NDC1

Ідентифікатори

Символи

NDC1, NET3, TMEM48, NDC1 transmembrane nucleoporin

Зовнішні ІД

OMIM: 610115 MGI: 1920037 HomoloGene: 41224 GeneCards: NDC1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0005487 structural constituent of nuclear pore
Клітинна компонента	• цитоплазма • integral component of membrane • ядерна мембрана • nuclear envelope • мембрана • клітинна мембрана • ядерна пора • actin cytoskeleton • клітинне ядро • spindle pole body • nuclear pore transmembrane ring • host cell
Біологічний процес	• mRNA transport • nuclear pore complex assembly • viral transcription • protein sumoylation • mitotic nuclear membrane disassembly • homologous chromosome pairing at meiosis • Сперматогенез • protein transport • regulation of cellular response to heat • GO:0022415 viral process • mRNA export from nucleus • GO:0046795 intracellular transport of virus • tRNA export from nucleus • spindle pole body duplication • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • regulation of glycolytic process • GO:0015915 транспорт • nuclear pore organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55706


72787

Ensembl


ENSG00000058804


ENSMUSG00000028614

UniProt


Q9BTX1


Q8VCB1

RefSeq (мРНК)


NM_001168551 NM_018087


NM_028355

RefSeq (білок)


NP_001162023 NP_060557


NP_082631

Локус (UCSC)

Хр. 1: 53.77 – 53.84 Mb

Хр. 4: 107.22 – 107.27 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NDC1 (англ. NDC1 transmembrane nucleoporin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 674 амінокислот, а молекулярна маса — 76 305^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATAVSRPCA	GRSRDILWRV	LGWRIVASIV	WSVLFLPICT	TVFIIFSRID
LFHPIQWLSD	SFSDLYSSYV	IFYFLLLSVV	IIIISIFNVE	FYAVVPSIPC
SRLALIGKII	HPQQLMHSFI	HAAMGMVMAW	CAAVITQGQY	SFLVVPCTGT
NSFGSPAAQT	CLNEYHLFFL	LTGAFMGYSY	SLLYFVNNMN	YLPFPIIQQY
KFLRFRRSLL	LLVKHSCVES	LFLVRNFCIL	YYFLGYIPKA	WISTAMNLHI
DEQVHRPLDT	VSGLLNLSLL	YHVWLCGVFL	LTTWYVSWIL	FKIYATEAHV
FPVQPPFAEG	SDECLPKVLN	SNPPPIIKYL	ALQDLMLLSQ	YSPSRRQEVF
SLSQPGGHPH	NWTAISRECL	NLLNGMTQKL	ILYQEAAATN	GRVSSSYPVE
PKKLNSPEET	AFQTPKSSQM	PRPSVPPLVK	TSLFSSKLST	PDVVSPFGTP
FGSSVMNRMA	GIFDVNTCYG	SPQSPQLIRR	GPRLWTSASD	QQMTEFSNPS
PSTSISAEGK	TMRQPSVIYS	WIQNKREQIK	NFLSKRVLIM	YFFSKHPEAS
IQAVFSDAQM	HIWALEGLSH	LVAASFTEDR	FGVVQTTLPA	ILNTLLTLQE
AVDKYFKLPH	ASSKPPRISG	SLVDTSYKTL	RFAFRASLKT	AIYRITTTFG
EHLNAVQASA	EHQKRLQQFL	EFKE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, мембрані, комплексі ядерної пори.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Schirmer E.C., Florens L., Guan T., Yates J.R. III, Gerace L. (2003). Nuclear membrane proteins with potential disease links found by subtractive proteomics. Science. 301: 1380—1382. PMID 12958361 DOI:10.1126/science.1088176
Kind B., Koehler K., Lorenz M., Huebner A. (2009). The nuclear pore complex protein ALADIN is anchored via NDC1 but not via POM121 and GP210 in the nuclear envelope. Biochem. Biophys. Res. Commun. 390: 205—210. PMID 19782045 DOI:10.1016/j.bbrc.2009.09.080

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25525 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9BTX1 (англ.) . Архів оригіналу за 7 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.