IGF2BP2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2CQH

Ідентифікатори

Символи

IGF2BP2, IMP-2, IMP2, VICKZ2, insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 2

Зовнішні ІД

OMIM: 608289 MGI: 1890358 HomoloGene: 4774 GeneCards: IGF2BP2

Пов'язані генетичні захворювання

цукровий діабет 2-го типу, Гестаційний цукровий діабет^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• mRNA 5'-UTR binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA binding • translation regulator activity • mRNA 3'-UTR binding • nucleic acid binding • RNA binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • цитоскелет • клітинне ядро • гіалоплазма
Біологічний процес	• anatomical structure morphogenesis • negative regulation of translation • mRNA transport • regulation of translation • regulation of mRNA stability • GO:0015915 транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10644


319765

Ensembl


ENSG00000073792


ENSMUSG00000033581

UniProt


Q9Y6M1


Q5SF07

RefSeq (мРНК)

NM_001007225 NM_001291869 NM_001291872 NM_001291873 NM_001291874
NM_001291875 NM_006548


NM_183029

RefSeq (білок)

NP_001007226 NP_001278798 NP_001278801 NP_001278802 NP_001278803
NP_001278804 NP_006539


NP_898850

Локус (UCSC)

Хр. 3: 185.64 – 185.83 Mb

Хр. 16: 21.88 – 21.98 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

IGF2BP2 (англ. Insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 599 амінокислот, а молекулярна маса — 66 121^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MMNKLYIGNL	SPAVTADDLR	QLFGDRKLPL	AGQVLLKSGY	AFVDYPDQNW
AIRAIETLSG	KVELHGKIME	VDYSVSKKLR	SRKIQIRNIP	PHLQWEVLDG
LLAQYGTVEN	VEQVNTDTET	AVVNVTYATR	EEAKIAMEKL	SGHQFENYSF
KISYIPDEEV	SSPSPPQRAQ	RGDHSSREQG	HAPGGTSQAR	QIDFPLRILV
PTQFVGAIIG	KEGLTIKNIT	KQTQSRVDIH	RKENSGAAEK	PVTIHATPEG
TSEACRMILE	IMQKEADETK	LAEEIPLKIL	AHNGLVGRLI	GKEGRNLKKI
EHETGTKITI	SSLQDLSIYN	PERTITVKGT	VEACASAEIE	IMKKLREAFE
NDMLAVNQQA	NLIPGLNLSA	LGIFSTGLSV	LSPPAGPRGA	PPAAPYHPFT
THSGYFSSLY	PHHQFGPFPH	HHSYPEQEIV	NLFIPTQAVG	AIIGKKGAHI
KQLARFAGAS	IKIAPAEGPD	VSERMVIITG	PPEAQFKAQG	RIFGKLKEEN
FFNPKEEVKL	EAHIRVPSST	AGRVIGKGGK	TVNELQNLTS	AEVIVPRDQT
PDENEEVIVR	IIGHFFASQT	AQRKIREIVQ	QVKQQEQKYP	QGVASQRSK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як регуляція трансляції, транспорт, транспорт мРНК, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Zhang J.-Y., Chan E.K.L., Peng X.-X., Tan E.M. (1999). A novel cytoplasmic protein with RNA-binding motifs is an autoantigen in human hepatocellular carcinoma. J. Exp. Med. 189: 1101—1110. PMID 10190901 DOI:10.1084/jem.189.7.1101
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Moraes K.C., Quaresma A.J., Maehnss K., Kobarg J. (2003). Identification and characterization of proteins that selectively interact with isoforms of the mRNA binding protein AUF1 (hnRNP D). Biol. Chem. 384: 25—37. PMID 12674497 DOI:10.1515/BC.2003.004
Yisraeli J.K. (2005). VICKZ proteins: a multi-talented family of regulatory RNA-binding proteins. Biol. Cell. 97: 87—96. PMID 15601260 DOI:10.1042/BC20040151
Le H.T., Sorrell A.M., Siddle K. (2012). Two isoforms of the mRNA binding protein IGF2BP2 are generated by alternative translational initiation. PLoS ONE. 7: E33140—E33140. PMID 22427968 DOI:10.1371/journal.pone.0033140
Wachter K., Kohn M., Stohr N., Huttelmaier S. (2013). Subcellular localization and RNP formation of IGF2BPs (IGF2 mRNA-binding proteins) is modulated by distinct RNA-binding domains. Biol. Chem. 394: 1077—1090. PMID 23640942 DOI:10.1515/hsz-2013-0111

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з IGF2BP2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:28867 (англ.) . Архів оригіналу за 16 травня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9Y6M1 (англ.) . Архів оригіналу за 20 липня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.