NCOA6

Ідентифікатори

Символи

NCOA6, AIB3, ASC2, NRC, PRIP, RAP250, TRBP, nuclear receptor coactivator 6

Зовнішні ІД

OMIM: 605299 HomoloGene: 40920 GeneCards: NCOA6

Онтологія гена
Молекулярна функція	• chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • enzyme binding • estrogen receptor binding • retinoid X receptor binding • nuclear receptor coactivator activity • thyroid hormone receptor binding • GO:0001105 transcription coactivator activity
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинна мембранна органела • transcription regulator complex • нуклеоплазма • клітинне ядро • histone methyltransferase complex • гіалоплазма
Біологічний процес	• myeloid cell differentiation • DNA recombination • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • реплікація ДНК • heart development • brain development • DNA-templated transcription, initiation • response to hormone • GO:0100026 Репарація ДНК • intracellular estrogen receptor signaling pathway • glucocorticoid receptor signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of lipid metabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23054


116464

Ensembl


ENSG00000198646


ENSRNOG00000018288

UniProt


Q14686


G3V8C9

RefSeq (мРНК)


NM_001242539 NM_014071 NM_001318240


NM_001276714

RefSeq (білок)


NP_001229468 NP_001305169 NP_054790


NP_001263643

Локус (UCSC)

Хр. 20: 34.69 – 34.83 Mb

н/д

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NCOA6 (англ. Nuclear receptor coactivator 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 063 амінокислот, а молекулярна маса — 219 145^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVLDDLPNLE	DIYTSLCSST	MEDSEMDFDS	GLEDDDTKSD	SILEDSTIFV
AFKGNIDDKD	FKWKLDAILK	NVPNLLHMES	SKLKVQKVEP	WNSVRVTFNI
PREAAERLRI	LAQSNNQQLR	DLGILSVQIE	GEGAINLALA	QNRSQDVRMN
GPMGAGNSVR	MEAGFPMASG	PGIIRMNNPA	TVMIPPGGNV	SSSMMAPGPN
PELQPRTPRP	ASQSDAMDPL	LSGLHIQQQS	HPSGSLAPPH	HPMQPVSVNR
QMNPANFPQL	QQQQQQQQQQ	QQQQQQQQQQ	QQQQQLQARP	PQQHQQQQPQ
GIRPQFTAPT	QVPVPPGWNQ	LPSGALQPPP	AQGSLGTMTA	NQGWKKAPLP
GPMQQQLQAR	PSLATVQTPS	HPPPPYPFGS	QQASQAHTNF	PQMSNPGQFT
APQMKSLQGG	PSRVPTPLQQ	PHLTNKSPAS	SPSSFQQGSP	ASSPTVNQTQ
QQMGPRPPQN	NPLPQGFQQP	VSSPGRNPMV	QQGNVPPNFM	VMQQQPPNQG
PQSLHPGLGG	MPKRLPPGFS	AGQANPNFMQ	GQVPSTTATT	PGNSGAPQLQ
ANQNVQHAGG	QGAGPPQNQM	QVSHGPPNMM	QPSLMGIHGN	MNNQQAGTSG
VPQVNLSNMQ	GQPQQGPPSQ	LMGMHQQIVP	SQGQMVQQQG	TLNPQNPMIL
SRAQLMPQGQ	MMVNPPSQNL	GPSPQRMTPP	KQMLSQQGPQ	MMAPHNQMMG
PQGQVLLQQN	PMIEQIMTNQ	MQGNKQQFNT	QNQSNVMPGP	AQIMRGPTPN
MQGNMVQFTG	QMSGQMLPQQ	GPVNNSPSQV	MGIQGQVLRP	PGPSPHMAQQ
HGDPATTANN	DVSLSQMMPD	VSIQQTNMVP	PHVQAMQGNS	ASGNHFSGHG
MSFNAPFSGA	PNGNQMSCGQ	NPGFPVNKDV	TLTSPLLVNL	LQSDISAGHF
GVNNKQNNTN	ANKPKKKKPP	RKKKNSQQDL	NTPDTRPAGL	EEADQPPLPG
EQGINLDNSG	PKLPEFSNRP	PGYPSQPVEQ	RPLQQMPPQL	MQHVAPPPQP
PQQQPQPQLP	QQQQPPPPSQ	PQSQQQQQQQ	QQMMMMLMMQ	QDPKSVRLPV
SQNVHPPRGP	LNPDSQRMPM	QQSGSVPVMV	SLQGPASVPP	SPDKQRMPMP
VNTPLGSNSR	KMVYQESPQN	PSSSPLAEMA	SLPEASGSEA	PSVPGGPNNM
PSHVVLPQNQ	LMMTGPKPGP	SPLSATQGAT	PQQPPVNSLP	SSHGHHFPNV
AAPTQTSRPK	TPNRASPRPY	YPQTPNNRPP	STEPSEISLS	PERLNASIAG
LFPPQINIPL	PPRPNLNRGF	DQQGLNPTTL	KAIGQAPSNL	TMNPSNFATP
QTHKLDSVVV	NSGKQSNSGA	TKRASPSNSR	RSSPGSSRKT	TPSPGRQNSK
APKLTLASQT	NAALLQNVEL	PRNVLVSPTP	LANPPVPGSF	PNNSGLNPQN
STVSVAAVGG	VVEDNKESLN	VPQDSDCQNS	QSRKEQVNIE	LKAVPAQEVK
MVVPEDQSKK	DGQPSDPNKL	PSVEENKNLV	SPAMREAPTS	LSQLLDNSGA
PNVTIKPPGL	TDLEVTPPVV	SGEDLKKASV	IPTLQDLSSS	KEPSNSLNLP
HSNELCSSLV	HPELSEVSSN	VAPSIPPVMS	RPVSSSSIST	PLPPNQITVF
VTSNPITTSA	NTSAALPTHL	QSALMSTVVT	MPNAGSKVMV	SEGQSAAQSN
ARPQFITPVF	INSSSIIQVM	KGSQPSTIPA	APLTTNSGLM	PPSVAVVGPL
HIPQNIKFSS	APVPPNALSS	SPAPNIQTGR	PLVLSSRATP	VQLPSPPCTS
SPVVPSHPPV	QQVKELNPDE	ASPQVNTSAD	QNTLPSSQST	TMVSPLLTNS
PGSSGNRRSP	VSSSKGKGKV	DKIGQILLTK	ACKKVTGSLE	KGEEQYGADG
ETEGQGLDTT	APGLMGTEQL	STELDSKTPT	PPAPTLLKMT	SSPVGPGTAS
AGPSLPGGAL	PTSVRSIVTT	LVPSELISAV	PTTKSNHGGI	ASESLAGGLV
EEKVGSHPEL	LPSIAPSQNL	VSKETSTTAL	QASVARPELE	VNAAIVSGQS
SEPKEIVEKS	KIPGRRNSRT	EEPTVASESV	ENGHRKRSSR	PASASSSTKD
ITSAVQSKRR	KSK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Локалізований у ядрі.

