ITGB6 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 4UM8, 4UM9 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | ITGB6, AI1H, Integrin, beta 6, integrin subunit beta 6 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 147558 MGI: 96615 HomoloGene: 685 GeneCards: ITGB6 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
amelogenesis imperfecta type 1H[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • integrin binding • virus receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • signaling receptor activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • integrin complex • receptor complex • клітинна мембрана • мембрана • external side of plasma membrane • focal adhesion • integrin alphav-beta6 complex • нуклеоплазма • центросома • міжклітинні контакти • cell surface |
---|
Біологічний процес | • integrin-mediated signaling pathway • viral entry into host cell • cell-matrix adhesion • inflammatory response • адгезія клітин • extracellular matrix organization • GO:0022415 viral process • cell adhesion mediated by integrin • cell migration • regulation of transforming growth factor beta activation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_000888 NM_001282353 NM_001282354 NM_001282355 NM_001282388
| NM_001282389 NM_001282390 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_000879 NP_001269282 NP_001269283 NP_001269284 NP_001269317
| NP_001269318 NP_001269319 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 160.1 – 160.2 Mb | Хр. 2: 60.43 – 60.55 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ITGB6 (англ. Integrin subunit beta 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 788 амінокислот, а молекулярна маса — 85 936[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGIELLCLFF | | LFLGRNDHVQ | | GGCALGGAET | | CEDCLLIGPQ | | CAWCAQENFT |
HPSGVGERCD | | TPANLLAKGC | | QLNFIENPVS | | QVEILKNKPL | | SVGRQKNSSD |
IVQIAPQSLI | | LKLRPGGAQT | | LQVHVRQTED | | YPVDLYYLMD | | LSASMDDDLN |
TIKELGSRLS | | KEMSKLTSNF | | RLGFGSFVEK | | PVSPFVKTTP | | EEIANPCSSI |
PYFCLPTFGF | | KHILPLTNDA | | ERFNEIVKNQ | | KISANIDTPE | | GGFDAIMQAA |
VCKEKIGWRN | | DSLHLLVFVS | | DADSHFGMDS | | KLAGIVIPND | | GLCHLDSKNE |
YSMSTVLEYP | | TIGQLIDKLV | | QNNVLLIFAV | | TQEQVHLYEN | | YAKLIPGATV |
GLLQKDSGNI | | LQLIISAYEE | | LRSEVELEVL | | GDTEGLNLSF | | TAICNNGTLF |
QHQKKCSHMK | | VGDTASFSVT | | VNIPHCERRS | | RHIIIKPVGL | | GDALELLVSP |
ECNCDCQKEV | | EVNSSKCHHG | | NGSFQCGVCA | | CHPGHMGPRC | | ECGEDMLSTD |
SCKEAPDHPS | | CSGRGDCYCG | | QCICHLSPYG | | NIYGPYCQCD | | NFSCVRHKGL |
LCGGNGDCDC | | GECVCRSGWT | | GEYCNCTTST | | DSCVSEDGVL | | CSGRGDCVCG |
KCVCTNPGAS | | GPTCERCPTC | | GDPCNSKRSC | | IECHLSAAGQ | | AREECVDKCK |
LAGATISEEE | | DFSKDGSVSC | | SLQGENECLI | | TFLITTDNEG | | KTIIHSINEK |
DCPKPPNIPM | | IMLGVSLAIL | | LIGVVLLCIW | | KLLVSFHDRK | | EVAKFEAERS |
KAKWQTGTNP | | LYRGSTSTFK | | NVTYKHREKQ | | KVDLSTDC |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, інтегринів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, взаємодія хазяїн-вірус, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, клітинних контактах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Gianni T., Salvioli S., Chesnokova L.S., Hutt-Fletcher L.M., Campadelli-Fiume G. (2013). alphavbeta6- and alphavbeta8-integrins serve as interchangeable receptors for HSV gH/gL to promote endocytosis and activation of membrane fusion. PLoS Pathog. 9: E1003806—E1003806. PMID 24367260 DOI:10.1371/journal.ppat.1003806
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з ITGB6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6161 (англ.) . Архів оригіналу за 14 липня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P18564 (англ.) . Архів оригіналу за 22 липня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |