MAP1B |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | MAP1B, FUTSCH, MAP5, PPP1R102, microtubule-associated protein 1B, microtubule associated protein 1B, PVNH9, DFNA83 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 157129 MGI: 1306778 HomoloGene: 38111 GeneCards: MAP1B |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
розлад дефіциту уваги та гіперактивності[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • microtubule binding • structural molecule activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • actin binding • tubulin binding • phospholipid binding • GO:0032403 protein-containing complex binding |
---|
Клітинна компонента | • cell projection • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • клітинна мембрана • dendritic spine • photoreceptor outer segment • синапс • microtubule associated complex • міжклітинні контакти • мікротрубочка • цитоскелет • цитоплазма • гіалоплазма • аксон • дендрит (нейробіологія) • somatodendritic compartment • neuronal cell body • apical dendrite • basal dendrite • hippocampal mossy fiber • growth cone • varicosity • перикаріон • perinuclear region of cytoplasm |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of intracellular transport • аксоноґенеза • dendrite development • нейробіологія розвитку • microtubule bundle formation • axon extension • positive regulation of axon extension • mitochondrion transport along microtubule • establishment of monopolar cell polarity • GO:0006928 клітинний процес • microtubule cytoskeleton organization • neuron migration • regulation of microtubule depolymerization • negative regulation of microtubule depolymerization • synapse assembly • response to wounding • response to mechanical stimulus • response to carbohydrate • response to inorganic substance • peripheral nervous system axon regeneration • response to insecticide • developmental maturation • positive regulation of microtubule polymerization • response to nutrient levels • response to estradiol • response to vitamin A • positive regulation of neuron differentiation • neuron development • response to axon injury • induction of synaptic plasticity by chemical substance • cellular response to growth factor stimulus • cellular response to peptide hormone stimulus |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_005909 NM_032010 NM_001324255 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 72.11 – 72.21 Mb | Хр. 13: 99.56 – 99.65 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
MAP1B (англ. Microtubule associated protein 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 468 амінокислот, а молекулярна маса — 270 634[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MATVVVEATE | | PEPSGSIANP | | AASTSPSLSH | | RFLDSKFYLL | | VVVGEIVTEE |
HLRRAIGNIE | | LGIRSWDTNL | | IECNLDQELK | | LFVSRHSARF | | SPEVPGQKIL |
HHRSDVLETV | | VLINPSDEAV | | STEVRLMITD | | AARHKLLVLT | | GQCFENTGEL |
ILQSGSFSFQ | | NFIEIFTDQE | | IGELLSTTHP | | ANKASLTLFC | | PEEGDWKNSN |
LDRHNLQDFI | | NIKLNSASIL | | PEMEGLSEFT | | EYLSESVEVP | | SPFDILEPPT |
SGGFLKLSKP | | CCYIFPGGRG | | DSALFAVNGF | | NMLINGGSER | | KSCFWKLIRH |
LDRVDSILLT | | HIGDDNLPGI | | NSMLQRKIAE | | LEEEQSQGST | | TNSDWMKNLI |
SPDLGVVFLN | | VPENLKNPEP | | NIKMKRSIEE | | ACFTLQYLNK | | LSMKPEPLFR |
SVGNTIDPVI | | LFQKMGVGKL | | EMYVLNPVKS | | SKEMQYFMQQ | | WTGTNKDKAE |
FILPNGQEVD | | LPISYLTSVS | | SLIVWHPANP | | AEKIIRVLFP | | GNSTQYNILE |
GLEKLKHLDF | | LKQPLATQKD | | LTGQVPTPVV | | KQTKLKQRAD | | SRESLKPAAK |
PLPSKSVRKE | | SKEETPEVTK | | VNHVEKPPKV | | ESKEKVMVKK | | DKPIKTETKP |
SVTEKEVPSK | | EEPSPVKAEV | | AEKQATDVKP | | KAAKEKTVKK | | ETKVKPEDKK |
EEKEKPKKEV | | AKKEDKTPIK | | KEEKPKKEEV | | KKEVKKEIKK | | EEKKEPKKEV |
KKETPPKEVK | | KEVKKEEKKE | | VKKEEKEPKK | | EIKKLPKDAK | | KSSTPLSEAK |
KPAALKPKVP | | KKEESVKKDS | | VAAGKPKEKG | | KIKVIKKEGK | | AAEAVAAAVG |
