IFT88

Ідентифікатори

Символи

IFT88, D13S1056E, DAF19, TG737, TTC10, hTg737, intraflagellar transport 88

Зовнішні ІД

OMIM: 600595 MGI: 98715 HomoloGene: 4761 GeneCards: IFT88

Пов'язані генетичні захворювання

біполярний афективний розлад, шизофренія, депресія клінічна^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • kinesin binding
Клітинна компонента	• intraciliary transport particle B • цитоплазма • cell projection • ciliary tip • motile cilium • цитоскелет • Центріоль • війка • ciliary basal body • центросома • sperm flagellum • ciliary base • non-motile cilium • центр організації мікротрубочок
Біологічний процес	• regulation of cilium assembly • regulation of autophagosome assembly • cilium assembly • cell projection organization • intraciliary transport involved in cilium assembly • розвиток нирки • inner ear receptor cell stereocilium organization • non-motile cilium assembly • intraciliary transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8100


21821

Ensembl


ENSG00000032742


ENSMUSG00000040040

UniProt


Q13099


Q61371

RefSeq (мРНК)

NM_006531 NM_175605 NM_001318491 NM_001318493 NM_001353565
NM_001353566 NM_001353567 NM_001353568 NM_001353569 NM_001353570 NM_001353571 NM_001353572 NM_001353573 NM_001353574 NM_001353575 NM_001353576 NM_001353577 NM_001353578 NM_001353579


NM_009376

RefSeq (білок)

NP_001305420 NP_001305422 NP_006522 NP_783195 NP_001340494
NP_001340495 NP_001340496 NP_001340497 NP_001340498 NP_001340499 NP_001340500 NP_001340501 NP_001340502 NP_001340503 NP_001340504 NP_001340505 NP_001340506 NP_001340507 NP_001340508

NP_033402 NP_001391322 NP_001391323 NP_001391324 NP_001391325
NP_001391326

Локус (UCSC)

Хр. 13: 20.57 – 20.69 Mb

Хр. 14: 57.66 – 57.76 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

IFT88 (англ. Intraflagellar transport 88) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 833 амінокислот, а молекулярна маса — 94 270^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKFTNTKVQM	MQNVHLAPET	DEDDLYSGYN	DYNPIYDIEE	LENDAAFQQA
VRTSHGRRPP	ITAKISSTAV	TRPIATGYGS	KTSLASSIGR	PMTGAIQDGV
TRPMTAVRAA	GFTKAALRGS	AFDPLSQSRG	PASPLEAKKK	DSPEEKIKQL
EKEVNELVEE	SCIANSCGDL	KLALEKAKDA	GRKERVLVRQ	REQVTTPENI
NLDLTYSVLF	NLASQYSVNE	MYAEALNTYQ	VIVKNKMFSN	AGILKMNMGN
IYLKQRNYSK	AIKFYRMALD	QVPSVNKQMR	IKIMQNIGVT	FIQAGQYSDA
INSYEHIMSM	APNLKAGYNL	TICYFAIGDR	EKMKKAFQKL	ITVPLEIDED
KYISPSDDPH	TNLVTEAIKN	DHLRQMERER	KAMAEKYIMT	SAKLIAPVIE
TSFAAGYDWC	VEVVKASQYV	ELANDLEINK	AVTYLRQKDY	NQAVEILKVL
EKKDSRVKSA	AATNLSALYY	MGKDFAQASS	YADIAVNSDR	YNPAALTNKG
NTVFANGDYE	KAAEFYKEAL	RNDSSCTEAL	YNIGLTYEKL	NRLDEALDCF
LKLHAILRNS	AEVLYQIANI	YELMENPSQA	IEWLMQVVSV	IPTDPQVLSK
LGELYDREGD	KSQAFQYYYE	SYRYFPCNIE	VIEWLGAYYI	DTQFWEKAIQ
YFERASLIQP	TQVKWQLMVA	SCFRRSGNYQ	KALDTYKDTH	RKFPENVECL
RFLVRLCTDL	GLKDAQEYAR	KLKRLEKMKE	IREQRIKSGR	DGSGGSRGKR
EGSASGDSGQ	NYSASSKGER	LSARLRALPG	TNEPYESSSN	KEIDASYVDP
LGPQIERPKT	AAKKRIDEDD	FADEELGDDL	LPE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як біогенез та деградація війок, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних відростках, війках.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з IFT88 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20606 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q13099 (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.