LCK

Наявні структури

Пошук ортологів: E9PI33 PDBe E9PI33 RCSB

Список кодів PDB
1BHF, 1BHH, 1CWD, 1CWE, 1FBZ, 1H92, 1IJR, 1KIK, 1LCJ, 1LCK, 1LKK, 1LKL, 1Q68, 1Q69, 1QPC, 1QPD, 1QPE, 1QPJ, 1X27, 2IIM, 2OF2, 2OF4, 2OFU, 2OFV, 2OG8, 2PL0, 2ZM1, 2ZM4, 2ZYB, 3AC1, 3AC2, 3AC3, 3AC4, 3AC5, 3AC8, 3ACJ, 3ACK, 3AD4, 3AD5, 3AD6, 3B2W, 3BRH, 3BYM, 3BYO, 3BYS, 3BYU, 3KMM, 3KXZ, 3LCK, 3MPM, 4D8K, 4C3F

Ідентифікатори

Символи

LCK, LCK proto-oncogene, Src family tyrosine kinase, IMD22, LSK, YT16, p56lck, pp58lck

Зовнішні ІД

OMIM: 153390 MGI: 96756 HomoloGene: 3911 GeneCards: LCK

Пов'язані генетичні захворювання

severe combined immunodeficiency due to LCK deficiency^[1]

Реагує на сполуку

saracatinib, SU6656^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity • nucleotide binding • protein kinase activity • CD4 receptor binding • ATPase binding • SH2 domain binding • CD8 receptor binding • phosphatidylinositol 3-kinase binding • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • protein phosphatase binding • ATP binding • protein kinase binding • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase activity • kinase activity • protein serine/threonine phosphatase activity • non-membrane spanning protein tyrosine kinase activity • phosphotyrosine residue binding • protein tyrosine kinase activity • T cell receptor binding • signaling receptor binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane • immunological synapse • екзосома • pericentriolar material • membrane raft • клітинна мембрана
Біологічний процес	• B cell receptor signaling pathway • release of sequestered calcium ion into cytosol • кровотворення • фосфорилювання • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway • positive regulation of T cell receptor signaling pathway • T cell costimulation • GO:0019049, GO:0030683 mitigation of host defenses by virus • platelet activation • T cell differentiation • regulation of cell population proliferation • cellular zinc ion homeostasis • regulation of lymphocyte activation • peptidyl-tyrosine autophosphorylation • T cell receptor signaling pathway • positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway • leukocyte migration • positive regulation of T cell activation • GO:0016576 protein dephosphorylation • вроджений імунітет • phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process • GO:0022415 viral process • protein phosphorylation • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • cell migration • peptidyl-tyrosine phosphorylation • interleukin-7-mediated signaling pathway • positive regulation of protein kinase B signaling • диференціація клітин • positive regulation of heterotypic cell-cell adhesion • positive regulation of leukocyte cell-cell adhesion
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3932


16818

Ensembl


ENSG00000182866


ENSMUSG00000000409

UniProt


P06239


P06240

RefSeq (мРНК)


NM_001042771 NM_005356 NM_001330468


NM_001162432 NM_001162433 NM_010693

RefSeq (білок)


NP_001036236 NP_001317397 NP_005347


NP_001155904 NP_001155905 NP_034823

Локус (UCSC)

Хр. 1: 32.25 – 32.29 Mb

Хр. 4: 129.44 – 129.47 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LCK (англ. LCK proto-oncogene, Src family tyrosine kinase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 509 амінокислот, а молекулярна маса — 58 001^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGCGCSSHPE	DDWMENIDVC	ENCHYPIVPL	DGKGTLLIRN	GSEVRDPLVT
YEGSNPPASP	LQDNLVIALH	SYEPSHDGDL	GFEKGEQLRI	LEQSGEWWKA
QSLTTGQEGF	IPFNFVAKAN	SLEPEPWFFK	NLSRKDAERQ	LLAPGNTHGS
FLIRESESTA	GSFSLSVRDF	DQNQGEVVKH	YKIRNLDNGG	FYISPRITFP
GLHELVRHYT	NASDGLCTRL	SRPCQTQKPQ	KPWWEDEWEV	PRETLKLVER
LGAGQFGEVW	MGYYNGHTKV	AVKSLKQGSM	SPDAFLAEAN	LMKQLQHQRL
VRLYAVVTQE	PIYIITEYME	NGSLVDFLKT	PSGIKLTINK	LLDMAAQIAE
GMAFIEERNY	IHRDLRAANI	LVSDTLSCKI	ADFGLARLIE	DNEYTAREGA
KFPIKWTAPE	AINYGTFTIK	SDVWSFGILL	TEIVTHGRIP	YPGMTNPEVI
QNLERGYRMV	RPDNCPEELY	QLMRLCWKER	PEDRPTFDYL	RSVLEDFFTA
TEGQYQPQP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до тирозинових протеїнкіназ родини Src-протеїнкіназ. Задіяний у такому біологічному процесі як взаємодія хазяїн-вірус. Білок має сайт для зв'язування з АТФ. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі.

Література

Wright D.D., Sefton B.M., Kamps M.P. (1994). Oncogenic activation of the Lck protein accompanies translocation of the LCK gene in the human HSB2 T-cell leukemia. Mol. Cell. Biol. 14: 2429—2437. PMID 8139546 DOI:10.1128/MCB.14.4.2429
Vogel L.B., Arthur R., Fujita D.J. (1995). An aberrant lck mRNA in two human T-cell lines. Biochim. Biophys. Acta. 1264: 168—172. PMID 7495859 DOI:10.1016/0167-4781(95)00162-A
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Garvin A.M., Pawar S., Marth J.D., Perlmutter R.M. (1988). Structure of the murine lck gene and its rearrangement in a murine lymphoma cell line. Mol. Cell. Biol. 8: 3058—3064. PMID 2850479 DOI:10.1128/MCB.8.8.3058
Vogel L.B., Fujita D.J. (1993). The SH3 domain of p56lck is involved in binding to phosphatidylinositol 3'-kinase from T lymphocytes. Mol. Cell. Biol. 13: 7408—7417. PMID 7504174 DOI:10.1128/MCB.13.12.7408
Vogel L.B., Fujita D.J. (1995). p70 phosphorylation and binding to p56lck is an early event in interleukin-2-induced onset of cell cycle progression in T-lymphocytes. J. Biol. Chem. 270: 2506—2511. PMID 7852312 DOI:10.1074/jbc.270.6.2506

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з LCK переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з LCK proto-oncogene, Src family tyrosine kinase переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6524 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P06239 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.