NLRP6 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | NLRP6, AVR, CLR11.4, NALP6, NAVR, NAVR/AVR, PAN3, PYPAF5, NLR family, pyrin domain containing 6, NLR family pyrin domain containing 6 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 609650 MGI: 2141990 HomoloGene: 15881 GeneCards: NLRP6 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • активність рецепторів вазопресину • ATP binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • ядерна мембрана • мембрана • клітинна мембрана • inflammasome complex • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • response to bacterium • процес імунної системи • Загоєння ран • regulation of mucus secretion • negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • negative regulation of immune response • regulation of autophagy • negative regulation of toll-like receptor signaling pathway • negative regulation of inflammatory response to antigenic stimulus • regulation of inflammatory response • negative regulation of MAPK cascade • negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade • вроджений імунітет • inflammatory response • G protein-coupled receptor signaling pathway |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 0.28 – 0.29 Mb | Хр. 7: 140.5 – 140.51 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
NLRP6 (англ. NLR family pyrin domain containing 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 892 амінокислот, а молекулярна маса — 98 768[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDQPEAPCSS | | TGPRLAVARE | | LLLAALEELS | | QEQLKRFRHK | | LRDVGPDGRS |
IPWGRLERAD | | AVDLAEQLAQ | | FYGPEPALEV | | ARKTLKRADA | | RDVAAQLQER |
RLQRLGLGSG | | TLLSVSEYKK | | KYREHVLQLH | | ARVKERNARS | | VKITKRFTKL |
LIAPESAAPE | | EAMGPAEEPE | | PGRARRSDTH | | TFNRLFRRDE | | EGRRPLTVVL |
QGPAGIGKTM | | AAKKILYDWA | | AGKLYQGQVD | | FAFFMPCGEL | | LERPGTRSLA |
DLILDQCPDR | | GAPVPQMLAQ | | PQRLLFILDG | | ADELPALGGP | | EAAPCTDPFE |
AASGARVLGG | | LLSKALLPTA | | LLLVTTRAAA | | PGRLQGRLCS | | PQCAEVRGFS |
DKDKKKYFYK | | YFRDERRAER | | AYRFVKENET | | LFALCFVPFV | | CWIVCTVLRQ |
QLELGRDLSR | | TSKTTTSVYL | | LFITSVLSSA | | PVADGPRLQG | | DLRNLCRLAR |
EGVLGRRAQF | | AEKELEQLEL | | RGSKVQTLFL | | SKKELPGVLE | | TEVTYQFIDQ |
SFQEFLAALS | | YLLEDGGVPR | | TAAGGVGTLL | | RGDAQPHSHL | | VLTTRFLFGL |
LSAERMRDIE | | RHFGCMVSER | | VKQEALRWVQ | | GQGQGCPGVA | | PEVTEGAKGL |
EDTEEPEEEE | | EGEEPNYPLE | | LLYCLYETQE | | DAFVRQALCR | | FPELALQRVR |
FCRMDVAVLS | | YCVRCCPAGQ | | ALRLISCRLV | | AAQEKKKKSL | | GKRLQASLGG |
GSSSQGTTKQ | | LPASLLHPLF | | QAMTDPLCHL | | SSLTLSHCKL | | PDAVCRDLSE |
ALRAAPALTE | | LGLLHNRLSE | | AGLRMLSEGL | | AWPQCRVQTV | | RVQLPDPQRG |
LQYLVGMLRQ | | SPALTTLDLS | | GCQLPAPMVT | | YLCAVLQHQG | | CGLQTLSLAS |
VELSEQSLQE | | LQAVKRAKPD | | LVITHPALDG | | HPQPPKELIS | | TF |
Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані.
Література
- Tschopp J., Martinon F., Burns K. (2003). NALPs: a novel protein family involved in inflammation. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 4: 95—104. PMID 12563287 DOI:10.1038/nrm1019
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:22944 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, P59044 (англ.) . Архів оригіналу за 10 листопада 2012. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |