NHP2

Ідентифікатори

Символи

NHP2, DKCB2, NHP2P, NOLA2, NHP2 ribonucleoprotein

Зовнішні ІД

OMIM: 606470 MGI: 1098547 HomoloGene: 5524 GeneCards: NHP2

Пов'язані генетичні захворювання

autosomal recessive dyskeratosis congenita 2^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• box H/ACA snoRNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • telomerase RNA binding • snoRNA binding • RNA binding
Клітинна компонента	• sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex • Тільце Кахаля • box H/ACA telomerase RNP complex • box H/ACA scaRNP complex • ядерце • telomerase holoenzyme complex • box H/ACA snoRNP complex • клітинне ядро • cytosolic large ribosomal subunit • нуклеоплазма
Біологічний процес	• telomere maintenance via telomerase • ribosome biogenesis • positive regulation of telomerase RNA localization to Cajal body • rRNA processing • cleavage involved in rRNA processing • snRNA pseudouridine synthesis • maturation of LSU-rRNA • Біосинтез білків • rRNA pseudouridine synthesis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55651


52530

Ensembl


ENSG00000145912


ENSMUSG00000001056

UniProt


Q9NX24


Q9CRB2

RefSeq (мРНК)


NM_017838 NM_001034833 NM_001396110


NM_026631 NM_001364736

RefSeq (білок)


NP_001030005 NP_060308


NP_080907 NP_001351665

Локус (UCSC)

Хр. 5: 178.15 – 178.15 Mb

Хр. 11: 51.51 – 51.51 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NHP2 (англ. NHP2 ribonucleoprotein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 153 амінокислот, а молекулярна маса — 17 201^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTKIKADPDG	PEAQAEACSG	ERTYQELLVN	QNPIAQPLAS	RRLTRKLYKC
IKKAVKQKQI	RRGVKEVQKF	VNKGEKGIMV	LAGDTLPIEV	YCHLPVMCED
RNLPYVYIPS	KTDLGAAAGS	KRPTCVIMVK	PHEEYQEAYD	ECLEEVQSLP
LPL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесінг рРНК, біогенез рибосом, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

Pogacic V., Dragon F., Filipowicz W. (2000). Human H/ACA small nucleolar RNPs and telomerase share evolutionarily conserved proteins NHP2 and NOP10. Mol. Cell. Biol. 20: 9028—9040. PMID 11074001 DOI:10.1128/MCB.20.23.9028-9040.2000
Kang H.S., Jung H.M., Jun D., Huh T.L., Kim Y.H. (2002). Expression of the human homologue of the small nucleolar RNA-binding protein NHP2 gene during monocytic differentiation of U937 cells. Biochim. Biophys. Acta. 1575: 31—39. PMID 12020816 DOI:10.1016/S0167-4781(02)00240-3
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wang C., Meier U.T. (2004). Architecture and assembly of mammalian H/ACA small nucleolar and telomerase ribonucleoproteins. EMBO J. 23: 1857—1867. PMID 15044956 DOI:10.1038/sj.emboj.7600181
Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з NHP2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14377 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9NX24 (англ.) . Архів оригіналу за 22 лютого 2018. Процитовано 5 вересня 2017.