KANK2 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | KANK2, ANKRD25, MXRA3, SIP, PPKWH, KN motif and ankyrin repeat domains 2, NPHS16 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 614610 MGI: 2384568 HomoloGene: 9163 GeneCards: KANK2 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
nephrotic syndrome 16[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • мітохондрія |
---|
Біологічний процес | • GO:1990376 negative regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle • negative regulation of programmed cell death • negative regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of vitamin D receptor signaling pathway • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • negative regulation of cell population proliferation • GO:0097285 апоптоз • kidney epithelium development • glomerular visceral epithelial cell migration • regulation of Rho protein signal transduction |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_015493 NM_001136191 NM_001329451 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_001129663 NP_001316380 NP_056308 NP_001366477 NP_001366478
| NP_001366479 NP_001366480 NP_001366481 NP_001366482 NP_001366483 NP_001366484 NP_001366485 NP_001366486 NP_001366487 NP_001366488 NP_001366489 NP_001366490 NP_001366491 NP_001366492 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 11.16 – 11.2 Mb | Хр. 9: 21.68 – 21.71 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
KANK2 (англ. KN motif and ankyrin repeat domains 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 851 амінокислот, а молекулярна маса — 91 174[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAQVLHVPAP | | FPGTPGPASP | | PAFPAKDPDP | | PYSVETPYGY | | RLDLDFLKYV |
DDIEKGHTLR | | RVAVQRRPRL | | SSLPRGPGSW | | WTSTESLCSN | | ASGDSRHSAY |
SYCGRGFYPQ | | YGALETRGGF | | NPRVERTLLD | | ARRRLEDQAA | | TPTGLGSLTP |
SAAGSTASLV | | GVGLPPPTPR | | SSGLSTPVPP | | SAGHLAHVRE | | QMAGALRKLR |
QLEEQVKLIP | | VLQVKLSVLQ | | EEKRQLTVQL | | KSQKFLGHPT | | AGRGRSELCL |
DLPDPPEDPV | | ALETRSVGTW | | VRERDLGMPD | | GEAALAAKVA | | VLETQLKKAL |
QELQAAQARQ | | ADPQPQAWPP | | PDSPVRVDTV | | RVVEGPREVE | | VVASTAAGAP |
AQRAQSLEPY | | GTGLRALAMP | | GRPESPPVFR | | SQEVVETMCP | | VPAAATSNVH |
MVKKISITER | | SCDGAAGLPE | | VPAESSSSPP | | GSEVASLTQP | | EKSTGRVPTQ |
EPTHREPTRQ | | AASQESEEAG | | GTGGPPAGVR | | SIMKRKEEVA | | DPTAHRRSLQ |
FVGVNGGYES | | SSEDSSTAEN | | ISDNDSTENE | | APEPRERVPS | | VAEAPQLRPA |
GTAAAKTSRQ | | ECQLSRESQH | | IPTAEGASGS | | NTEEEIRMEL | | SPDLISACLA |
LEKYLDNPNA | | LTERELKVAY | | TTVLQEWLRL | | ACRSDAHPEL | | VRRHLVTFRA |
MSARLLDYVV | | NIADSNGNTA | | LHYSVSHANF | | PVVQQLLDSG | | VCKVDKQNRA |
GYSPIMLTAL | | ATLKTQDDIE | | TVLQLFRLGN | | INAKASQAGQ | | TALMLAVSHG |
RVDVVKALLA | | CEADVNVQDD | | DGSTALMCAC | | EHGHKEIAGL | | LLAVPSCDIS |
LTDRDGSTAL | | MVALDAGQSE | | IASMLYSRMN | | IKCSFAPMSD | | DESPTSSSAE |
E |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мітохондрії.
Література
- Zhang Y., Zhang H., Liang J., Yu W., Shang Y. (2007). SIP, a novel ankyrin repeat containing protein, sequesters steroid receptor coactivators in the cytoplasm. EMBO J. 26: 2645—2657. PMID 17476305 DOI:10.1038/sj.emboj.7601710
- Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Zhu Y., Kakinuma N., Wang Y., Kiyama R. (2008). Kank proteins: a new family of ankyrin-repeat domain-containing proteins. Biochim. Biophys. Acta. 1780: 128—133. PMID 17996375 DOI:10.1016/j.bbagen.2007.09.017
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з KANK2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29300 (англ.) . Архів оригіналу за 25 жовтня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q63ZY3 (англ.) . Архів оригіналу за 31 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |