IGF2BP1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | IGF2BP1, CRD-BP, CRDBP, IMP-1, IMP1, VICKZ1, ZBP1, insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 608288 MGI: 1890357 HomoloGene: 4772 GeneCards: IGF2BP1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • translation regulator activity • mRNA 3'-UTR binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • mRNA 5'-UTR binding • mRNA binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • CRD-mediated mRNA stability complex • cell projection • Філоподія • growth cone • dendritic spine • аксон • дендрит (нейробіологія) • perinuclear region of cytoplasm • cytoplasmic stress granule • клітинне ядро • lamellipodium • нуклеоплазма • гіалоплазма • Рибонуклеопротеїни |
---|
Біологічний процес | • CRD-mediated mRNA stabilization • mRNA transport • negative regulation of translation • pallium cell proliferation in forebrain • neuronal stem cell population maintenance • RNA localization • regulation of translation • regulation of mRNA stability involved in response to stress • regulation of mRNA stability • GO:0015915 транспорт |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | | NP_034081 NP_001388383 NP_001388384 NP_001388385 NP_001388386 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 49 – 49.06 Mb | Хр. 11: 95.96 – 96.01 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
IGF2BP1 (англ. Insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 577 амінокислот, а молекулярна маса — 63 481[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MNKLYIGNLN | | ESVTPADLEK | | VFAEHKISYS | | GQFLVKSGYA | | FVDCPDEHWA |
MKAIETFSGK | | VELQGKRLEI | | EHSVPKKQRS | | RKIQIRNIPP | | QLRWEVLDSL |
LAQYGTVENC | | EQVNTESETA | | VVNVTYSNRE | | QTRQAIMKLN | | GHQLENHALK |
VSYIPDEQIA | | QGPENGRRGG | | FGSRGQPRQG | | SPVAAGAPAK | | QQQVDIPLRL |
LVPTQYVGAI | | IGKEGATIRN | | ITKQTQSKID | | VHRKENAGAA | | EKAISVHSTP |
EGCSSACKMI | | LEIMHKEAKD | | TKTADEVPLK | | ILAHNNFVGR | | LIGKEGRNLK |
KVEQDTETKI | | TISSLQDLTL | | YNPERTITVK | | GAIENCCRAE | | QEIMKKVREA |
YENDVAAMSL | | QSHLIPGLNL | | AAVGLFPASS | | SAVPPPPSSV | | TGAAPYSSFM |
QAPEQEMVQV | | FIPAQAVGAI | | IGKKGQHIKQ | | LSRFASASIK | | IAPPETPDSK |
VRMVIITGPP | | EAQFKAQGRI | | YGKLKEENFF | | GPKEEVKLET | | HIRVPASAAG |
RVIGKGGKTV | | NELQNLTAAE | | VVVPRDQTPD | | ENDQVIVKII | | GHFYASQMAQ |
RKIRDILAQV | | KQQHQKGQSN | | QAQARRK |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, транспорт, транспорт мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, клітинних відростках.
Література
- Patel G.P., Ma S., Bag J. (2005). The autoregulatory translational control element of poly(A)-binding protein mRNA forms a heteromeric ribonucleoprotein complex. Nucleic Acids Res. 33: 7074—7089. PMID 16356927 DOI:10.1093/nar/gki1014
- Rackham O., Brown C.M. (2004). Visualization of RNA-protein interactions in living cells: FMRP and IMP1 interact on mRNAs. EMBO J. 23: 3346—3355. PMID 15282548 DOI:10.1038/sj.emboj.7600341
- Nielsen J., Kristensen M.A., Willemoes M., Nielsen F.C., Christiansen J. (2004). Sequential dimerization of human zipcode-binding protein IMP1 on RNA: a cooperative mechanism providing RNP stability. Nucleic Acids Res. 32: 4368—4376. PMID 15314207 DOI:10.1093/nar/gkh754
- Patel G.P., Bag J. (2006). IMP1 interacts with poly(A)-binding protein (PABP) and the autoregulatory translational control element of PABP-mRNA through the KH III-IV domain. FEBS J. 273: 5678—5690. PMID 17212783 DOI:10.1111/j.1742-4658.2006.05556.x
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
- Pan F., Huettelmaier S., Singer R.H., Gu W. (2007). ZBP2 facilitates binding of ZBP1 to beta-actin mRNA during transcription. Mol. Cell. Biol. 27: 8340—8351. PMID 17893325 DOI:10.1128/MCB.00972-07
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:28866 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q9NZI8 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |