MPDZ |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2FCF, 2FNE, 2IWN, 2IWO, 2IWP, 2IWQ, 2O2T, 2OPG, 2QG1 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | MPDZ, HYC2, MUPP1, multiple PDZ domain crumbs cell polarity complex component |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603785 MGI: 1343489 HomoloGene: 2841 GeneCards: MPDZ |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • neuron projection • міжклітинні контакти • apicolateral plasma membrane • дендрит (нейробіологія) • postsynaptic membrane • клітинна мембрана • cell projection • синапс • apical plasma membrane • Schmidt-Lanterman incisure • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • мембрана • bicellular tight junction |
---|
Біологічний процес | • адгезія клітин • GO:0022415 viral process |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001261406 NM_001261407 NM_003829 NM_001330637 |
| | NM_010820 NM_001305284 NM_001305286 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001248335 NP_001248336 NP_001317566 NP_003820 NP_001362342
| NP_001362345 NP_001362346 NP_001362347 NP_001362348 NP_001362349 NP_001362350 NP_001362351 NP_001362352 NP_001362353 NP_001362354 NP_001362355 NP_001362356 NP_001365707 |
| | NP_001292213 NP_001292215 NP_034950 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 9: 13.11 – 13.28 Mb | Хр. 4: 81.28 – 81.44 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
MPDZ (англ. Multiple PDZ domain crumbs cell polarity complex component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 070 амінокислот, а молекулярна маса — 221 618[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MLEAIDKNRA | | LHAAERLQTK | | LRERGDVANE | | DKLSLLKSVL | | QSPLFSQILS |
LQTSVQQLKD | | QVNIATSATS | | NIEYAHVPHL | | SPAVIPTLQN | | ESFLLSPNNG |
NLEALTGPGI | | PHINGKPACD | | EFDQLIKNMA | | QGRHVEVFEL | | LKPPSGGLGF |
SVVGLRSENR | | GELGIFVQEI | | QEGSVAHRDG | | RLKETDQILA | | INGQALDQTI |
THQQAISILQ | | KAKDTVQLVI | | ARGSLPQLVS | | PIVSRSPSAA | | STISAHSNPV |
HWQHMETIEL | | VNDGSGLGFG | | IIGGKATGVI | | VKTILPGGVA | | DQHGRLCSGD |
HILKIGDTDL | | AGMSSEQVAQ | | VLRQCGNRVK | | LMIARGAIEE | | RTAPTALGIT |
LSSSPTSTPE | | LRVDASTQKG | | EESETFDVEL | | TKNVQGLGIT | | IAGYIGDKKL |
EPSGIFVKSI | | TKSSAVEHDG | | RIQIGDQIIA | | VDGTNLQGFT | | NQQAVEVLRH |
TGQTVLLTLM | | RRGMKQEAEL | | MSREDVTKDA | | DLSPVNASII | | KENYEKDEDF |
LSSTRNTNIL | | PTEEEGYPLL | | SAEIEEIEDA | | QKQEAALLTK | | WQRIMGINYE |
IVVAHVSKFS | | ENSGLGISLE | | ATVGHHFIRS | | VLPEGPVGHS | | GKLFSGDELL |
EVNGITLLGE | | NHQDVVNILK | | ELPIEVTMVC | | CRRTVPPTTQ | | SELDSLDLCD |
IELTEKPHVD | | LGEFIGSSET | | EDPVLAMTDA | | GQSTEEVQAP | | LAMWEAGIQH |
IELEKGSKGL | | GFSILDYQDP | | IDPASTVIII | | RSLVPGGIAE | | KDGRLLPGDR |
LMFVNDVNLE | | NSSLEEAVEA | | LKGAPSGTVR | | IGVAKPLPLS | | PEEGYVSAKE |
DSFLYPPHSC | | EEAGLADKPL | | FRADLALVGT | | NDADLVDEST | | FESPYSPEND |
SIYSTQASIL | | SLHGSSCGDG | | LNYGSSLPSS | | PPKDVIENSC | | DPVLDLHMSL |
EELYTQNLLQ | | RQDENTPSVD | | ISMGPASGFT | | INDYTPANAI | | EQQYECENTI |
