KHDRBS1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2XA6, 3QHE

Ідентифікатори

Символи

KHDRBS1, Sam68, p62, p68, KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 1, KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 1

Зовнішні ІД

OMIM: 602489 MGI: 893579 HomoloGene: 4781 GeneCards: KHDRBS1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • poly(A) binding • poly(U) RNA binding • SH3 domain binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • nucleic acid binding • protein domain specific binding • identical protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • Grb2-Sos complex • мембрана • клітинне ядро • гіалоплазма • нуклеоплазма
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of protein stability • transcription, DNA-templated • positive regulation of RNA export from nucleus • cell surface receptor signaling pathway • G2/M transition of mitotic cell cycle • regulation of RNA export from nucleus • клітинний цикл • проліферація • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of translational initiation • GO:0072468 сигнальна трансдукція • mRNA processing • positive regulation of signal transduction • regulation of mRNA splicing, via spliceosome • Сперматогенез • protein complex oligomerization • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • G1/S transition of mitotic cell cycle
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10657


20218

Ensembl


ENSG00000121774


ENSMUSG00000028790

UniProt


Q07666


Q60749

RefSeq (мРНК)


NM_001271878 NM_006559


NM_011317

RefSeq (білок)


NP_001258807 NP_006550


NP_035447

Локус (UCSC)

Хр. 1: 32.01 – 32.06 Mb

Хр. 4: 129.6 – 129.64 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

KHDRBS1 (англ. KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 443 амінокислот, а молекулярна маса — 48 227^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQRRDDPAAR	MSRSSGRSGS	MDPSGAHPSV	RQTPSRQPPL	PHRSRGGGGG
SRGGARASPA	TQPPPLLPPS	ATGPDATVGG	PAPTPLLPPS	ATASVKMEPE
NKYLPELMAE	KDSLDPSFTH	AMQLLTAEIE	KIQKGDSKKD	DEENYLDLFS
HKNMKLKERV	LIPVKQYPKF	NFVGKILGPQ	GNTIKRLQEE	TGAKISVLGK
GSMRDKAKEE	ELRKGGDPKY	AHLNMDLHVF	IEVFGPPCEA	YALMAHAMEE
VKKFLVPDMM	DDICQEQFLE	LSYLNGVPEP	SRGRGVPVRG	RGAAPPPPPV
PRGRGVGPPR	GALVRGTPVR	GAITRGATVT	RGVPPPPTVR	GAPAPRARTA
GIQRIPLPPP	PAPETYEEYG	YDDTYAEQSY	EGYEGYYSQS	QGDSEYYDYG
HGEVQDSYEA	YGQDDWNGTR	PSLKAPPARP	VKGAYREHPY	GRY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Fusaki N., Iwamatsu A., Iwashima M., Fujisawa J. (1997). Interaction between Sam68 and Src family tyrosine kinases, Fyn and Lck, in T cell receptor signaling. J. Biol. Chem. 272: 6214—6219. PMID 9045636 DOI:10.1074/jbc.272.10.6214
Sanchez-Margalet V., Martin-Romero C. (2001). Human leptin signaling in human peripheral blood mononuclear cells: activation of the JAK-STAT pathway. Cell. Immunol. 211: 30—36. PMID 11585385 DOI:10.1006/cimm.2001.1815
Cote J., Boisvert F.-M., Boulanger M.-C., Bedford M.T., Richard S. (2003). Sam68 RNA binding protein is an in vivo substrate for protein arginine N-methyltransferase 1. Mol. Biol. Cell. 14: 274—287. PMID 12529443 DOI:10.1091/mbc.E02-08-0484
Ong S.E., Mittler G., Mann M. (2004). Identifying and quantifying in vivo methylation sites by heavy methyl SILAC. Nat. Methods. 1: 119—126. PMID 15782174 DOI:10.1038/nmeth715
Babic I., Jakymiw A., Fujita D.J. (2004). The RNA binding protein Sam68 is acetylated in tumor cell lines, and its acetylation correlates with enhanced RNA binding activity. Oncogene. 23: 3781—3789. PMID 15021911 DOI:10.1038/sj.onc.1207484

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18116 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q07666 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.