLAGTGLCS	DPEEPQEPAA	IIVNLLRKYM	LPQASILVTT	RPSAIGRIPS
KYVGRYGEIC	GFSDTNLQKL	YFQLRLNQPY	CGYAVGGSGV	SATPAQRDHL
VQMLSRNLEG	HHQIAAACFL	PSYCWLVCAT	LHFLHAPTPA	GQTLTSIYTS
FLRLNFSGET	LDSTDPSNLS	LMAYAARTMG	KLAYEGVSSR	KTYFSEEDVC
GCLEAGIRTE	EEFQLLHIFR	RDALRFFLAP	CVEPGRAGTF	VFTVPAMQEY
LAALYIVLGL	RKTTLQKVGK	EVAELVGRVG	EDVSLVLGIM	AKLLPLRALP
LLFNLIKVVP	RVFGRMVGKS	REAVAQAMVL	EMFREEDYYN	DDVLDQMGAS
ILGVEGPRRH	PDEPPEDEVF	ELFPMFMGGL	LSAHNRAVLA	QLGCPIKNLD
ALENAQAIKK	KLGKLGRQVL	PPSELLDHLF	FHYEFQNQRF	SAEVLSSLRQ
LNLAGVRMTP	VKCTVVAAVL	GSGRHALDEV	NLASCQLDPA	GLRTLLPVFL
RARKLGLQLN	SLGPEACKDL	RDLLLHDQCQ	ITTLRLSNNP	LTAAGVAVLM
EGLAGNTSVT	HLSLLHTGLG	DEGLELLAAQ	LDRNRQLQEL	NVAYNGAGDT
AALALARAAR	EHPSLELLHL	YFNELSSEGR	QVLRDLGGAA	EGGARVVVSL
TEGTAVSEYW	SVILSEVQRN	LNSWDRARVQ	RHLELLLRDL	EDSRGATLNP
WRKAQLLRVE	GEVRALLEQL	GSSGS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у мембрані, мітохондрії, зовнішній мембрані мітохондрій.

Література

Inohara N., Nunez G. (2003). NODs: intracellular proteins involved in inflammation and apoptosis. Nat. Rev. Immunol. 3: 371—382. PMID 12766759 DOI:10.1038/nri1086
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Inohara N., Chamaillard M., McDonald C., Nunez G. (2005). NOD-LRR proteins: role in host-microbial interactions and inflammatory disease. Annu. Rev. Biochem. 74: 355—383. PMID 15952891 DOI:10.1146/annurev.biochem.74.082803.133347
Ting J.P.-Y., Davis B.K. (2005). CATERPILLER: a novel gene family important in immunity, cell death, and diseases. Annu. Rev. Immunol. 23: 387—414. PMID 15771576 DOI:10.1146/annurev.immunol.23.021704.115616
Hong M., Yoon S.I., Wilson I.A. (2012). Structure and functional characterization of the RNA-binding element of the NLRX1 innate immune modulator. Immunity. 36: 337—347. PMID 22386589 DOI:10.1016/j.immuni.2011.12.018

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29890 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q86UT6 (англ.) . Архів оригіналу за 10 листопада 2012. Процитовано 8 вересня 2017.