Література

Mahajan M.A., Samuels H.H. (2000). A new family of nuclear receptor coregulators that integrates nuclear receptor signaling through CBP. Mol. Cell. Biol. 20: 5048—5063. PMID 10866662 DOI:10.1128/MCB.20.14.5048-5063.2000
Caira F., Antonson P., Pelto-Huikko M., Treuter E., Gustafsson J.-A. (2000). Cloning and characterization of RAP250, a nuclear receptor coactivator. J. Biol. Chem. 275: 5308—5317. PMID 10681503 DOI:10.1074/jbc.275.8.5308
Ko L., Cardona G.R., Chin W.W. (2000). Thyroid hormone receptor-binding protein, an LXXLL motif-containing protein, functions as a general coactivator. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 6212—6217. PMID 10823961 DOI:10.1073/pnas.97.11.6212
Nagase T., Seki N., Ishikawa K., Tanaka A., Nomura N. (1996). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. V. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0161-KIAA0200) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 3: 17—24. PMID 8724849 DOI:10.1093/dnares/3.1.17
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Iwasaki T., Chin W.W., Ko L. (2001). Identification and characterization of RRM-containing coactivator activator (CoAA) as TRBP-interacting protein, and its splice variant as a coactivator modulator (CoAM). J. Biol. Chem. 276: 33375—33383. PMID 11443112 DOI:10.1074/jbc.M101517200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15936 (англ.) . Архів оригіналу за 6 квітня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q14686 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.