LYPD1 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

LYPD1

Ідентифікатори

Символи

LYPD1, LYPDC1, PHTS, LY6/PLAUR domain containing 1

Зовнішні ІД

OMIM: 610450 MGI: 1919835 HomoloGene: 16937 GeneCards: LYPD1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• acetylcholine receptor binding • acetylcholine receptor inhibitor activity
Клітинна компонента	• мембрана • anchored component of membrane • extracellular region • клітинна мембрана
Біологічний процес	• response to nicotine • behavioral fear response • negative regulation of signaling receptor activity • synaptic transmission, cholinergic • cell activation • acetylcholine receptor signaling pathway • negative regulation of protein localization to plasma membrane
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


116372


72585

Ensembl


ENSG00000150551


ENSMUSG00000026344

UniProt


Q8N2G4


Q8BLC3

RefSeq (мРНК)


NM_001077427 NM_144586 NM_001321234 NM_001321235


NM_145100 NM_001311089 NM_001311090

RefSeq (білок)


NP_001070895 NP_001308163 NP_001308164 NP_653187


NP_001298018 NP_001298019 NP_659568

Локус (UCSC)

Хр. 2: 132.64 – 132.67 Mb

Хр. 1: 125.8 – 125.84 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LYPD1 (англ. LY6/PLAUR domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 141 амінокислот, а молекулярна маса — 15 240^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MWVLGIAATF	CGLFLLPGFA	LQIQCYQCEE	FQLNNDCSSP	EFIVNCTVNV
QDMCQKEVME	QSAGIMYRKS	CASSAACLIA	SAGYQSFCSP	GKLNSVCISC
CNTPLCNGPR	PKKRGSSASA	LRPGLRTTIL	FLKLALFSAH	C

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:28431 (англ.) . Процитовано 29 серпня 2017.
↑ UniProt, Q8N2G4 (англ.) . Архів оригіналу за 2 січня 2018. Процитовано 29 серпня 2017.