TGATTAAVMA | | AAGIAAIGPA | | KELEAERSLM | | SSPEDLTKDF | | EELKAEEVDV |
TKDIKPQLEL | | IEDEEKLKET | | EPVEAYVIQK | | EREVTKGPAE | | SPDEGITTTE |
GEGECEQTPE | | ELEPVEKQGV | | DDIEKFEDEG | | AGFEESSETG | | DYEEKAETEE |
AEEPEEDGEE | | HVCVSASKHS | | PTEDEESAKA | | EADAYIREKR | | ESVASGDDRA |
EEDMDEAIEK | | GEAEQSEEEA | | DEEDKAEDAR | | EEEYEPEKME | | AEDYVMAVVD |
KAAEAGGAEE | | QYGFLTTPTK | | QLGAQSPGRE | | PASSIHDETL | | PGGSESEATA |
SDEENREDQP | | EEFTATSGYT | | QSTIEISSEP | | TPMDEMSTPR | | DVMSDETNNE |
ETESPSQEFV | | NITKYESSLY | | SQEYSKPADV | | TPLNGFSEGS | | KTDATDGKDY |
NASASTISPP | | SSMEEDKFSR | | SALRDAYCSE | | VKASTTLDIK | | DSISAVSSEK |
VSPSKSPSLS | | PSPPSPLEKT | | PLGERSVNFS | | LTPNEIKVSA | | EAEVAPVSPE |
VTQEVVEEHC | | ASPEDKTLEV | | VSPSQSVTGS | | AGHTPYYQSP | | TDEKSSHLPT |
EVIEKPPAVP | | VSFEFSDAKD | | ENERASVSPM | | DEPVPDSESP | | IEKVLSPLRS |
PPLIGSESAY | | ESFLSADDKA | | SGRGAESPFE | | EKSGKQGSPD | | QVSPVSEMTS |
TSLYQDKQEG | | KSTDFAPIKE | | DFGQEKKTDD | | VEAMSSQPAL | | ALDERKLGDV |
SPTQIDVSQF | | GSFKEDTKMS | | ISEGTVSDKS | | ATPVDEGVAE | | DTYSHMEGVA |
SVSTASVATS | | SFPEPTTDDV | | SPSLHAEVGS | | PHSTEVDDSL | | SVSVVQTPTT |
FQETEMSPSK | | EECPRPMSIS | | PPDFSPKTAK | | SRTPVQDHRS | | EQSSMSIEFG |
QESPEQSLAM | | DFSRQSPDHP | | TVGAGVLHIT | | ENGPTEVDYS | | PSDMQDSSLS |
HKIPPMEEPS | | YTQDNDLSEL | | ISVSQVEASP | | STSSAHTPSQ | | IASPLQEDTL |
SDVAPPRDMS | | LYASLTSEKV | | QSLEGEKLSP | | KSDISPLTPR | | ESSPLYSPTF |
SDSTSAVKEK | | TATCHSSSSP | | PIDAASAEPY | | GFRASVLFDT | | MQHHLALNRD |
LSTPGLEKDS | | GGKTPGDFSY | | AYQKPEETTR | | SPDEEDYDYE | | SYEKTTRTSD |
VGGYYYEKIE | | RTTKSPSDSG | | YSYETIGKTT | | KTPEDGDYSY | | EIIEKTTRTP |
EEGGYSYDIS | | EKTTSPPEVS | | GYSYEKTERS | | RRLLDDISNG | | YDDSEDGGHT |
LGDPSYSYET | | TEKITSFPES | | EGYSYETSTK | | TTRTPDTSTY | | CYETAEKITR |
TPQASTYSYE | | TSDLCYTAEK | | KSPSEARQDV | | DLCLVSSCEY | | KHPKTELSPS |
FINPNPLEWF | | ASEEPTEESE | | KPLTQSGGAP | | PPPGGKQQGR | | QCDETPPTSV |
SESAPSQTDS | | DVPPETEECP | | SITADANIDS | | EDESETIPTD | | KTVTYKHMDP |
PPAPVQDRSP | | SPRHPDVSMV | | DPEALAIEQN | | LGKALKKDLK | | EKTKTKKPGT |
KTKSSSPVKK | | SDGKSKPLAA | | SPKPAGLKES | | SDKVSRVASP | | KKKESVEKAA |
KPTTTPEVKA | | ARGEEKDKET | | KNAANASASK | | SAKTATAGPG | | TTKTTKSSAV |
PPGLPVYLDL | | CYIPNHSNSK | | NVDVEFFKRV | | RSSYYVVSGN | | DPAAEEPSRA |
VLDALLEGKA | | QWGSNMQVTL | | IPTHDSEVMR | | EWYQETHEKQ | | QDLNIMVLAS |
SSTVVMQDES | | FPACKIEL |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах.
Література
- Lien L.L., Feener C., Fischbach N., Kunkel L.M. (1994). Cloning of human microtubule-associated protein 1B and the identification of a related gene on chromosome 15. Genomics. 22: 273—280. PMID 7806212 DOI:10.1006/geno.1994.1384
- Dergunova L.V., Raevskaya N.M., Vladychenskaya I.P., Limborska S.A. (2003). Hmob3 brain-specific sequence is a part of phylogenetically conserved human MAP1B gene 3'-untranslated region. Biomol. Eng. 20: 91—96. PMID 12684070 DOI:10.1016/S1389-0344(03)00003-0
- Giorgianni F., Zhao Y., Desiderio D.M., Beranova-Giorgianni S. (2007). Toward a global characterization of the phosphoproteome in prostate cancer cells: identification of phosphoproteins in the LNCaP cell line. Electrophoresis. 28: 2027—2034. PMID 17487921 DOI:10.1002/elps.200600782
- Zou B., Yan H., Kawasaki F., Ordway R.W. (2008). MAP1 structural organization in Drosophila: in vivo analysis of FUTSCH reveals heavy- and light-chain subunits generated by proteolytic processing at a conserved cleavage site. Biochem. J. 414: 63—71. PMID 18419581 DOI:10.1042/BJ20071449
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з MAP1B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6836 (англ.) . Архів оригіналу за 16 липня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P46821 (англ.) . Архів оригіналу за 16 листопада 2017. Процитовано 31 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |