LIME1

Ідентифікатори

Символи

LIME1, LIME, LP8067, dJ583P15.4, Lck interacting transmembrane adaptor 1

Зовнішні ІД

OMIM: 609809 MGI: 1919949 HomoloGene: 56785 GeneCards: LIME1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein kinase binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • міжклітинний простір • U2-type post-mRNA release spliceosomal complex • B cell receptor complex
Біологічний процес	• B cell receptor signaling pathway • T cell receptor signaling pathway • адаптивна імунна відповідь • процес імунної системи • spliceosomal complex disassembly • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling • regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • regulation of MAP kinase activity • regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol • regulation of NIK/NF-kappaB signaling
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


54923


72699

Ensembl


н/д


ENSMUSG00000090077

UniProt


Q9H400


Q9EQR5

RefSeq (мРНК)


NM_017806 NM_001305654 NM_001305655


NM_023684

RefSeq (білок)


NP_001292583 NP_001292584 NP_060276


NP_076173

Локус (UCSC)

н/д

Хр. 2: 181.02 – 181.03 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LIME1 (англ. Lck interacting transmembrane adaptor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 295 амінокислот, а молекулярна маса — 31 288^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGLPVSWAPP	ALWVLGCCAL	LLSLWALCTA	CRRPEDAVAP	RKRARRQRAR
LQGSATAAEA	SLLRRTHLCS	LSKSDTRLHE	LHRGPRSSRA	LRPASMDLLR
PHWLEVSRDI	TGPQAAPSAF	PHQELPRALP	AAAATAGCAG	LEATYSNVGL
AALPGVSLAA	SPVVAEYARV	QKRKGTHRSP	QEPQQGKTEV	TPAAQVDVLY
SRVCKPKRRD	PGPTTDPLDP	KGQGAILALA	GDLAYQTLPL	RALDVDSGPL
ENVYESIREL	GDPAGRSSTC	GAGTPPASSC	PSLGRGWRPL	PASLP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як адаптивний імунітет, імунітет, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:26016 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9H400 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 12 вересня 2017.