VWTESHLPSE | | VISSAELPSV | | LPDSAGKGSE | | YLLEQSSLAC | | NAECVMLQNV |
SKESFERTIN | | IAKGNSSLGM | | TVSANKDGLG | | MIVRSIIHGG | | AISRDGRIAI |
GDCILSINEE | | STISVTNAQA | | RAMLRRHSLI | | GPDIKITYVP | | AEHLEEFKIS |
LGQQSGRVMA | | LDIFSSYTGR | | DIPELPEREE | | GEGEESELQN | | TAYSNWNQPR |
RVELWREPSK | | SLGISIVGGR | | GMGSRLSNGE | | VMRGIFIKHV | | LEDSPAGKNG |
TLKPGDRIVE | | VDGMDLRDAS | | HEQAVEAIRK | | AGNPVVFMVQ | | SIINRPRKSP |
LPSLLHNLYP | | KYNFSSTNPF | | ADSLQINADK | | APSQSESEPE | | KAPLCSVPPP |
PPSAFAEMGS | | DHTQSSASKI | | SQDVDKEDEF | | GYSWKNIRER | | YGTLTGELHM |
IELEKGHSGL | | GLSLAGNKDR | | SRMSVFIVGI | | DPNGAAGKDG | | RLQIADELLE |
INGQILYGRS | | HQNASSIIKC | | APSKVKIIFI | | RNKDAVNQMA | | VCPGNAVEPL |
PSNSENLQNK | | ETEPTVTTSD | | AAVDLSSFKN | | VQHLELPKDQ | | GGLGIAISEE |
DTLSGVIIKS | | LTEHGVAATD | | GRLKVGDQIL | | AVDDEIVVGY | | PIEKFISLLK |
TAKMTVKLTI | | HAENPDSQAV | | PSAAGAASGE | | KKNSSQSLMV | | PQSGSPEPES |
IRNTSRSSTP | | AIFASDPATC | | PIIPGCETTI | | EISKGRTGLG | | LSIVGGSDTL |
LGAIIIHEVY | | EEGAACKDGR | | LWAGDQILEV | | NGIDLRKATH | | DEAINVLRQT |
PQRVRLTLYR | | DEAPYKEEEV | | CDTLTIELQK | | KPGKGLGLSI | | VGKRNDTGVF |
VSDIVKGGIA | | DADGRLMQGD | | QILMVNGEDV | | RNATQEAVAA | | LLKCSLGTVT |
LEVGRIKAGP | | FHSERRPSQS | | SQVSEGSLSS | | FTFPLSGSST | | SESLESSSKK |
NALASEIQGL | | RTVEMKKGPT | | DSLGISIAGG | | VGSPLGDVPI | | FIAMMHPTGV |
AAQTQKLRVG | | DRIVTICGTS | | TEGMTHTQAV | | NLLKNASGSI | | EMQVVAGGDV |
SVVTGHQQEP | | ASSSLSFTGL | | TSSSIFQDDL | | GPPQCKSITL | | ERGPDGLGFS |
IVGGYGSPHG | | DLPIYVKTVF | | AKGAASEDGR | | LKRGDQIIAV | | NGQSLEGVTH |
EEAVAILKRT | | KGTVTLMVLS |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, щільних контактах, синапсах, синаптосомах[en].
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Ullmer C., Schmuck K., Figge A., Luebbert H. (1998). Cloning and characterization of MUPP1, a novel PDZ domain protein. FEBS Lett. 424: 63—68. PMID 9537516 DOI:10.1016/S0014-5793(98)00141-0
- Lee S.S., Glaunsinger B., Mantovani F., Banks L., Javier R.T. (2000). Multi-PDZ domain protein MUPP1 is a cellular target for both adenovirus E4-ORF1 and high-risk papillomavirus type 18 E6 oncoproteins. J. Virol. 74: 9680—9693. PMID 11000240 DOI:10.1128/JVI.74.20.9680-9693.2000
- Coyne C.B., Voelker T., Pichla S.L., Bergelson J.M. (2004). The coxsackievirus and adenovirus receptor interacts with the multi-PDZ domain protein-1 (MUPP-1) within the tight junction. J. Biol. Chem. 279: 48079—48084. PMID 15364909 DOI:10.1074/jbc.M409061200
- Krapivinsky G., Medina I., Krapivinsky L., Gapon S., Clapham D.E. (2004). SynGAP-MUPP1-CaMKII synaptic complexes regulate p38 MAP kinase activity and NMDA receptor-dependent synaptic AMPA receptor potentiation. Neuron. 43: 563—574. PMID 15312654 DOI:10.1016/j.neuron.2004.08.003
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7208 (англ.) . Архів оригіналу за 24 травня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O75970 (англ.) . Архів оригіналу за 1 липня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |