KIF1C |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | KIF1C, LTXS1, SATX2, SAX2, SPAX2, SPG58, kinesin family member 1C |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603060 MGI: 1098260 HomoloGene: 4821 GeneCards: KIF1C |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
spastic ataxia 2[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • microtubule binding • microtubule motor activity • nucleotide binding • ATPase activity • cytoskeletal motor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • RNA binding • plus-end-directed microtubule motor activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • комплекс Ґольджі • мікротрубочка • цитоскелет • ендоплазматичний ретикулум • Кінезин • аксон • дендрит (нейробіологія) • neuron projection • axon cytoplasm |
---|
Біологічний процес | • cytoskeleton-dependent intracellular transport • microtubule-based movement • retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum • vesicle-mediated transport • anterograde neuronal dense core vesicle transport • retrograde neuronal dense core vesicle transport |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 5 – 5.03 Mb | Хр. 11: 70.7 – 70.73 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
KIF1C (англ. Kinesin family member 1C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 103 амінокислот, а молекулярна маса — 122 947[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAGASVKVAV | | RVRPFNARET | | SQDAKCVVSM | | QGNTTSIINP | | KQSKDAPKSF |
TFDYSYWSHT | | STEDPQFASQ | | QQVYRDIGEE | | MLLHAFEGYN | | VCIFAYGQTG |
AGKSYTMMGR | | QEPGQQGIVP | | QLCEDLFSRV | | SENQSAQLSY | | SVEVSYMEIY |
CERVRDLLNP | | KSRGSLRVRE | | HPILGPYVQD | | LSKLAVTSYA | | DIADLMDCGN |
KARTVAATNM | | NETSSRSHAV | | FTIVFTQRCH | | DQLTGLDSEK | | VSKISLVDLA |
GSERADSSGA | | RGMRLKEGAN | | INKSLTTLGK | | VISALADMQS | | KKRKSDFIPY |
RDSVLTWLLK | | ENLGGNSRTA | | MIAALSPADI | | NYEETLSTLR | | YADRTKQIRC |
NAIINEDPNA | | RLIRELQEEV | | ARLRELLMAQ | | GLSASALEGL | | KTEEGSVRGA |
LPAVSSPPAP | | VSPSSPTTHN | | GELEPSFSPN | | TESQIGPEEA | | MERLQETEKI |
IAELNETWEE | | KLRKTEALRM | | EREALLAEMG | | VAVREDGGTV | | GVFSPKKTPH |
LVNLNEDPLM | | SECLLYHIKD | | GVTRVGQVDM | | DIKLTGQFIR | | EQHCLFRSIP |
QPDGEVVVTL | | EPCEGAETYV | | NGKLVTEPLV | | LKSGNRIVMG | | KNHVFRFNHP |
EQARLERERG | | VPPPPGPPSE | | PVDWNFAQKE | | LLEQQGIDIK | | LEMEKRLQDL |
ENQYRKEKEE | | ADLLLEQQRL | | YADSDSGDDS | | DKRSCEESWR | | LISSLREQLP |
PTTVQTIVKR | | CGLPSSGKRR | | APRRVYQIPQ | | RRRLQGKDPR | | WATMADLKMQ |
AVKEICYEVA | | LADFRHGRAE | | IEALAALKMR | | ELCRTYGKPD | | GPGDAWRAVA |
RDVWDTVGEE | | EGGGAGSGGG | | SEEGARGAEV | | EDLRAHIDKL | | TGILQEVKLQ |
NSSKDRELQA | | LRDRMLRMER | | VIPLAQDHED | | ENEEGGEVPW | | APPEGSEAAE |
EAAPSDRMPS | | ARPPSPPLSS | | WERVSRLMEE | | DPAFRRGRLR | | WLKQEQLRLQ |
GLQGSGGRGG | | GLRRPPARFV | | PPHDCKLRFP | | FKSNPQHRES | | WPGMGSGEAP |
TPLQPPEEVT | | PHPATPARRP | | PSPRRSHHPR | | RNSLDGGGRS | | RGAGSAQPEP |
QHFQPKKHNS | | YPQPPQPYPA | | QRPPGPRYPP | | YTTPPRMRRQ | | RSAPDLKESG |
AAV |
Кодований геном білок за функціями належить до білкових моторів, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з KIF1C переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6317 (англ.) . Архів оригіналу за 4 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O43896 (англ.) . Архів оригіналу за 3 січня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |